109/07/2016 E.coli possiede diversi fattori sigma.

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1 109/07/2016 E.coli possiede diversi fattori sigma

2 209/07/2016 Fattori sigma diversi legano promotori diversi

3 309/07/2016 Scambio di fattori sigma promotore riconosciuto da  32  32 gene “heat-shock”  70 gene “costitutivo” promotore riconosciuto da  70  70  32 la comparsa di nuovi fattori sigma promuove l’attivazione trascrizionale di geni precedentemente silenti scambioscambio

4 409/07/2016 Scambio di fattori  nel ciclo del fago SpO1  70  gp28 I promotori dei geni della fase INTERMEDIA del fago sono riconosciuti dal  gp28 di SpO1. I promotori dei geni della fase PRECOCE del fago sono riconosciuti dal  70 di E.coli.  33/34 I promotori dei geni della fase TARDIVA del fago sono riconosciuti dal  33/34 di SpO1. PRIMO SCAMBIO SECONDO SCAMBIO

5 Controllo positivo e negativo

6 609/07/2016 Due modelli di regolazione della trascrizione il gene è spento quando mancano i fattori trascrizionali Siti di legame per fattori trascrizionali Promotore Promotore Operatore Geni strutturali OPERONE PROMOTORE MODULARE il gene è spento quando si lega il repressore

7 Induttori e co-repressori

8 809/07/2016 Organizzazione dell' operone lac

9 909/07/2016 Repressione ed attivazione dell’operone lac Assenza di lattosio Presenza di lattosio

10 Induttori naturali e sintetici

11 Effetti molecolari dell’allolattosio

12 1209/07/2016 IL PROMOTORE DELL’OPERONE LAC PromotoreRegione -35Regione -10 Consenso5’-TTGACA-3’5’-TATAAT-3’ Operone lac5’-TTTACA-3’5’-TATGTT-3’ Operone trp5’-TTGACA-3’5’-TTAACT-3’

13 1309/07/2016 La regione di controllo dell'operone lac

14 1409/07/2016 Controllo positivo nell’operone lac

15 1509/07/2016 La doppia regolazione dell'operone lac

16 1609/07/2016 Doppia regolazione del promotore lac livello basale della trascrizione bassi livelli trascrizionali promotore “debole” repressione della trascrizione trascrizione assente attivazione della trascrizione alti livelli trascrizionali

17 1709/07/2016 Monomero e dimero del repressore Lac N N N N C C C C C C N N

18 1809/07/2016 Struttura del tetramero lacR domîni globulari domîni di oligomerizzazione “fascio”di 4 alfa eliche anfipatiche domîni di legame al DNA motivi elica-giro-elica

19 1909/07/2016 Effetto del legame dell’induttore Il legame dell’induttore induce una transizione conformazionale nel dominio a cerniera, che fa divergere le due “teste”, le quali non sono più in grado di legare il DNA CONTEMPORANEAMENTE In assenza dell’induttore ciascuna delle due “teste” aminoterminali lega una parte della sequenza palindromica dell’operatore

20 2009/07/2016 Affinità del repressore per il DNA

21 2109/07/2016 Il tetramero lacR forma un’ansa nel DNA CAP LacR

22 Legame dell’attivatore CAP-cAMP al DNA

23 L’ansa indotta dal repressore Lac al M.E.

24 2409/07/2016 Tre siti per il dimero lacR-lacR

25 2509/07/2016 L' operone del triptofano promotore trpEtrpDtrpCtrpBtrpA leader operatore mRNA trp trascritto abortivo (attenuazione) promotore ON RNA polimerasi repressore inattivo ASSENZA DI TRIPTOFANO RNA polimerasi repressore attivo promotore OFF triptofano PRESENZA DI TRIPTOFANO

26 Legame del repressore trp

27 2709/07/2016 Il repressore trp promotore ON promotore OFF triptofano

28 2809/07/2016 Attenuazione - I

29 2909/07/2016 Strutture alternative nella regione leader dell’mRNA trp PRESENZA DI TRIPTOFANO le regioni 3 e 4 si appaiano formando una forcina di terminazione ASSENZA DI TRIPTOFANO le regioni 2 e 3 si appaiano: la forcina di terminazione non si forma

30 3009/07/2016 Il ruolo dei ribosomi nell’attenuazione IN ASSENZA DI TRIPTOFANO IN PRESENZA DI TRIPTOFANO

31 3109/07/2016 Le conseguenze dell’attenuazione ALTA CONCENTRAZIONE DI TRIPTOFANO ALTA CONCENTRAZIONE DI TRIPTOFANO regione codificante per il peptide leader 1 1 2 2 33 4 4 BASSA CONCENTRAZIONE DI TRIPTOFANO BASSA CONCENTRAZIONE DI TRIPTOFANO peptide leader 1 1 2 233 4 4 codoni trp TERMINATORE IL TERMINATORE NON SI FORMA