PUBMED 29 novembre 2012.

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Transcript della presentazione:

PUBMED 29 novembre 2012

PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library of Medicine (NLM) sviluppata dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) accessibile gratuitamente via Web

PUBMED Si occupa di: medicina infermieristica e discipline collaterali odontoiatria medicina veterinaria scienze pre-cliniche

DATI Indicizza oltre 5500 periodici (quasi la metà di provenienza USA) La copertura è prevalentemente anglosassone (91% dei lavori in inglese: circa 800 periodici in altre lingue) Il taglio è clinico

DATI Inviati in maniera automatica dagli editori [PubMed - as supplied by publisher]. Sono compresi gli [Epub ahead of print] Presi in carico, ma non ancora indicizzati [PubMed - in process] La citazione completata con i MeSH, le eventuali correzioni etc etc [PubMed - indexed for MEDLINE]

DATI Il valore aggiunto di PubMed (e delle banche dati in generale) è dato dal lavoro umano di indicizzazione e normalizzazione DATI

RISULTATI PubMed fornisce il record bibliografico e, quando disponibili, l’abstract e il full-text dell’articolo recuperato.

COME ACCEDERE

PUBMED: HOME PAGE

RICERCA LIBERA 1. Dopo aver inserito il termine di ricerca, il sistema suggerisce una lista di termini a partire da quello inserito Non è una lista esaustiva E’ diverso cercare un singolo termine o più termini

RICERCA LIBERA 2. Le singole parole vengono cercate, oltre che nel thesaurus (quando ci sono) usando il campo All Fields HYPERTENSION All fields[ALL] Untagged terms and terms tagged with [all fields] are processed using Automatic Term Mapping. Terms that do no map are searched in all search fields except for Place of Publication and Transliterated Title. Terms enclosed in double quotes or truncated will be searched in all fields. PubMed ignores stopwords. Text words[TW] Includes all words and numbers in the title, abstract, other abstract, MeSH terms, MeSH Subheadings, Publication Types, Substance Names, Personal Name as Subject, Corporate Author, Secondary Source, and Other Terms (see Other Term [OT] above) typically non-MeSH subject terms (keywords), including NASA Space Flight Mission, assigned by an organization other than NLM. SUPPLEMENTARY CONCEPT[NM] Includes chemical, protocol or disease terms. Synonyms to the Supplementary Concepts will automatically map when tagged with [nm]. This field was implemented in mid-1980; however, many chemical names are searchable as MeSH terms before that date.

ALL FIELDS Il campo “All Fields” comprende tutti i campi di ricerca meno i campi “Place of Publication” e “Transliterated Title” I termini fra virgolette e quelli troncati sono cercati in questo campo

RICERCA LIBERA 3. Quando digitiamo più termini nella stringa di ricerca, PubMed attiva l’Automatic Term Mapping Tabelle di conversione Mesh Titolo della rivista Autore/Collaboratore Untagged terms that are entered in the search box are matched (in this order) against a MeSH (Medical Subject Headings) translation table, a Journals translation table, the Full Author translation table, Author index, the Full Investigator (Collaborator) translation table and an Investigator (Collaborator) index. When a match is found for a term or phrase in a translation table the mapping process is complete and does not continue on to the next translation table.

RICERCA LIBERA. 4 Quando i termini sono trovati all’interno di una delle tabelle, la ricerca si ferma Se i termini non vengono trovati in una tabella, vengono ricercati in AND allargando molto la ricerca (v. Search details)

ESEMPIO Knee surgery La funzionalità AUTO SUGGEST (simile alla ALSO TRY che c’è a destra) presenta le ricerche più gettonate in PubMed

FRASE ESATTA Usare le virgolette per trovare una frase “così come è scritta” (es. “knee surgery”, “molecular biology” o “metabolite reproduction”) Usare il troncamento (es. knee surger*)

TRONCAMENTO L’asterisco * sostituisce zero o più caratteri Alla fine della parola: trova i termini con la stessa radice Esclude l’Automatic Term Mapping quindi non vengono ricercati nei Mesh Non si applica alle stopword Parole che non vengono cercate a, an, are, be, for...

FRASE ESATTA: ESEMPIO

STRUMENTI PER LA RICERCA: Il thesaurus - MESH Vocabolario controllato dei descrittori (sinonimi, acronimi e varianti di lingua vengono normalizzati con un unico termine) Strutturato ad albero

STRUMENTI PER LA RICERCA: Il thesaurus - MESH La strategia di ricerca può avvantaggiarsi delle seguenti opzioni: Major topic (termine principale) Esplosione o NON esplosione del termine Uso dei Sotto descrittori

STRUMENTI PER LA RICERCA: Il thesaurus - MESH Vantaggi: I sinonimi sono inclusi nella ricerca Gli articoli trovati sono pertinenti

I SOTTODESCRITTORI: Mesh subheadings Ad ogni termine del thesaurus corrispondono solo i subheadings che lo riguardano Riducono il numero di record recuperati secondo l’intenzione di chi ricerca

STRUMENTI PER LA RICERCA: Il thesaurus Quando ricercare nel thesaurus: Argomento consolidato (v. tempi di attribuzione dei descrittori) I sinonimi sono inclusi nella ricerca Gli articoli trovati sono pertinenti E’ sempre consigliato fare anche la ricerca libera

RICERCA PER DESCRITTORI 1: Mesh database

RICERCA PER DESCRITTORI 2: Mesh database

RICERCA PER DESCRITTORI 3.

RICERCA PER DESCRITTORI 4. Subheadings Major topic Explosion Entry terms (sinonimi) Ricercare tramite Search builder

PAUSA

CONSIGLIO Cercare un termine alla volta Unire i termini tra loro con gli operatori booleani

OPERATORI BOOLEANI AND OR NOT

ESECUZIONE DEI BOOLEANI 1. Il primo operatore da sinistra è eseguito per primo influenza AND vaccine OR vaccination articoli che contengono sia "influenza" sia "vaccine" articoli con "vaccination"

ESECUZIONE DEI BOOLEANI 2. Le parentesi modificano l’ordine di ricerca: i termini fra parentesi sono eseguiti per primi e poi combinati con gli altri influenza AND (vaccine OR vaccination) “influenza” e “vaccine” “influenza” e “vaccination”

COMBINARE I PASSI DELLA RICERCA

AMPLIARE LA RICERCA: Related citations Applica un algoritmo basato su TI, ABS e MESH TERMS

LIMITARE LA RICERCA

LIMITARE LA RICERCA: Clinical Queries Sottoinsieme di articoli di PubMed rivolto ai medici che cercano l'evidenza nella pratica clinica.

LIMITARE LA RICERCA: Clinical Queries http://www.ncbi.nlm.nih.gov/corehtml/query/static/clinicaltable.html

VISUALIZZARE I RISULTATI

FORMATO ABSTRACT con link al full text e a TROVAMI

SCARICARE LA VERSIONE ELETTRONICA

SALVARE I RISULTATI Send to File Send to Collections Send to Order Citation manager Send to Clipboard Send to E-mail Send to My Bibliography

SALVARE I RISULTATI: la clipboard

SALVARE I RISULTATI: la clipboard La Clipboard è un luogo nel quale posso temporaneamente collocare i miei risultati Elimina automaticamente i duplicati Nella clipboard posso fare le stesse operazioni consentite nella Main Search Page

SALVARE I RISULTATI: la clipboard Contiene fino a un massimo di 500 record Dal momento in cui smetto di lavorare, resta disponibile per 8 ore

CITATION SENSOR Cerca le citazioni bibliografiche a partire dai termini inseriti in libera Gli articoli trovati dal Citation sensor sono evidenziati in testa alla lista dei risultati Smith 2009 Citation Sensor is a new PubMed feature that matches searches with citations. It recognizes combinations of search terms that are characteristic of citation searching, e.g., volume/issue numbers, author names, journal titles, and publication dates, which it then matches to citations. If your search invokes the Citation Sensor, you will see a yellow area above the retrieval with links to one or more citations for your consideration. Please note: the Citation Sensor will not work with terms entered with search tags, e.g., chen [au].

GENE SENSOR Gene Sensor riconosce i circa 5mln di geni del database Gene; se ne individua uno nella stringa di ricerca, offre, in un riquadro primo fra i risultati, link a informazioni specifiche in Gene database a2m liver Gene Sensor checks the query entered in the search box and if it detects the symbol for a gene found in the Gene database, a "Gene Information" box displays above the search results with links to organism-specific information and the full report in Gene.

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