Il codice genetico Ma come si fa a passare dal “linguaggio” degli acidi nucleici (che utilizza 4 “lettere”)… … al “linguaggio” delle proteine (che utilizza.

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1 Il codice genetico Ma come si fa a passare dal “linguaggio” degli acidi nucleici (che utilizza 4 “lettere”)… … al “linguaggio” delle proteine (che utilizza 20 “lettere”)?

2 Il codice genetico Certo non può esserci una corrispondenza 1:1
Ma non è neanche possibile associare un amminoacido ad una coppia di basi azotate Infatti le possibili coppie di basi sono 42 = 16 (AA, UU, CC, GG, AU, AC, AG, UA, UC, UG, CA, CG, CU, GA, GU, GC) troppo poche per poter codificare i 20 amminoacidi

3 Il codice genetico Appare evidente, quindi, che il codice utilizzato si basa su triplette di basi… … infatti 43 = 64 combinazioni sono più che sufficienti per codificare i 20 amminoacidi

4 Il codice genetico Ed ecco quindi il codice genetico:
Ovviamente è ridondante: ci sono cioè più triplette che codificano per lo stesso amminoacido Ci sono anche le triplette di inizio (AUG) e di stop (UAA, UAG e UGA) che determinano l’inizio e la fine di una sequenza polipeptidica

5 Ogni tripletta di basi sull’RNA è anche detta codone
Il codice genetico Il codice genetico è universale: praticamente tutti gli organismi viventi utilizzano questo stesso codice per tradurre una sequenza di basi azotate (il DNA e poi l’RNA) in una sequenza di amminoacidi (la proteina) Ogni tripletta di basi sull’RNA è anche detta codone

6 Modificato da un lavoro del prof. Domenico Ripolo
Sintesi proteica Modificato da un lavoro del prof. Domenico Ripolo

7 Cos’è la sintesi proteica
La sintesi proteica è il processo che porta alla formazione delle proteine utilizzando le informazioni contenute nel DNA. Si tratta di un processo piuttosto complesso in cui intervengono vari “attori” Nelle sue linee fondamentali questo processo è identico in tutte le forme di vita, sia eucarioti che procarioti

8 Dove avviene Come vedremo, il processo comincia nel nucleo (negli eucarioti) e termina nel citoplasma o nel reticolo endoplasmatico ruvido

9 Gli “attori” – Il DNA Nel DNA sono contenute le “istruzioni” per sintetizzare le diverse proteine Ogni “porzione” di DNA che codifica per una specifica proteina è detta gene

10 Gli “attori” – Il DNA Ad esempio, questo potrebbe essere il gene per l’insulina… … e questo il gene per l’emoglobina …anche se buona parte del DNA degli eucarioti NON è gene.

11 Gli “attori” – L’RNA Nella sintesi proteica interviene un altro acido nucleico, l’RNA, presente in 3 forme diverse (ma a filamento singolo): l’RNA messaggero (mRNA) l’RNA ribosomale (rRNA) l’RNA transfer (tRNA)

12 L’RNA messaggero l’RNA messaggero (mRNA) è una singola catena lineare di RNA che fa da tramite tra il nucleo e il citoplasma. Contiene una copia “in negativo” del gene.

13 L’RNA ribosomale L’RNA ribosomale (rRNA) costituente principale (insieme ad alcune proteine) dei ribosomi, da cui il nome.

14 L’RNA transfer L’RNA transfer (tRNA) è una particolare catena di RNA che viene rappresentato bidimensionalmente come un trifoglio... …mentre la struttura tridimensionale è decisamente più complessa

15 Gli “attori” – Amminoacidi
La sintesi proteica richiede anche gli amminoacidi, cioè i “mattoncini” che, assemblati in sequenza, costituiranno le proteine

16 Gli “attori” – Amminoacidi
Tutte le nostre proteine sono costituite da solo 20 tipi di amminoacidi, un po’ come tutte le parole del nostro vocabolario sono formate utilizzando 21 lettere dell’alfabeto

17 Gli “attori” – Amminoacidi
Una sequenza di amminoacidi, come questa… Gly Ala Val Tyr Met … è un polipeptide. Le proteine sono polipeptidi generalmente molto lunghi e con un organizzazione anche molto complessa.

18 Gli “attori” – Ribosomi
Le “fabbriche” cellulari di proteine sono i ribosomi, piccoli organuli costituiti da due subunità I ribosomi, come detto, sono costituiti da rRNA e proteine

19 Le fasi della sintesi proteica
Le fasi della sintesi proteica sono 2: La Trascrizione (che, negli eucarioti, avviene nel nucleo) La Traduzione (che avviene sui ribosomi) Negli eucarioti tra le due può avvenire una fase intermedia di maturazione dell’RNA, lo splicing.

20 The path to transcription

21 La trascrizione Nella fase di trascrizione la doppia elica di una porzione di DNA (non tutta la doppia elica) viene dapprima svolta… … ad opera di un enzima detto RNA-Polimerasi

22 La trascrizione Lo stesso enzima apre la doppia elica…
… e inizia, utilizzando uno dei due filamenti come stampo, a costruire una molecola complementare di mRNA.

23 Trascrizione DNA DNA coding strand 5’ G T C A T T C G G 3’ G RNA 5’ U
DNA template strand

24 La trascrizione Ecco un modello tridimensionale dell’RNA-Polimerasi

25 La trascrizione Ad esempio, prendiamo una porzione di DNA come quella mostrata a sinistra A G T C A C G T

26 La trascrizione Ad esempio, prendiamo una porzione di DNA come quella mostrata a sinistra A G T C A C G T

27 La trascrizione Ad esempio, prendiamo una porzione di DNA come quella mostrata a sinistra A G T C A C G T

28 La trascrizione Ad esempio, prendiamo una porzione di DNA come quella mostrata a sinistra A G T C A C G T

29 La trascrizione Dopo la separazione dei due filamenti, l’RNA polimerasi comincia ad assemblare la catena complementare di mRNA… A G T C A C G T

30 La trascrizione … utilizzando come stampo uno dei filamenti e secondo la complementarietà delle basi. G A G T C C U C A A C C U G U A

31 La trascrizione … La catena di RNA messaggero così formata... G C U A

32 La trascrizione … La catena di RNA messaggero così formata... G C U A

33 La trascrizione … sarà una sorta di impronta “in negativo” del gene da cui si è originato… G C U A RNA messagero … e migrerà verso i ribosomi liberi nel citoplasma o verso quelli attaccati al reticolo endoplasmatico rugoso, portando le istruzioni per la sintesi della proteina.

34 Dalla trascrizione alla traduzione

35 I geni eucariotici sono frammentati: lo splicing

36 La traduzione La traduzione è la vera e propria sintesi della catena proteica. Essa può essere divisa in: iniziazione (attacco del ribosoma e del primo tRNA), allungamento (aggiunta uno ad uno degli amminoacidi), terminazione (distacco della catena proteica completa)

37 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U G Gln C G A Ala U C A Val A G Gly anticodone codone G C U A

38 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U G Gln C G A Ala U C A Val A G Gly G C U A

39 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U G Gln U C A Val A G Gly C G A Ala G C U A

40 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U G Gln U C A Val A G Gly C G A Ala G C U A

41 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U G Gln U C A Val A G Gly C G A Ala G C U A

42 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U G Gln U C A Val A G Gly C G A Ala G C U A

43 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U C A Val A G Gly U G Gln C G A Ala G C U A

44 La traduzione Successivamente su ogni codone si attaccherà il tRNA con l’anticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. La fase di traduzione ha inizio quando l’RNA messaggero si attacca al ribosoma. U C A Val A G Gly C G A Ala U G Gln G C U A

45 La traduzione L’amminoacido del primo tRNA si lega poi a quello del secondo… U C A Val A G Gly Ala U G Gln C G A G C U A

46 La traduzione L’amminoacido del primo tRNA si lega poi a quello del secondo… U C A Val A G Gly Ala U G Gln C G A G C U A

47 La traduzione L’amminoacido del primo tRNA si lega poi a quello del secondo… U C A Val A G Gly Ala U G Gln C G A G C U A

48 La traduzione … il primo tRNA si allontana… Val Gly Ala Gln U C A A G

49 La traduzione … il primo tRNA si allontana… Val Gly Ala Gln U C A A G

50 La traduzione … il primo tRNA si allontana… Val Gly Ala Gln U C A A G

51 La traduzione … e un nuovo tRNA si attacca all’RNA messaggero Val Gly
Ala U G Gln G C U A

52 La traduzione … e un nuovo tRNA si attacca all’RNA messaggero Val Gly
Ala U G Gln G C U A

53 La traduzione … e un nuovo tRNA si attacca all’RNA messaggero Val Gly
Ala U G Gln G C U A

54 La traduzione … e così via. U C A Val Ala Gln A G Gly G U U G C U A

55 La traduzione … e così via. U C A Val Ala Gln A G Gly U G G C U A

56 La traduzione … e così via. U C A Val Ala Gln U G A G Gly G C U A

57 La traduzione … e così via. U C A Val U G Ala Gln A G Gly G C U A

58 La traduzione … e così via. U G U C A Val Ala Gln A G Gly G C U A

59 La traduzione … e così via. U C A Val Ala Gln A G Gly G C U A

60 La traduzione … e così via. Ala Gln U C A Val A G Gly G C U A

61 La traduzione … e così via. Ala Gln A G Gly U C A Val G C U A

62 La traduzione … e così via. Gly Ala Gln U C A Val G G A G C U A

63 La traduzione … e così via. Gly Ala Gln U C A Val G G A G C U A

64 La traduzione In questo modo si viene a costruire un polipeptide sempre più grande finché non si arriva ad un codone di stop e la sintesi si interrompe (terminazione).

65 A G C T Template Strand U C G A mRNA Nucleus Cytoplasm U C G A

66 A G C T template Strand Nucleus AA1 AGC Cytoplasm tRNA’s U C G A

67 T G C A U C G A AAG AGC template Strand Nucleus ATP AA1 AA2 Cytoplasm
tRNA’s U C G A

68 T G C A U C G A AGC AAG U U U Template Strand AA1 Nucleus ATP AA1 AA2
Cytoplasm AAG U C G A

69 T G C A U C G A AGC AAG U U U template Strand AA1 Nucleus AA1 AA2 AA3
Cytoplasm AAG U C G A

70 È frequente che, sullo stesso mRNA, si trovino diversi ribosomi in cui avviene la sintesi di molecole della stessa proteina: poliribosomi o polisomi.

71 Immagini e dati utilizzati per la realizzazione di questa presentazione provengono da alcuni siti, fra i quali: Un interessante filmato che riassume la sintesi proteica è disponibile sul sito nella sezione Multimedia.