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Involucro proteico del fago T2 circondato dal suo DNA.

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Presentazione sul tema: "Involucro proteico del fago T2 circondato dal suo DNA."— Transcript della presentazione:

1 Involucro proteico del fago T2 circondato dal suo DNA

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3 Lunghezza del DNA di E.coli Paragonata alla cellula

4 Il DNA di una cellula di E.coli lisata

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6 Una singola cellula umana contiene 2m di DNA, un singolo cromosoma Circa 4,5cm. L’intero corpo umano ha DNA per Coprire 1000 volte la distanza Terra-sole

7 Oltre al DNA nucleare c’e’ il DNA mitocondriale Che codifica per alcune proteine e RNA mitocondriali

8 Una torsione sull’asse della molecola di DNA genera un superavvolgimento

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13 rilassato Lk = coppie basi/coppie basi per giro 2100nt

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15 Un parziale disavvolgimento del DNA puo’ facilitare la formazione di strutture cruciformi in corrispondenza di sequenze palindrome

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17 Meccanismo di azione della topoisomerasi II (DNA girasi).

18 Superavvolgimento Plectonemico

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21 Superavvolgimento Plectonemico e a solenoide Disegnati con la stessa scala

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34 Cromosoma umano parzialmente srotolato.

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38 50.000:1 Lunghezza del cromosoma sezione della cromatina 5 avvolgimenti della doppia elica fibra di 30nm con i nucleosomi strettamente impacchettati parte di una sezione di cromosoma sezione condensata di un cromosoma metafasico cromosoma metafasico 2nm 11nm 30nm 300nm 700nm 1400nm

39 Organizzazione del cromosoma I spiralizati parzialmente despiralizati struttura della cromatina nucleosoma istoni H2A H2B H3H4 H3 H2A H4 H2B doppia elica di DNA DNA istone H1

40 TELOMERO CENTROMERO (COSTRIZIONE PRIMARIA) COSTRIZIONE SECONDARIA Costituenti del cromosoma

41 Centromero DNA satellite Fibre del fuso dominio centrale dominio di appaiamento dominio del cinetocore

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45  ESSENZIALI NELLA STABILITA’ DEI CROMOSOMI *COMPOSTI DA ETEROCROMATINA * HANNO UNA SEQUENZA COMUNE ( in uomo TTAGGG) Telomeri

46 Telomeri FISH

47 La cromatina si distingue in: * eucromatina * eterocromatina facoltativa costitutiva Cromatina I

48 Metilazione del DNA Nei vertebrati la metilazione interessa solamente la Citosina sul dinucleotide CpG : l’enzima citosina metiltransferasi aggiunge un gruppo metile al C 5 della citosina:il risultato è la 5- metilcitosina. Human Molecular Genetics 2

49 Metilazione del DNA Le sequenze CpG sono sotto-rappresentate nel genoma (probabilmente per la tendenza della 5- metilcitosina a venire deaminata e mutata in T) ma abbondanti nelle regioni promotrici dei geni

50 In cellule non embrionali, 80% dei CpG sono metilati, ad eccezione delle isole CpG dei promotori Dnmt1 ha particolare affinità per le sequenze emi- metilate: tende quindi a metilare il nuovo filamento che si è formato su uno stampo metilato- > mantenimento del pattern di metilazione

51 Fasi di metilazione: Metilazione differenziale de novo (Dnmt3a e Dnmt3b); Demetilazione (natura sconosciuta delle demetilasi); Mantenimento della metilazione e trasmissione alle cellule figlie (Dnmt1).

52 Le principali funzioni della metilazione sono collegate alla repressione della trascrizione: Difesa contro i trasposoni: la metilazione e’ fondamentale per mantenere silenti i genomi dei trasposoni e dei retrotrasposoni Regolazione genica: la metilazione contribuisce a stabilire e mantenere uno stato trascrizionalmente inattivo (eterocromatina)

53 CH 3 MeCP2 Repres. Corepressori HDAC 1 HDAC 2 Deacetilazione delle lisine di H3 e H4

54 Metilazione e regolazione genica: Dnmt metilano il DNA Il DNA metilato è legato da proteine che legano il metile (MeCP2, MBD1-4) Queste a loro volta sono in grado di reclutare diversi HDAC -> repressione della trascrizione

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56 Modificazioni epigenetiche: Modificazioni ereditabili che non alterano la sequenza nucleotidica dei geni ma ne alterano l’attivita’: –Acetilazione degli istoni della cromatina –Metilazione del DNA


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