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POSTGENOMICA O GENOMICA FUNZIONALE Analisi della sequenza genomica per identificare geni, sequenze di controllo, e tutti gli altri elementi che contribuiscono.

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Presentazione sul tema: "POSTGENOMICA O GENOMICA FUNZIONALE Analisi della sequenza genomica per identificare geni, sequenze di controllo, e tutti gli altri elementi che contribuiscono."— Transcript della presentazione:

1 POSTGENOMICA O GENOMICA FUNZIONALE Analisi della sequenza genomica per identificare geni, sequenze di controllo, e tutti gli altri elementi che contribuiscono all’espressione del genoma nel suo insieme e di geni specifici Studio del trascrittoma: studio dei trascritti di una cellula per comprendere lo schema di espressione del genoma nel suo insieme Tecnica: microarray di espressione Studio della variabilità cellulare dell’espressione genica Tecnica: PCR quantitativa (RealTime PCR) Studio del proteoma: studio del contenuto proteico di una cellula per comprendere tutte le sue capacità biochimiche Tecnica: microarray di proteine

2 - Deposizione su vetrino di materiale particolare di microscopiche gocce (intera libreria di cDNA) (“stampa”). Assetto ordinato in griglie. - Campione: estrazione di RNA cellulare, conversione a cDNA, marcatura con fluorescenza - Ibridazione ed esame microarray un tipo cellulare secondo tipo cellulare Analisi di una libreria di cDNA attraverso microarray

3 Studio del trascrittoma attraverso microarray con cDNA controllo Esperimento: trattamento farmaco Esempio: valutazione dell’espressione genica nel campione sperimentale Esperimento Es: trattamento farmaco Immagine combinata

4 Studio del trascrittoma attraverso microarray con DNA

5 Studio del trascrittoma attraverso chip DNA Microarray ad alta densità con oligo sintetizzati in superficie (1 milione/cm 2 ); Uno o più oligo corrispondono ad un DNA espresso

6 Chip con 1046 cDNA Chip con oligonucleotidi rappresentante 1641 geni


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