Biblioteca Interdipartimentale di Chimica Gustavo Filippucci Biblioteca Interdipartimentale di Chimica gustavo.filippucci@unibo.it http://www.chimica.unibo.it/Chimica/Biblioteca/default.htm

Agenda Scientific literature and its Life Cycle (from production to circulation through validation) Information sources (primary, secondary, tertiary) Research strategies in scientific DBs, and web engines WEB OF SCIENCE Use of Science Citation Index Citational mechanism Journal of Citation Reports (Impact Factor/H Index)

The information cycle of knowledge

Information sources Classification of information sources: Primary (original works): scientific and technical journals, technical report, proceedings communications, thesis e dissertations, patents; Secondary (sources that collect&resume information from primary works): bulletins summaries or abstracts, indexes, compilations: reviews, treatises, handbooks, encyclopaedias and dictionaries, numerical tables; Tertiary (source&guide to secondary sources): repertories (bibliographies) and directories, lists of periodicals/products, guide the scientific and technical literature, guides for using scientific software); Per chiudere un accenno alla suddivisione formale che daremo alle diverse tipologie di fonti informative e che vedremo nel corso dei prossimi incontri. Come abbiamo visto le fonti si possono genericamente suddividere in tre tipologie: Primarie: ovvero quelle dove sono pubblicati documenti primari, ossia testi integrali di una ricerca originale. Una ricerca non è terminata fino a che non vengono pubblicati i risultati, accompagnati da informazioni sufficienti a consentire l’attendibilità. Il resoconto della ricerca molto spesso viene pubblicato solo dopo avere ricevuto un parere favorevole da almeno due referees, cioè da persone esperte nel settore attinente la ricerca. Per facilitare l’accesso alle informazioni i documenti primari vengono sintetizzati in documenti secondari. Alcuni di questi sono il risultato di uno studio analitico e critico dei primi, mentre altri indirizzano unicamente ai documenti originali, funzionando come chiave bibliografica di questi ultimi. Esiste un terzo gruppo di pubblicazioni il cui scopo è di guidare all’uso delle fonti di informazione primarie e secondarie:

The temporary relationship between the new recent primary literature and secondary literature Indexing tools: from a few days to a few months since the original work it has been published; Abstracting tools, useful for content description: from 1 to 9 months or more; Review articles, about a specific subject (topic): from 1 to 3 years or more; Collective works (handbooks, dictionaries, encyclopaedias): from 2 to 5 years. In rapporto alla quantità di forze dedicate alla loro compilazione, le opere secondarie richiedono periodi variabili di tempo per rimpacchettare e presentare la nuova conoscenza. E’ utile sottolineare che il lasso di tempo è in parte legato alla frequenza di aggiornamento (updating) della pubblicazione secondaria o della banca dati. Un utile strumento per ridurre i tempi – lo vedremo nel sito ACS – tra la pubblicazione del doc. nella letteratura primaria e la sua comparsa/citazione nei servizi di A&I (Abstracting and Indexing) si ha nell’editoria elettronica. La strategia scelta è quella di permettere all’utente autorizzato di vedere i cosiddetti ASAP (As Soon As Publishable), i sostanza gli articoli che sono in fase di pubblicazione ma che non sono ancora comparsi nella lett. primaria, e a maggior ragione non rintracciabili in quella secondaria prima di un certo tempo.

NOTE:The time lag is only partially linked to the frequency of updating of the secondary publications or database. Updating does not necessarily mean that primary literature in dbs is referred to what has appeared in that last week.

The structure of an article Title Authors and their professional address Keywords (aut key and/or db key) Abstract Introduction Methods and materials/Experimental Results/Findings/Discussion Discussion/Conclusions Bibliography or References Remember to look at the journals’ notes for authors & ed., and suppl. materials E.g.: http://www.rsc.org/journals-books-databases/journal-authors-reviewers/prepare-your-article/#format-layout Ora prenderemo in esame le diverse sezioni in cui è ripartito un articolo. (Lucidi n. 2/1-4) Il formato di un articolo scientifico comprende: Titolo: il titolo deve attirare l’attenzione del lettore e fargli capire la natura dell’argomento affrontato. Quindi le caratteristiche di un titolo sono o dovrebbero essere la precisione e la concisione. Se si deve scegliere si preferisce la precisione, ecco perché si trovano articoli dal titolo così lungo. Il titolo può essere suddiviso in due parti: 1. Titolo principale, 2. Titolo secondario che indica l’aspetto particolare trattato. Succede anche che una serie di articoli presenti sempre lo stesso titolo principale, accompagnato da titoli secondari numerati in progressione. Si tratta di un gruppo di ricerca che sta studiando approfonditamente un determinato argomento. Autori: in un articolo vengono comunicati i risultati di uno o più autori, i cui cognomi seguono il titoli secondo un ordine che segue differenti criteri. Alfabetico, in certi casi il direttore del gruppo di ricerca mette il proprio nome all’inizio o alla fine della lista degli autori. Spesso il nome dell’autore è accompagnato da un simbolo che rimanda ad una nota a pie’ di pagina nella quale si avverte che quello è l’autore al quale inviare eventuali comunicazioni (corresponding author); indirizzo professionale: gli autori segnalano il proprio indirizzo professionale, ovvero la localizzazione del centro di ricerca presso il quale lavorano. Parola chiave: si tratta di termini che gli autori scelgono come descrittori sintetici e pertinenti della loro opera. E’ in base a queste parole chiave che si cercano i riferimenti bibliografici nelle fonti secondarie di informazione. Riassunto: (summary o abstract, résumé, in francese) deve fornire al lettore un’informazione globale sul contenuto dell’articolo. Nel riassunto devono figurare le seguenti informazioni: descrizione dell’argomento affrontato, materiali oggetto di studio e condizioni sperimentali, risultati importanti, conclusioni. Il riassunto si trova all’inizio dell’articolo dopo il titolo e i nomi degli autori e prima delle parole chiave. Introduzione: serve a presentare il lavoro e a inquadrarlo nel contesto della ricerca, a mettere in evidenza alcuni aspetti controversi, il modo in cui si è affrontato il lavoro. L’introduzione apre la strada alla presentazione del lavoro vero e proprio. Materiali e metodi: in questa sezione viene precisato quali materiali sono stati oggetto di ricerca, quali reattivi sono stati usati (indicazione del fabbricante o del distributore) e come sono stati preparati o purificati, quali le concentrazioni delle soluzioni. Per quanto riguarda i metodi e le tecniche, vengono precisate le procedure seguite, comprese quelle relative al trattamento dei dati forniti dalla sperimentazione, i tipi di apparecchi usati (spettrofotometri, cromatografi, ecc.). Risultati: si presentano i risultati ottenuti riferiti a diverse variabili fisiche e chimiche (temperatura, pressione, ph, fluorescenza, ecc.) e i valori ai quali si perviene mediante l’uso di procedure statistiche. Si ricorre a tabelle, istogrammi, curve, diagrammi ecc. Discussione e conclusione: la discussione ha per oggetto i risultati delle sperimentazioni. Nella conclusione gli autori riassumono le loro interpretazioni dei risultati, ne discutono le implicazioni nonché i risultati pubblicati da altri ricercatori. A volte le sezioni discussione dei risultati e conclusioni sono distinte, a volte riunite. A volte possono trovarsi unite le sezioni risultati e discussione. Bibliografia: ogni articolo è accompagnato da una bibliografia, cioè un elenco di riferimenti bibliografici relativi a documenti che gli autori dell’articolo hanno consultato e utilizzato nel corso della ricerca. Per riferimento bibliografico si intende un insieme di informazioni che permettono di identificare senza ambiguità un documento (articolo, libro, rapporto di ricerca ecc.) Una bibliografia può essere organizzata in due modi: 1. Elencando tutti i riferimenti bibliografici secondo l’ordine di citazione nell’articolo, 2. Elencando i riferimenti bibliografici secondo l’ordine alfabetico del cognome del primo autore dell’articolo citato. Nel caso 1, si useranno, nel corpo del testo, dei numeri progressivi per rimandare alla bibliografia, nel caso 2, si userà il cognome del primo autore accompagnato dall’anno di pubblicazione del documento citato. In seguito vedremo il modo corretto di redigere i riferimenti bibliografici. Ogni periodico presenta comunque nella sezione istruzioni per gli autori le norme che questi devono seguire se intendono pubblicare.

Who controls the quality? Research developments need a quality control that guarantees:       1. The scientific value of an article;       2. The congruence between paper content and the features of the journal where it is published on.       This is guaranteed by: The referee system or peer review A causa dell’alta specializzazione che caratterizza la ricerca scientifica i responsabili di un periodico che ricevono un articolo per la pubblicazione non sono in grado di valutarne il valore scientifico. Essi provvedono ad inviarne una copia a uno o a due, referee o reviewer (revisore), a persone quindi particolarmente competenti nel settore di ricerca cui l’articolo appartiene. I referees esprimono un giudizio che inviano al comitato di redazione, che ne deciderà l’eventuale pubblicazione. Ma può anche richiedere agli autori di integrare il lavoro con ulteriori esperimenti così da rafforzare le loro affermazioni. Il sistema mostra anche qualche svantaggio, i tempi per il giudizio che allungano i tempi di pubblicazione e anche il fatto che il revisore è o potrebbe egli stesso essere parte in causa in quanto esperto nello stesso settore, generando competizione con l’autore dell’articolo. Nel complesso resta il sistema migliore per controllare la qualità delle pubblicazioni.

Improve search strategies

Recall/precision: a complex relationship Document sets

Main logic operators Boolean (generally in basic search) The online systems offer search operators that show the logical relationship among different concepts Intersection (AND / +) different concepts MUST be present at the same time Union (OR) for synonyms, acron., abbr., similar terms Exclusion (NOT / AND NOT)to exclude a not relevant concept Positional or Proximity operators (in advanced search) -as specific variant of the AND command- allow for more precise searching because they permit to specify order and closeness of the terms within the record Near without a specific order (NEAR) … with a specified order (ADJ) In the same research field (SAME), in the same sentence (WITH) (Relevance criteria) Gli operatori booleani si dividono in operatori di: Intersezione (AND o +) servono a rintracciare i record che soddisfano entrambi i criteri richiesti contemporaneamente (lucido 3/1) Unione (OR) servono a rintracciare i record che soddisfano almeno uno dei criteri richiesti (lucido 4/1) Complemento (NOT o AND NOT) servono a rintracciare i record che soddisfano un determinato criterio, escludendo quelli che ne soddisfano un altro (lucido 5/1) Esclusione (XOR o NOR) rintracciare i record che soddisfano esclusivamente uno solo dei due criteri richiesti (lucido 8/1) Esistono anche altri operatori logici più sofisticati: gli operatori relazionali e di prossimità, i primi rintracciano valori maggiori(>), (<) minori o uguali (=) a quello cercato, i secondi rintracciano i termini cercati solo se presenti (in qualsiasi ordine e distanza fra loro) nello stesso campo o sottocampo (SAME), oppure solo se presenti uno accanto all’altro o a una determinata distanza (ADJ o WITH), o in qualsiasi ordine (NEAR, lucido 6/1). L’operatore NEAR è più potente dell’operatore AND, oltre a ricercare documenti che contengono entrambe le parole, restringe il campo di ricerca specificando che i due termini si devono trovare entro un certo numero di parole di distanza uno dall’altro. Varia a seconda del motore di ricerca: in Lycos 25, in Altavista 10). Gli operatori booleani consentono di effettuare ricerche con più parole chiave, creando interrogazioni che possono diventare assai complesse (lucido 7/1)

WOS: tre strategie, 3 risultati diversi

Frase esatta «… … …»

Ordine di termini/concetti/keywords

The process of effectively searching for relevant information 1 Science Libraries @ UCB Before you start: your topic, the scope of your search, where to look How you conceptualize your topic affects how you search for relevant information Is your topic researchable? (part of a large research area or a new emerging area?) You may need to broaden or narrow the focus of your topic What is the scope, the purpose and the audience of your search? Are you doing a comprehensive search, attempting to survey the entire literature on a topic? Are you doing a focused search, attempting to find key articles on your topic? Something in between, so you can ascertain the state of knowledge on a topic? Maybe you just want to find a few review articles and/or books on your topic. The importance of indexing Indexing means the citations in the database are assigned terms from a controlled vocabulary Using index terms also helps you avoid the need to think of every possible synonym or alternate spelling of your search terms.

The process of effectively searching for relevant information 2 Science Libraries @ UCB Select the bibliographic databases and other resources and do your search Chemical Information Sources (WikiBooks: open books for an open world) Critically evaluating what you find Fink, Arlene. Conducting research literature reviews : from the Internet to paper, Sage, 2010. Ch. 3: Reliable data collection: relatively free from "measurement error" Validity refers to how well a measure assesses what it claims to measure Organize your citations and search strategy Use a reference manager tool: EndNote, Zotero, Mendeley … Save your search strategy to help document it, including: the date of the search(es) search terms used (keywords; title words; MeSHs, thesaurus terms, descriptors) any limits (eg, language, publication dates) that you placed on your search how many relevant citations you found in each database

Effective research strategies Define your search topic in a sentence or two Identify the major concepts of your search topic List keywords that describe each concept Decide how you need to combine the concept and keywords Determine which kind of resources are likely to have the information you are seeking (use info found in results for further research strategies- Es.: per costanti chimico fisiche/dati reazione HCP/Reaxys e no WOS/SF)

Proximity operators allow for more precise searching because they specify order and closeness of the terms within the record

ADJmore PRECISION WITH/SAMEmore RECALL

Web of Science http://www.isiknowledge.com/WOS

WOS : the citational spider web Help!!

Content coverage-1 WOS is a multidisciplinary database with a specific citational feature. WOS produces a quantitative bibliometric measure of scientific literature (Thomson Reuters co. property, previously ISI*), is composed by 7 different citational dbs and by Journal Citation Reports with IMPACT FACTOR for journals indexed in the citation indexes: The first 3 dbs include bibl. references cited by authors of the indexed articles. Science Citation Index Expanded (SCI-Expanded) Social Sciences Citation Index (SSCI) Arts & Humanities Citation Index (A&HCI)

Content coverage-2 Others 2 databases contain citation indexes from proceedings, seminars, and workshops. Conference Proceedings Citation Index - Science (CPCI-S) Conference Proceedings Citation Index - Social Sciences & Humanities (CPCI-SSH)

NOT SUBSCRIBED BY UNIBO Content coverage-3 These others 2 databases, typically chemical, allow to draw the chemical structure and find the chemical compounds and reactions linked to them. It is possible to search not only with graphic editor but it is also possible searching by chemical/compound name or using reaction data: Index Chemicus (IC) Current Chemical Reactions (CCR-Expanded) NOT SUBSCRIBED BY UNIBO

The whole WOS db 28

Numbers

WOS coverage (2016) -1 Over 90 M of records (almost 1 Bil) 110,000 conference proceedings Citation from more than 12,000 high impact research journals, including open access journals Journal backfiles starting from 1900 (1985 UNIBO) Over a bilion of cited references (2014) Capturing 65 M cited references annually

WOS coverage (2016) -2 20,389 journal titles from regional and international publishers Over 2.6 M data studies & data sets 60,000 scholarly books 23.6 M inventions 15,000 conference proceedings annually Over 51.8 M patents

This is the citation network… What is Citation Index ? Citation index contains bibliographic references cited by articles’ authors indexed into the db A cited references leads us to other doc. citing the same article A cited ref. also leads us to retrieve documents that cite a specific article… … and to the other bibliographic ref. (problably interesting for our aims) in the bibliography/references of the retrieved article. This is the citation network…

The Science Citation Index in detail Science Citation Index Expanded™ (SCI™ Expanded) means that the present multidiscipl. db fully indexes more than 8,500 journals covering 150 disciplines. All citations come from indexed articles. - coverage: from 1900 up to current literature (UNIBO:1985) - more than 19,000 new indexed articles weekly (average) - over 423,000 new bibl. citations every week - from 1991, 70 % abstract in English, fully searchable in English

The “citation network” and the time

Summary It provides access to a complete bibliographic information (cited bibliographic ref. and possibility to access FT article, if subscibed) It indexes more than 8,500 among the most important scientific periodicals (including over 150 Book Series highly cited) It contains the references cited by the authors of the articles into the db It searches for: topic, author, source title, publ. year … It gives the possibility to retrieve “common reference” cited (co-citations) by different authors and identify any article citing a specific bibl. reference An average of 19,000 new records added weekly (over 420,000 new citations a week) Since 1991 the 70 % of articles have an abstract searchable in english UNIBO coverage (1985- to present) Web access: http://www.chimica.unibo.it/it/biblioteca/banche-dati Tutorials: http://wokinfo.com/training_support/training/web-of-knowledge

General search -1

General search -2

WOS research mask UNIBO coverage Last update

Searching methods Simplified search interface- one initial search box WOS search types WOS basic search fields View here the citation indexes and database years included in your subscription 39

Performing a basic search

Results Your search strategy and results display here Re-order your results Citation information on right hand side Personalized button for Full Text/library holdings (A-LINK x UNIBO)

Refine Refine the results 42

… but in Google Refine tools?

… and in Google Scholar

Term/s could be in one or more fields

Remember: look/check for synonimous Remember: look/check for synonimous! (eg: sigma-aldrich and/or in the articles’ keywords, other web sources)

Advanced Search Search records using field tags, set combinations, or a combination of both. Research sets are listed in the Search History table during the current session

Management tools  Search History

A new set combines two previous sets

Looking for the ‘Thorpe reaction’

Notice the number of citations

Why are there only 3 records? UNIBO: since 1985

Wikipedia

Summarizing The record shows: Bibliography  Cited References Received citation  Times Cited Articles with shared references Related Records Link to the article Full text (if subscribed) Record management tools: saving, printing, mailing, exporting with a reference manager (e.g.: endnote online), adding to marked list, creating citation alert Impact Factor

Related Records (shared refs)TOPIC: (carbon nanotube Related Records (shared refs)TOPIC: (carbon nanotube*) Refined by: DOCUMENT TYPES: ( REVIEW ) AND COUNTRIES/TERRITORIES: ( ITALY ) AND AUTHORS: ( BALLERINI L )

Analyze data

Create citation report

Web of Science Core Collection: Search Options Cited Reference Search Search for records that have cited a published work With the exception of the most prolific authors, use authors’ name and year for the selected core article as a starting point  it will generate a list of matching references including variations that have been introduced by other authors (including error in citing) The count in the Citing Articles column is not limited to your institution's current product entitlements and year settings. However, your access to records in the product is limited to your subscription. Cited reference variations Eliminating self-citations by combining a Cited Reference Search with a search by the source author

Cited reference search

Received cit. Select and click

Time surfing using citations as thread to discover who and what has influenced the work of a scientist (references, related records) Look ahead to discover the impact of a work on current research (times cited) Link to full text for primary literature Output for the record (Reference Manager, EndNote Basic, ecc.) Analysis tools Alerting service Discover topic shared with other scientists (shared ref.) Controlled term lists (useful for institutions) Find a record starting from an incompleted citation

It’s useful to know that … Coverage is selective and not complete, the majority of the scientific literature is published in just a few journals 50% of citations make reference to only 15% of the articles

Citation searching: comparing WOS, Scopus and GS - 1 Valerie Forrestal, Stevens Institute of Technology (Hoboken, NJ) http://www.slideshare.net/val_forrestal/citation-searching-presentation

Citation searching: comparing WOS, Scopus and GS - 2 Valerie Forrestal, Stevens Institute of Technology (Hoboken, NJ) http://www.slideshare.net/val_forrestal/citation-searching-presentation

Citation searching: comparing WOS, Scopus and GS - 3 Valerie Forrestal, Stevens Institute of Technology (Hoboken, NJ) http://www.slideshare.net/val_forrestal/citation-searching-presentation

Citation searching: comparing WOS, Scopus and GS - 4 Valerie Forrestal, Stevens Institute of Technology (Hoboken, NJ) http://www.slideshare.net/val_forrestal/citation-searching-presentation

ENDNOTE Gestione e il recupero dei riferimenti bibliografici e dei documenti per l’elaborazione di bibliografie

Tutorial EndNote Basic URL tutorial http://www.sba.unibo.it/it/allegati/allegati-almare/presentazione-di-endnote-basic/@@download/file/Endnote_Basic_Massimo_Urbini_Enrica_Zani_Unibo.pdf Thomson Reuters ha scelto di cambiare il nome da EndNote™ Web a EndNote™ basic, solo Online. Esiste anche la versione estesa non collegata a WOS

Modalità di accesso Versioni del prodotto online: EndNote Basic free EndNote Basic per utenti WoS  (UNIBO) EndNote Online per possessori licenza EndNote

Funzioni

Accesso a EN Suggerimenti: Web of Science IP/Proxy credenziali di Ateneo Shibboleth-IDEM Anytime/Anywhere Access credenziali personali

Capacità fino a 50k citazioni importabili 2 Gb di spazio per caricamento di file oltre 3300 stili citazionali

Accesso da WOS Utenti con credenziali accesso WoS: alerts salvataggio ricerche utilizzo del medesimo profilo in EN mantenimento link a record WoS (fuori rete ateneo non è possibile)

Il proprio spazio personale

EndNote Basic versione free svincolato da autenticazioni in rete Unibo accesso temporalmente illimitato funzioni più povere: es.: solo 21 stili citazionali

Applicazioni

Problemi Cite While You Write (riavviare il pc dopo installazione) Firefox extension (problema di compatibilità segnalato per questo componente aggiuntivo e Firefox 52.0 (https://addons.mozilla.org/it/firefox/addon/endnote/). Nessun problema con IE e Chrome

Nel browser Capture EN ref Save to EN

Importare da Google Scholar (da impostazioni)

Cite While You Write Si installa in MS Word compatibile Mac/Win Consente di: importare nel testo citazioni formattare una bibliografia esportare in EN le citazioni nel testo Nota: l’installazione include il plug-in per Internet Explorer (analogo a Firefox ext.)

Coffee break