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Esone1introne1esone2introne2esone3 esone1 introne1 esone2 introne2 esone3 SPLICINGSPLICING eliminazione introni unione esoni GT AG.

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1 esone1introne1esone2introne2esone3 esone1 introne1 esone2 introne2 esone3 SPLICINGSPLICING eliminazione introni unione esoni GT AG

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3 Alcuni modo di fare alternative splicing

4 Riconoscimento degli introni Motivi conservati

5 Meccanismo dello splicing

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7 - SnRNPs (Small nuclear ribonuclear proteins) binds critical sites on the pre-mRNA - pronounced SNURPs - these are complexes containing both protein and small RNAs - the small RNAs are transcribed by RNA polymerase III - they then associate with accessory proteins - the complex then recognizes critical sites for splicing by base pairing Particelle dello splicing

8 Particelle che intervengono nello splicing

9 U1 snRNP

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13 Intron definition exon definition

14 Modello di exonic splicing enhancer mediato da proteine SR

15 Modello di exonic splicing silencer

16 Modelli di splicing silencing Nellesone si trovano motivi ESE e ESS sovrapposti, quindi cè una competizione diretta tra i fattori che stimolano lo splicing (SR) e quelli che lo inibiscono (hnRNP). Il legame di uno o dellaltro elemento è mutuamente esclusivo. A questo punto i fattori importanti diventano la maggiore affinità di legame degli elementi regolativi e la concentrazione di questi.

17 Modelli di splicing silencing Fattore inibitori per lo splicing si legano a elementi Intronic Splicing Silencer e per dimerizzazione formano un anello che esclude lesone

18 Modelli di splicing silencing Se non ci sono elementi inibitori lesone viene incluso, se ci sono elementi inibitori e se questi si legano per primi, promuovono il legame di altri elementi inibitori (polimerizzazione) od ostacolano il legame di elementi rafforzativi

19 Nonsense mediated decay

20 Why Splicing? 1. The intron-exon arrangement may facilitate the evolution of new proteins through recombination of exons.

21 2. Splicing increases the coding potential of the genome through alternative splicing. 60% of transcripts in human are spliced in different ways. Cell-type spcific splicing of fibronectin pre-mRNA

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