Controlli di qualità degli mRNA (surveillance systems)

Presentazione sul tema: "Controlli di qualità degli mRNA (surveillance systems)"— Transcript della presentazione:

1 Controlli di qualità degli mRNA (surveillance systems)

2 AUG UAG mGppp AAAAAAAAAAAAAAAA PTC NMD (Nonsense Mediated Decay)

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4 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

5 Non-sense Mediated Decay (NMD): complesso EJC

6 Non-sense Mediated Decay (NMD)

7 3 2 Meccanismo dell’NMD UAG (PTC)AUGSTOP mGppp AAAAAAAAAAAAAAAA 33 2 mGpp p AAAAAAAAAAAAAAAA 3 UAG AAAAAAAAAAAAAAAA mGppp UAG 33 22 1 RF

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9 Non-Stop Mediated Decay (NSMD)

10 Ruolo del tmRNA

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12 Regolazione della traduzione

13 Transcriptional control gene mRNA protein Translational control Slow Lasting Transcription-dependent Rapid Short-lived Transcription-independent

14 Regolazione della traduzione generale specifica

15 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

16 Regolazione generale della traduzione nei procarioti

17 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

18 Regolazione della traduzione generale specifica

19 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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22 Regolazione della traduzione mediata da un sRNA regolatore

23 Regolazione autogena mediante riboswitch

24 Riboswitch (metabolita)

25 Riboswitch (temperatura)

26 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

27 Regolazione della traduzione autogena nei procarioti

28 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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31 Regolazione della traduzione delle r-proteine nei procarioti

32 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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34 Regolazione della traduzione negli eucarioti generale specifica

35 Initiation FactorsActivity prokaryoteseukaryotes IF3eIF-1 Fidelity of AUG codon recognition IF1eIF-1A Facilitate Met-tRNAiMet binding to small subunit eIF-2 Ternary complex formation eIF-2B (GEF) GTP/GDP exchange during eIF-2 recycling eIF-3 (12 subunits) Ribosome antiassociation, binding to 40S eIF-4F (4E, 4A, 4G) mRNA binding to 40S, RNA helicase activity eIF-4A ATPase-dependent RNA helicase eIF-4E 5' cap recognition eIF-4G Scaffold for of eIF-4E and -4A eIF-4B Stimulates helicase, binds with eIF-4F eIF-4H Similar to eIF4B eIF-5 Release of eIF-2 and eIF-3, GTPase IF2eIF5B Subunit joining eIF-6 Ribosome subunit antiassociation

36 eIF2 eIF2  3 subunità:   Subunità  aiuta attività di GTPasi e modula il legame tRNAi-eIF2   Subunità  è un regolatore della traduzione. E’ fosforilata (ser 51) da diverse chinasi in risposta a stress

37 la fosforilazione di eIF2  inibisce lo scambio GDP-GTP inizio traduz.

38 eIF4F

39 eIF4F eIF4F  Composto da 3 subunità eIF4A: elicasi, aiutato da eIF4B eIF4E: cap binding protein, regolata da fosforilazione e interazione con eIF4E-BP eIF4G: adattatore, interagisce con diversi fattori

40 Regolazione generale della traduzione Vari stress cellularieIF2 Stimolazione mitogenica eIF4E (eIF4F)