Fattori di allungamento

Presentazione sul tema: "Fattori di allungamento"— Transcript della presentazione:

1 Fattori di allungamento
procarioti eucarioti EF-Tu eEF1A trasporto aa-tRNA EF-Ts eEF1B riciclo EF-G eEF2 traslocazione

2 Ciclo dell'allungamento

3 Ingresso amminoacil-tRNA

4 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

5 Traslocazione

6 Meccanismo della traslocazione

7 EF-Tu ed EF-G si legano alternativamente al ribosoma

8 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

9 La fase di terminazione
della traduzione

10 Fattori di terminazione procarioti eucarioti RF1 eRF1 RF2 “ RF3 eRF3
riconoscimento UAA, UAG RF2 “ riconoscimento UGA, UAA RF3 eRF3 GTPase RRF rilascio

11 Terminazione

12 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

13 Eventi post-terminazione

14 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

15

16 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

17 Struttura della puromicina

18 Inibitori della traduzione

19 Translation inhibitors
Effect Chloramphenicol inhibits prokaryotic peptidyl transferase Streptomycin inhibits prokaryotic initiation, also induces mRNA misreading Tetracycline inhibits prok. aminoacyl-tRNA binding to the ribosome small subunit Erythromycin inhibits prokaryotic translocation through the ribosome large subunit Fusidic acid similar to erythromycin only by preventing EF-G from dissociating from the large subunit Puromycin resembles aa-tRNA, interferes with peptide transfer resulting premature termination in prok and euk Diptheria toxin catalyzes ADP-ribosylation of and inactivation of eEF-2 Ricin found in castor beans, catalyzes cleavage of the euk. 28S rRNA Cycloheximide inhibits eukaryotic peptidyltransferase

20 Le regolazioni degli mRNA
nel citoplasma

21 Stabilità

22 Degradazione dell'mRNA nei procarioti

23 Degradazione dell'mRNA negli eucarioti

24 Regolazione della stabilità dell'mRNA negli eucarioti

25 Vie di degradazione dell'mRNA negli eucarioti

26 Trasporto e localizzazione

27 Trasporto nucleo-citoplasma

28 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

29 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

30 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

31 Localizzazione degli mRNA negli eucarioti

32 Meccanismi di localizzazione
Trasporto specifico Degradazione selettiva Ancoraggio a siti specifici

33 Trasporto degli mRNA nell'oocita di Drosophila

34 Trasporto degli mRNA nell'oocita di Drosophila

35 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

36 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

37 Supplementary movie SM1: Alexa488-labeled CaMKIIa 3’-UTR RNA particle transport in a living hippocampal neuron. Arrows indicate moving CaMKIIa 3’-UTR RNA particles. Images were acquired 5 min after injection with a frame rate of 1 image per 5 seconds. Scale bar: 10 µm

38 Supplementary movie SM3: Alexa546-labeled Sept7 RNA particle transport in a living hippocampal neuron. Please note that the dendrite shown is crossed by a dendrite of an adjacent microinjected neuron. The arrow indicates a moving Sept7 RNA particle. Images were acquired 10 min after injection with a frame rate of 1 image per second. Scale bar: 5 µm. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

39 Supplementary movie SM2: Stau1-EYFP particle transport in a distal dendrite of a living hippocampal neuron. The arrow indicates a moving Stau1-EYFP particle. Images were acquired 1 day after transfection with a frame rate of 1 image per second. Scale bar: 1 µm. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

40 Il trasporto specifico dipende da sequenze cis-agenti presenti nel 3' UTR dell'mRNA (zip code) e da fattori trans-agenti

41 Granuli citoplasmatici contenenti mRNA

42 (surveillance systems)
Controlli di qualità degli mRNA (surveillance systems)

43 NMD (Nonsense Mediated Decay)
AUG PTC UAG mGppp AAAAAAAAAAAAAAAA

44 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

45 Non-sense Mediated Decay (NMD):
complesso EJC

46 Non-sense Mediated Decay (NMD)

47

48 Non-Stop Mediated Decay (NSMD)

49 Ruolo del tmRNA

50 Ruolo del tmRNA