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Modello dellorganizzazione ad anse nel nucleoide batterico ©G.Micheli 2001 12.

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Presentazione sul tema: "Modello dellorganizzazione ad anse nel nucleoide batterico ©G.Micheli 2001 12."— Transcript della presentazione:

1 Modello dellorganizzazione ad anse nel nucleoide batterico ©G.Micheli

2 Ancoraggi nel nucleoide batterico ©G.Micheli 2001 Componenti degli ancoraggi: RNA? -1) in vivo lRNA nascente si osserva solo alla periferia del nucleoide +2) in vitro lRNasi rilassa il nucleoide (aumento di viscosità, diminuzione del coeff.di sedimentaz.) +3) Gli inbitori della trascrizione non influenzano il numero di domini cromosomici, ma i nucleoidi si rilassano più facilmente Parete -Membrana? (replicazione) Proteine istone-simili? (HU, H-NS, …) DNA ancorato? Rilevanza funzionale in vivo? 13 a,b,c

3 Le principali proteine istone-simili del nucleoide batterico ©G.Micheli 2001 CaratteristicheStruttura pm (kDa) GeniFunzioni HU basica molto abbondante copie/cellula nessun consenso eterodimero HU HU hupA (90.4 min) hupB (9.9 min) compatta il DNA in strutture nucleosoma-simili induce curvatura nel DNA riconosce DNA curvo interviene nella ricombinazione generale H-NS histone-like nucleoid structuring protein neutra aumenta in fase stazionaria copie/cellula nesun consenso omodimero2 x 15.5hns (27.8 min) induce curvatura nel DNA riconosce DNA curvo è un repressore trascrizionale influenza la ricombinazione IHF integration Host Factor basica aumenta in funzione del ciclo cellulare 5-10 volte meno abbondante di HU debole specificità di sequenza (YA 2 N 4 T 2 GATW) eterodimero IHF IHF himA (38.6 min) himD (25 min) induce forte curvatura (fino a 140°) nel DNA interviene nella ricombinazone sito-specifica e nella trasposizione FIS Factor for inversion stimulation basica abbondante in fase esponenziale copie/cellula scarsa specificità di sequenza (KN 2 YRN 2 WN 2 YRN 2 M) omodimero2 x 11.5fis (73.4 min) induce curvatura (fino a 90°) nel DNA è un regolatore trascrizionale interviene nella ricombinazone sito-specifica e nella trasposizione 14bis


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