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LE BANCHE DATI ONLINE Gaetano Grillo Biblioteca Rosmini dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie Didattica Integrativa Canale A Torino, 7 ottobre 2008.

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1 LE BANCHE DATI ONLINE Gaetano Grillo Biblioteca Rosmini dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie Didattica Integrativa Canale A Torino, 7 ottobre 2008

2 Breve introduzione Medline (OVID) Cinahl (OVID) Embase (OVID) Il Programma di oggi

3 Le esigenze informative di partenza - Tenermi aggiornato su un argomento? - Tesi di laurea o altro lavoro scientifico? - Relazione per un esame? - Descrizione o gestione di casi clinici? - Relazione sulla propria attività o su quella del reparto? - altro… ?

4 I tipi di documento: -libri monografici (trattati, manuali, raccolte di saggi) - periodiciperiodici - linee guidalinee guida - atti di congressiatti di congressi - immagini (fisse e in movimento) - documenti multimediali altro...?

5 I formati possono essere: -Cartacei - elettronici con accesso locale (CD- ROM, Floppy disk, …) - elettronici con accesso remoto (CD- ROM in rete, siti Internet, fulltext online)

6 Strumenti di ricerca - Database bibliograficiDatabase bibliografici - CataloghiCataloghi - Subject gatewaysSubject gateways - Motori di ricercaMotori di ricerca - Mailing list e rispettivi archiviMailing list e rispettivi archivi - Forum di discussioneForum di discussione - Siti di associazioni professionaliSiti di associazioni professionali

7 Le fonti per la ricerca bibliografica online in ambito biomedico:

8 I database: definizione La gestione dellinformazione è lo scopo principale di un databasedatabase Esso è un insieme di descrizioni standard, strutturate e organizzate, accessibile all'utenza attraverso interfacce che ne permettano l'interrogazione e il recupero di dati

9 Una tabella di database Sono visibili i campi (colonne) in verticale e i record (righe) in orizzontale

10 Relazione tra tabelle Esempio di database relazionale, in cui le tabelle sono collegate tra loro

11 Ricercare in un database bibliografico Vanno distinti: - la struttura del database - il software di IR (= information retrieval, recupero dellinformazione)

12 Struttura del record o citazione bibliografica (che deriva dallo spoglio di articoli di riviste prese in considerazione dal database) campi Cosa sono i database bibliografici? In un database bibliografico i dati sono divisi in campi e record. Per ogni articolo viene prodotta una citazione bibliografica che comprende una serie di elementi (metadati). Questi riferimenti bibliografici sono relativi alla letteratura biomedica (prevalentemente periodici)

13 MEDLINE: La NLM

14 MEDLINE è la più importante banca dati bibliografica mondiale di argomento biomedico e contiene citazioni e abstract di più di 5000 riviste biomediche (in 37 lingue) pubblicate negli Stati Uniti e in altri 80 paesi MEDLINE è la più importante banca dati bibliografica mondiale di argomento biomedico e contiene citazioni e abstract di più di 5000 riviste biomediche (in 37 lingue) pubblicate negli Stati Uniti e in altri 80 paesiMEDLINE Prodotto dalla National Library of Medicine in lingua inglese e contiene argomenti di medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria … Prodotto dalla National Library of Medicine in lingua inglese e contiene argomenti di medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria …National Library of Medicine National Library of Medicine Contiene oltre di riferimenti bibliografici di articoli pubblicati su riviste dal 1950 a oggi Contiene oltre di riferimenti bibliografici di articoli pubblicati su riviste dal 1950 a oggi Aggiornamento quotidiano Aggiornamento quotidiano E gratuita tramite linterfaccia di Pubmed dal 1997 E gratuita tramite linterfaccia di Pubmed dal 1997

15 Caratteristiche di MEDLINE 1 Lingua dinterrogazione è linglese, anche per reperire riferimenti ad articoli pubblicati in lingue diverse (il titolo dellarticolo, in questi casi, è tradotto in inglese) Lingua dinterrogazione è linglese, anche per reperire riferimenti ad articoli pubblicati in lingue diverse (il titolo dellarticolo, in questi casi, è tradotto in inglese) Presenza di abstract: tutti i riassunti presenti sono in inglese, indipendentemente dalla lingua in cui è scritto larticolo Presenza di abstract: tutti i riassunti presenti sono in inglese, indipendentemente dalla lingua in cui è scritto larticolo Frequenza di aggiornamento? Quotidiana; ogni giorno vengono aggiunti 2000 – 4000 nuovi record. Nel 2007, ne sono stati aggiunti Frequenza di aggiornamento? Quotidiana; ogni giorno vengono aggiunti 2000 – 4000 nuovi record. Nel 2007, ne sono stati aggiunti

16 Caratteristiche di MEDLINE 2 Tipo di documenti indicizzati: articoli di rivista (gli atti di congresso compaiono solo se pubblicati su riviste). Tipo di documenti indicizzati: articoli di rivista (gli atti di congresso compaiono solo se pubblicati su riviste). Copertura geografica: circa il 50% degli articoli appartiene a riviste pubblicate negli Stati Uniti, il restante 50% a riviste pubblicate in 80 altri Paesi Copertura geografica: circa il 50% degli articoli appartiene a riviste pubblicate negli Stati Uniti, il restante 50% a riviste pubblicate in 80 altri Paesi Copertura linguistica: il 78% degli articoli indicizzati in MEDLINE è scritto in lingua inglese, ma questa percentuale sale all89% per gli articoli inseriti tra 2000 e 2003 Copertura linguistica: il 78% degli articoli indicizzati in MEDLINE è scritto in lingua inglese, ma questa percentuale sale all89% per gli articoli inseriti tra 2000 e 2003

17 Caratteristiche di MEDLINE 3 Quali tipi di studio si trovano? Tendenzialmente tutti quelli pubblicati sulle riviste Tendenzialmente tutti quelli pubblicati sulle riviste : lettere che esprimono opinioni report di casi singoli o di più casi studi qualitativi sperimentazioni non controllate studi di eziologia, studi prospettici sperimentazioni precliniche e cliniche controllate: studi caso-controllo, sperimentazioni randomizzate controllate, ecc. Revisioni narrative e sistematiche Linee guida

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19 Esistono diverse piattaforme per interrogare il database MEDLINE: Gratuite : Entrez PUBMEDEntrez PUBMED A pagamento: OVIDOVID In OVID e in PUBMED sono interrogabili anche altre banche dati. OVID è accessibile da tutti i PC aziendali e universitari Da casa: tramite il proxy (Nome utente e password sono gli stessi usati per l'accesso al servizo di posta elettronica dell'Ateneo) proxy

20 accesso alle banche dati dal sito della biblioteca Rosmini accesso alle banche dati dal sito della biblioteca Rosminibiblioteca Rosminibiblioteca Rosmini accesso alle banche dati dal sito della facoltà di Medicina e chirurgia accesso alle banche dati dal sito della facoltà di Medicina e chirurgiafacoltà di Medicina e chirurgiafacoltà di Medicina e chirurgia accesso alle banche dati da casa tramite proxy università accesso alle banche dati da casa tramite proxy universitàproxy universitàproxy università

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24 Varie sezioni di Medline

25 Ricerca di base Finestra di ricerca di base Come ritrovare un articolo, un autore… Entro nel tesauro Ricerco tra i vari campi del record Avvio la ricerca Vado in ricerca avanzata

26 autore (fino a 25 cognomi); titolo dell'articolo fonte bibliografica (titolo della rivista, volume, fascicolo, pagine, anno, mese) descrittori di soggetto (MeSH) Struttura di una citazione: alcuni elementi Riassunto del documento

27 Struttura di una citazione: alcuni elementi tipo di pubblicazione (ad es. lettera, editoriale, rassegna). lingua originale in cui l'articolo è stato pubblicato

28 I descrittori di soggetto: I MeSH, ("Medical Subject Headings") MESHMESH è l'acronimo di Medical Subject Headings, ovvero intestazioni di soggetto per la medicina e servono ad identificare i termini più appropriati per la ricerca. Ne esistono circa 24,767 (ott. 2007) e sono scelti da specialisti di ogni area della biomedicina.

29 Lalbero MeSH Si tratta di un tesauro … (Thesaurus = vocabolario controllato). I suoi descrittori fanno parte di una struttura gerarchica che permette di ricercare a vari livelli di specificità. Termine del MeSH (descrittore di soggetto) Breve descrizione Breve descrizione del termine MeSH i termini sono disposti in una gerarchia ad albero, in cui i broader terms (termini più generali) contengono inarrower terms, termini più ristretti) broader terms narrower terms

30 I MeSH, ("Medical Subject Headings") Breve descrizione del MeSH che permette di valutare la scelta Gli articoli sono indicizzati utilizzando questo tesauro e quindi: i termini sono in forma normalizzata (tutti i sinonimi sono ricondotti ad un unico termine accettato. Es: ulcer, pressure – bed sore – decubitus ulcer – sore pressure – sore, pressure …Pressure ulcer)

31 i termini sono collegati con una rete di rinvii. In particolare: vedi: rinvio da voce non accettata a voce accettata: es.: diseases, skin vedi Skin Diseases oppure Vedi anche: per i termini, entrambi accettati, che hanno una relazione importante. es.: Skin Diseases vedi anche Dermatologic Agents / Skin Manifestations

32 Conoscere la struttura dei MeSH può essere molto utile per elaborare una ricerca efficace Le 16 categorie principali del MeSH : 1. Anatomy [A] 2. Organisms [B] 3. Diseases [C] 4. Chemicals and Drugs [D] 5. Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment [E] 6. Psychiatry and Psychology [F] 7. Biological Sciences [G] 8. Natural Sciences [H] 9. Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena [I] 10. Technology, Industry, Agriculture [J] 11. Humanities [K] 12. Information Science [L] 13. Named Group [M] 14. Health Care [N] 15. Publication Characteristics [V] 16. Geographicals [Z] Categoria principale MeSH relativo

33 I MeSH non sono disponibili su: premedline record as supplied by publisher I MeSH non vengono creati per argomenti che ricorrono raramente I MeSH non esistono ancora per i termini nuovi N.B. In tutti questi casi usare la ricerca libera con operatori logici. I MeSH : accorgimenti RIASSUMENDO: Ogni articolo indicizzato riceve un certo numero di descrittori MeSH che definiscono il suo intero contenuto semantico. Alcune voci di soggetto hanno una particolare rilevanza (indicate, nei record bibliografici, con l'asterisco (*)). Queste voci si ricercano specificando come qualificatore [MAJR] (Focus).

34 PRIMA DI INIZIARE LA RICERCA FORMULARE IL QUESITO USANDO IL PICO Patient group(s) (paziente) Il quesito riguarda chi o che cosa (problema)? Intervention (intervento) Che cosa è stato fatto o succede ai pazienti? Comparison(s) (comparazione) Che cosa potrebbe essere fatto in alternativa? Outcome(s) (esito) Come influisce lintervento sulla popolazione/pazienti?

35 ricerca di base Inserisco una o più parole libere per la ricerca Storia e risultati della ricerca

36 Posso utilizzare i risultati per trovare una citazione vicina al mio argomento di ricerca e poi andare in ricerca avanzata per cercare i termini (descrittori di soggetto) che trovo nel campo dei Meshricerca avanzata

37 Oppure ….. inserisco sempre la stessa parola libera e il DB mi suggerirà un termine del tesauro dei Meshtesauro dei Mesh Ricerca avanzata

38 il DB suggerisce a quali termini MeSH si lega, e seleziono il termine che mi interessa Parola libera inserita

39 Lalbero MeSH

40 I SUBHEADINGS Le "sotto-intestazioni" rappresentano un aspetto particolare del singolo descrittore MeSH a cui si applicano. Sono utili per rendere efficace una strategia di ricerca. Se cerchiamo, ad esempio, una sostanza farmacologica, potremmo essere interessati a circoscrivere i risultati della ricerca all'aspetto tossicologico, oppure agli effetti collaterali, al suo uso diagnostico o terapeutico, al suo assorbimento e metabolizzazione da parte dell'organismo, agli avvelenamenti, alla posologia, e via dicendo. Non tutti i subheadings sono applicabili a tutti i MESH

41 Possiamo restringere i risultati della nostra ricerca utilizzando il bottone dei limitilimiti

42 i Limits: come limitare una ricerca Normalmente conviene sempre partire da una ricerca più ampia e poi restringerla con laiuto dei limiti, ad es. : per gruppi detà (attenzione alle definizioni!) per data di pubblicazione dellarticolo per data dinserimento del record nel database (Entrez date, per le novità) Scelta limiti veloce, es: solo Full Text Scelta limiti metodologicilimiti metodologici

43 I limiti metodologici Possono indicare il tipo di pubblicazione, ad es.: Clinical Trial Editorial Randomized Controlled Trial Servono a individuare il livello di evidenza presentato in uno studio

44 Ottenuto il risultato della ricerca posso salvare le citazioni attraverso il Results ManagerResults Manager

45 Posso salvare i records selezionati o tutti Posso scegliere quali campi del record salvare Includere la storia della ricerca e salvare tutte le citazioni bibliografiche in formato testo

46 Luso degli operatori boleani: AND, OR, NOT Per una buona strategia di ricerca utilizzando i MeSH è necessario luso metodico degli operatori logici boleani. La combinazione di AND, OR e NOT per associare più termini nella stessa ricerca, permette di risolvere il problema dei risultati con troppi record (è sbagliata lidea che tanti articoli recuperati equivalgano ad una buona ricerca) Per comprendere l'"algebra" booleana (AND, OR e NOT) si tengano presenti le seguenti relazioni grafiche: L'AND "restringe" l'insieme ai risultati comuni ad un secondo insieme a AND b

47 l'OR lo "allarga" sommandovi il secondo insieme a OR b il NOT elimina dal primo quanto appartiene anche al secondo a NOT b In pratica: lAND equivale ad un'intersezione; l'OR ad una sommatoria; il NOT ad una sottrazione.

48 CINAHL CINAHL : che cosa contiene?

49 CINAHL Il Cumulative Index to Nursing & Allied Health è un database comprendente riferimenti bibliografici da pubblicazioni appartenenti alle discipline infermieristiche e alle scienze alleate Le varie specialità dellinfermieristica: Chirurgia Chirurgia plastica Fisioterapia e riabilitazione Gastroenterologia Ginecologia Nutrizione e dietetica Oncologia Discipline collaterali: Assistenza medica Optometria Pediatria Pronto soccorso Servizio sociale nella cura della salute Tecnica radiologica Terapia occupazionale Tecnica chirurgica Ricorda: Ogni DB presente in OVID ha la stessa interfaccia di interrogazione

50 CINAHL: : un po di storia E tra i più vecchi e completi repertori bibliografici delle scienze infermieristiche Prodotto dallAmerican Nurses Association e dalla National League for nursing Nato nel 1961 (indicizzando 35 periodici) con il nome di CINL vede la sua veste definitiva nel 1977, integrato con la letteratura di discipline collaterali

51 CINAHL: contenuti Copertura temporale: dal 1982 in poi Copertura geografica: Africa, Asia, Australia, Canada, Europa, Sud America, Regno Unito e Irlanda, Stati Uniti Indicizza 2,593 riviste, di cui 1,798 includono il riassunto dellautore; cita inoltre: tesi, linee guida (a volte in testo completo), atti di congressi, materiali audiovisivi, software e libri Sono presenti 1,328,745 record (dato dic. 2006) Il database è indicizzato con un tesauro. Il 70% del CINAHL subject headings (12,414 ) corrisponde ai MeSH del MEDLINE; gli altri termini sono specifici per linfermieristica e le scienze alleate

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53 Inserisco sempre la parola libera e il DB mi suggerirà un termine del tesauro di CINAHL

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60 Dal 1/1/2009 CINAHL, la banca dati per le scienze infermieristiche attualmente consultabile attraverso OVID, migrerà su una nuova piattaforma gestita da EBSCOEBSCO In previsione di tale cambiamento è stato attivato, fino al 31/12/2008, un trial sulla versione "base" e su quella "Plus" della banca dati. Laccesso è disponibile collegandosi, da tutti gli IP di Ateneo, all'indirizzo:

61 EmbaseEmbase: che cosa contiene? Banca Dati bibliografica che copre i settori della medicina, con particolare riguardo alla farmacologia e alla tossicologia Piú di records a partire dal 1974 (nella versione OVID dal 1988) Indicizza 5000 riviste, di prevalenza europea aggiornamenti giornalieri Europa Thesauro: EMTREE (52,500 termini) A pagamento

62 Paragone tra EMTREE e MeSH

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64 LA COCHRANE LIBRARY E GLI STRUMENTI PER IL RECUPERO DELLINFORMAZIONE Gaetano Grillo Biblioteca Rosmini dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie Didattica Integrativa Canale A Torino, 14 ottobre 2008

65 The Cochrane Library (OVID) Le linee guida E-BOOKS I Cataloghi I Periodici elettronici Le risorse in Internet Il Programma di oggi

66 The Cochrane Library La Cochrane Library é una pubblicazione elettronica finalizzata a rendere disponibile la migliore evidenza per le domande terapeutiche.Cochrane Library E il principale prodotto della Cochrane Collaboration e raccoglie tutte le sue revisioni sistematiche (RS) prodotte ed i protocolli delle revisioni in corso. Si tratta di un'efficiente e valida fonte di informazione per professionisti impegnati in scelte di governo clinico, utili nell'orientare le attività mediche ed infermieristiche, nell'educazione continua e nell'organizzazione dei servizi

67 Cochrane Database of Systematic Reviews (Cochrane Reviews) Le revisioni Cochrane sono esclusivamente revisioni di studi clinici randomizzati, identificati su tutte le più importanti riviste mediche pubblicate nelle diverse lingue. Linclusione o lesclusione degli studi è basata su espliciti criteri di qualità in modo da ridurre gli errori sistematici. Total Records 5171 Spesso i dati vengono combinati statisticamente (con le meta-analisi) per raggiungere risultati più affidabili ( a volte i singoli studi includono casistiche troppo piccole). Nuove revisioni sono rese disponibili ad ogni edizione della Cochrane Library con l'obiettivo finale di coprire tutte le aree della assistenza sanitaria.

68 Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness (DARE) Il DARE contiene 5758 abstract strutturati di revisioni sistematiche pubblicate sulle maggiori riviste mediche e analizzate qualitativamente da esperti del NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York, Inghilterra. Total Records 7048 E una bibliografia di trial clinici identificati dai membri della Cochrane Collaboration tramite la ricerca manuale delle riviste biomediche internazionali. Lo scopo finale è creare una banca dati esaustiva degli studi clinici controllati. CENTRAL si basa sull'esame sistematico di atti dei congressi e su molte altre fonti non incluse in MEDLINE o in altre banche bibliografiche. Total Records 527,885 The Cochrane Centre Register of Controlled Trials (CENTRAL)

69 Health Technology Assessment Database (HTA) Questa banca dati, prodotta dal NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York, raccoglie informazioni in merito a studi internazionali di health technology assessment. Contiene record riferibili a studi già completati o in corso. I riassunti provengono dallInternational Network of Agencies for Health Technology Assessment (INAHTA) ed hanno un carattere più descrittivo che analitico. Non riportano valutazioni critiche del contenuto. Total Records 7177 L NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York produce questa banca dati di riassunti sulla valutazione economica degli interventi sanitari.. Total Records 22,978 NHS Economic Evaluation Database (NHS EDD)

70 Un po di storia 1972 Archie Cochrane (Epidemiologo) sosteneva limportanza di creare un registro centrale internazionale di studi clinici in particolare quelli Randomizzati, i soli che erano il più possibile esenti da bias. Egli scriveva:E' davvero una critica giusta quella che viene fatta alla nostra professione, di non aver organizzato un sommario critico, specialità per specialità, aggiornato periodicamente, di tutti gli Studi Randomizzati Controllati rilevanti. Alcuni anni dopo la sua morte questa riflessione portò alla creazione della Cochrane Collaboration

71 La Cochrane Collaboration é una rete internazionale di scienziati e medici. Il fine di questa istituzione é di produrre revisioni sistematiche per poter valutare terapie, tenerle aggiornate e diffonderleCochrane Collaboration La Cochrane Collaboration è un organizzazione senza scopo di lucro Le revisioni vengono prodotte da diversi gruppi di revisione Esempi di gruppi di revisione Anaesthesia Group Back Group Bone, Joint and Muscle Trauma Group Breast Cancer Group Childhood Cancer Group Colorectal Cancer Group Consumers and Communication Group Cystic Fibrosis and Genetic Disorders Group Dementia and Cognitive Improvement Group Depression, Anxiety and Neurosis Group Developmental, Psychosocial and Learning Problems Group Drugs and Alcohol Group

72 Medline (in OVID) CINAHL (in OVID) EMBASE (in OVID) CHOCHRANE LIBRARY (in OVID) dal dal dal riviste2.600 riviste5.000 rivisteFonti diverse angloamericanainternazionaleeuropeainternazionale MeSHCINAHL headingsEMTREE keywords Parola libera Articoli di rivisteArticoli di riviste, libri, tesi, audiovisivi Articoli di riviste Revisioni sistematiche, studi clinici Biomedicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria Infermieristica e scienze affini Biomedicina, farmaci e farmacologia Terapie

73 Linee Guida per la pratica clinica: E un database di linee guida americane Tutte hanno un abstract strutturato Di alcune esiste anche il full text Una certa quantità *non* si trova in PubMed (non sono pubblicate su riviste) Navigabili per: Disease/Condition Treatment/Intervention Organization Usare la detailed search Altre risorse: NELH's Guidelinesfinder (FT gratuito)NELH's Guidelinesfinder Programma Nazionale Linee Guida NGC - National Guideline Clearinghhouse

74 OVID: manuali online In OVID ho la possibilità di accedere a 41 libri in versione elettronica, di cui 22 hanno pertinenza infermieristiche

75 OVID: manuali online In OVID ho la possibilità di accedere a 41 libri in versione elettronica, di cui 22 hanno pertinenza infermieristiche41 libri in versione elettronica

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78 I cataloghi delle biblioteche Come recuperare la documentazione scientifica selezionata? Nei cataloghi cartacei e in linea delle biblioteche biomediche trovo principalmente i riferimenti bibliografici a libri, periodici cartacei ed elettronici. Attraverso il sito della Biblioteca del Rosmini accesso a: Catalogo periodici della Biblioteca del Rosmini Catalogo periodici Biblioteche biomediche Università di Torino (OCAP inCatalogo periodici Biblioteche biomediche Università di Torino dismissione) (per le riviste disponibili in formato elettronico dellAteneo di Catalogo periodici e dei libri delle Biblioteche dAteneo di Torino

79 I cataloghi delle biblioteche Ulteriori strumenti di recupero dellinformazione: CATALOGO ITALIANO DEI PERIODICI (ACNP) LibrinLineaLibrinLinea (SBN - Catalogo collettivo delle biblioteche della Regione Piemonte) SBN-ONLINE SBN-ONLINE Catalogo collettivo delle biblioteche nazionale

80 I Periodici elettronici Il periodico elettronico, in alternativa al formato cartaceo, fornisce il testo completo di un documento (solitamente per leggere a video un articolo è preferibile usare il formato HTML e per la stampa il formato PDF) Strumento utile per reperire i loro siti è la lista alfabetica del PEB (Periodici Elettronici Biomedici) creata da bibliotecari biomediciPEB

81 I Periodici elettronici Possibilità daccesso al full-text (testo integrale): Gratuita es.: BMJ (Vedi lista dei periodici elettronici biomedici ad accesso gratuito Free Medical Journal )Free Medical Journal A pagamento con licenza o abbonamento: Nella nostra realtà istituzionale, le riviste elettroniche biomediche (e non) dellAteneo di Torino (le licenze con gli editori)* sono disponibili in e solo per le riviste biomediche (fino a giugno 2008) in OCAP biomediche OCAP *Per accedere ai FT dei periodici elettronici occorre andare in biblioteca, oppure consultarli dai computer dellUniversità e delle Molinette (solo accesso al testo integrale di OVID FULL TEXT) oppure da casa tramite l uso del servizio Off Campus LibraryOVID FULL TEXTOff Campus Library

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85 RISORSE INTERNET SELEZIONATE Le risorse di PREFERITO PREFERITO coprono anche i siti infermieristici selezionati dalla biblioteca del Rosmini.


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