Divisione in gruppi di 3 (6) persone (ulteriormente suddivise in 3 coppie) Assegnazione di tre articoli originali per gruppo. Gli articoli sono divisi.

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1 Divisione in gruppi di 3 (6) persone (ulteriormente suddivise in 3 coppie) Assegnazione di tre articoli originali per gruppo. Gli articoli sono divisi in tre tematiche (A, B, C) Ciascuno studente (coppia) del gruppo sceglie uno dei tre articoli da presentare in un breve seminario secondo un calendario prestabilito. Gli altri componenti del gruppo dovranno prepararsi a rispondere a domande (semplici) sull’articolo alla fine del seminario dei compagni di gruppo Seminari degli studenti

2 Seminario da 0 a 5 Domande ai componenti dello stesso gruppo di chi presenta (una per seminario) da 0 a 2 Esame finale da 8 a 21 Altri elementi che potranno contribuire al voto finale: 1) interventi durante la discussione dei seminari, 2) presenze VALUTAZIONE

3 articoli originali rassegne “reviews” libri di testo enciclopedia Letteratura scientifica

4 CELL 32.44 EMBO J 13.999 EUR J BIOCHEM 2.852 J BIOL CHEM 7.368 MOL CELL BIOL 9.666 NATURE 25.814 SCIENCE 23.872 IMPACT FACTOR CITATION INDEX Citazioni per anno Indice h INDICATORI BIBLIOMETRICI

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6 Genoteche e banche di cDNA

7 Trasferimento (blot)

8 Ibridazione

9 Western blot

10 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

11 Schema di Northern blot

12 Analisi di espressione (mRNA)

13 Altre tecniche di analisi Estensione del primer (primer extension) Protezione dalla S1/RNasi (mapping) RT-PCR Real time PCR

14 mRNA totale oligo antisenso marcato mRNA globina cap 5’5’3’3’ ibridazione estensione con RT Analisi dei frammenti estesi su gel di sequenza frammento protetto Estensione del primer (primer extension)

15 Protezione da RNasi (RNase Protection)

16 mRNA totale sonda RNA antisenso mRNA globina cap 5’5’3’3’ ibridazione trattamento con RNasi Analisi dei frammenti protetti su gel di sequenza frammento protetto

17 Protezione da RNasi (RNase Protection)

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19 Microarray (profilo trascrizionale)

20 Profilo differenziale mediante microarray

21 Tecniche di analisi di interazione DNA(RNA)-Proteine Foot-printing EMSA (electrophoretic mobility shift assay) Chromatin immunoprecipitation (CHIP)

22 Analisi interazioni DNA-proteine: saggio di footprinting

23 Analisi interazioni DNA-proteine: saggio EMSA

24 Analisi interazioni DNA-proteine: saggio EMSA

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26 Chromatin immunoprecipitation (Chip)

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28

29 Chip in lievito per Gal4 e Sug1

30 Coimmunoprecipitazione

31 Affinity co-purification (pull down)

32 Sistema dei due ibridi

33

34 Sistema dei tre ibridi

35 Sistemi (sperimentali) di espressione In vitro: - estratti cellulari In vivo: - cellule procariotiche - cellule eucariotiche in coltura - animali transgenici

36 Gene reporter

37 Vettori di clonaggio per lievito

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39 Ricombinazione omologa

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41 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

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44 Vettori episomali

45 transiente stabile Trasfezione di cellule in coltura vettori plasmidici vettori virali vettori episomali siRNA

46 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

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