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Centro di Ricerche Genomiche Università di Modena e Reggio Emila

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Presentazione sul tema: "Centro di Ricerche Genomiche Università di Modena e Reggio Emila"— Transcript della presentazione:

1 Centro di Ricerche Genomiche Università di Modena e Reggio Emila
Bioinformatics Core Centro di Ricerche Genomiche Università di Modena e Reggio Emila Enrico Tagliafico - Silvio Bicciato

2 Infrastruttura di bioinformatica avanzata in grado di fornire gli strumenti informatici e le competenze matematiche, statistiche ed ingegneristiche per l’acquisizione la gestione l’integrazione lo sfruttamento traslazionale dei dati provenienti dallo studio del genoma, della trascrizione, del proteoma e dei profili metabolici

3 CGR DUCK The GS FLX Titanium Data Computing Cluster: Linux-based parallel computing system featuring 20 processors with 32 GB of memory, rack-mounted with 4.5 TB of dedicated RAID storage DELL R900 cluster: 2 R900, ciascuno con 16 processori Xeon X7350 da 2.93GHz, 64GB di RAM, 4 dischi rigidi SAS da 300GB in configurazione raid 5 (900GB); DELL PowerEdge R510: processore Intel Xeon E5620 a 2.40 GHz, quad core, 12M Cache con un totale di 12GB di RAM memory con 2 dischi SAS da 146GB ciascuno per il sistema operativo e con 10 dischi SAS da 2TB ciascuno DELL PowerEdge 2600, usato come database e come file-server, con 2 processori Intel Xeon da 2.40 GHz, 2GB RAM, 6 dischi rigidi HDD-SCSI in configurazione raid 5 per un totale di 1.5TB di spazio su disco HP Proliant DL580 G3, con 4 processori Xeon MP da 3.00 GHz, 8GB RAM, 3 dischi rigidi HDD-SCSI da 146.8GB in configurazione raid 5 (450GB);

4 CGR DUCK Expression Console 1.1.1 Genotyping Console 3.0
GeneSpring GX 7.3 Partek Ingenuity Pathway Analysis ABI SDS2.3 (enterprise edition) equipped with RQ manager Integromics RealTime StatMiner dChip BRBArrayTool GenePattern GenMir R e pacchetti Bioconductor Pacchetti Perl e Phyton ...

5 DUCK CGR

6 DUCK CGR tpc2 tpc3 tpc4 nrps3 nrps5 ery Ribosomal proteins bio

7 DUCK CGR

8 DUCK CGR

9 DUCK CGR

10 DUCK CGR

11 DUCK CGR

12 DUCK CGR

13 DUCK CGR DUCK UI Genomic Data

14 DUCK CGR


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