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Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005.

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Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005 La replicazione del DNA La struttura a doppia elica, con 2 filamenti.

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4 RNA polymerases RNA polymerase I synthesizes rRNA in the nucleolus. RNA polymerase II synthesizes mRNA in the nucleoplasm. RNA polymerase III synthesizes small RNAs in the nucleoplasm. All eukaryotic RNA polymerases have ~12 subunits and are aggregates of >500 kD. Some subunits are common to all three RNA polymerases. The largest subunit in RNA polymerase II has a CTD (carboxy- terminal domain) consisting of multiple repeats of an eptamer.

5 U6 Promotori della pol III

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9 ETS 18S ITS 28SNTS RNA DNA gene promoter 60/81 bp repeats spacer promoter other repetitive elements 60/81 bp repeats spacer promoter DNA RNA I geni per gli rRNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici

10 I precursori degli rRNA sono piu' lunghi della somma degli rRNA maturi

11 rRNA genes Ribosomal RNA is coded by a large number of identical genes that are tandemly repeated to form a cluster(s). Each rDNA cluster is organized so that transcription units giving a joint precursor to the major rRNAs alternate with nontranscribed spacers.

12 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

13 Il complesso d'inizio della pol I

14 UBF: inizio, allungamento SL1: inizio TIF-1A (RRN3): inizio TTF-1: terminazione

15 Regolazione della sintesi dell'rRNA

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17 Chemioterapici inibiscono la sintesi dell'rRNA

18 Gene reporter

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22 I promotori eucariotici sono costituiti da una associazione variabile di box OttameroCAATGC SV40 (promotore precoce) Timidina kinasi Istone H2B

23 Esempi di box di promotori eucariotici

24 Agente regolatore Modulo ConsensusFattore Grandezza (dalton) Shock termico Glucocorticoidi Cadmio TPA Siero HSE GRE MRE TRE SRE CNNGCCNNTCCNNG TGGTACAAATGTTCT CGNCCCGGNCNC TGACTCA CCATATTAGG HSTF Recettore ? AP1 SRF 93,000 94,000 ? 39,000 52,000 Esempi di box del tipo elemento di risposta

25 Esempio di promotore

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28 Enhancers Similar sequence elements are found in enhancers and promoters. Enhancers form complexes of transcription factors that interact directly or indirectly with the promoter.

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35 Ruolo degli Isolatori

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40 LCR and insulators An LCR is located at the 5 end of the domain and consists of several hypersensitive sites. Insulators are specialized chromatin structures that have hypersensitive sites. All known insulators are able to block passage of any activating or inactivating effects from enhancers, silencers, or LCRs. In some cases, insulators have directionality, and may stop passage of effects in one direction but not the other.


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