BIOINFO3 - Lezione 271 PATH DEL FILE Bisogna fare molta attenzione al path del file da aprire. Per non sbagliare converrebbe passare sempre il path assoluto del file. Se si passa invece solo il nome, senza il path completo bisogna essere sicuri che il file cercato si trovi nella directory corrente, da cui è lanciato il programma. Se ad esempio lanciamo il programma da unaltra directory (facendo cd.. ci spostiamo alla directory superiore) ecco che il comando di open fallisce non trovando il file nella directory corrente (/home/nicola/ Addirittura fallisce anche la richiesta di esecuzione del programma, che non viene trovato nella directory /home/nicola

BIOINFO3 - Lezione 272 TEST SUI FILE In un programma Perl si possono fare direttamente dei semplici test sui file, ad esempio per verificarne lesistenza o il tipo. Si può inserire il test in una istruzione if per aprire il file solo se questo esiste -e filename Vero se il file di nome filename esiste -d filename Vero se il file di nome filename è una directory -z filename Vero se il file di nome filename è vuoto (dimensione 0) -s filename Restituisce la dimensione del file di nome filename -r filename Vero se il file di nome filename è leggibile -w filename Vero se il file di nome filename è scrivibile

BIOINFO3 - Lezione 273 DIRECTORY Le directory sono dei file che contengono nomi di file. In pratica possiamo pensarle come dei contenitori di file. Perl permette di aprire e leggere una directory in modo simile a quanto avviene per i file opendir(HANDLE,nome-directory) Apre la directory specificata, associandola ad un HANDLE readdir (HANDLE) Ogni volta che viene chiamata, questa funzione restituisce il nome del file successivo nella directory. Restituisce FALSO quando ha esaurito lelenco dei file prova.pl test.pl array.pl...

BIOINFO3 - Lezione 274 DIRECTORY Esempio esecuzione PRIMO CICLO $d=<>=frerfref\n $d=frerfref -e $d = -e frerfref FALSO print file inesistente SECONDO CICLO $d=<>=numeri\n $d=numeri -e $d = -e numeri VERO -d $d = -d numeri FALSO print non directory Esempio. Stampare il nome dei file di una directory letta da input

BIOINFO3 - Lezione 275 DIRECTORY TERZO CICLO $d==<>=bioinfo3\n $d=bioinfo3 -e $d = -e bioinfo3 VERO -d $d = -d bioinfo3 VERO print la dir. contiene Con la opendir D diventa una handle per la directory bioinfo3. Quindi si inizia a ciclare su tutti i file della directory Ad ogni ciclo $f riceve dalla funzione readdir il nome di un file della directory, che viene stampato. Notare che anche i file. e.. sono ricevuti

BIOINFO3 - Lezione 276 OPERAZIONI SU FILE Perl offre anche delle funzioni equivalenti ai comandi di sistema UNIX relativi alla gestione dei file (creazione e cancellazione di directory, cancellazione di file, ecc…) chdir directory cambia la directory corrente (come cd di UNIX) rmdir directory cancella la directory indicata mkdir (directory,modo) Crea una directory con il nome dato, modo sono i diritti (ad esempio 777) rename (old,new) Rinomina il file di nome old in uno di nome new (come mv diUNIX) unlink lista Cancella i file della lista (come rm di UNIX)

BIOINFO3 - Lezione 277 ESERCIZIO Scrivere un programma Perl che: Stampa a video la frase: inserire il nome del file : Legge da tastiera il nome di un file Se il file esiste: lo apre e ne legge le righe ad una ad una, contandone il numero stampa a video la frase: il file nome-del-file contiene numero-righe righe\n Se il file non esiste: stampa a video la frase: il file nome-del-file non esiste\n

BIOINFO3 - Lezione 278 SOLUZIONE ESERCIZIO

BIOINFO3 - Lezione 279 RIEPILOGO Operazioni su file e directory