Martedì 24 nov 11-13 Bioinformatica Giovedì 26 nov 11-13 Bio Mol.

Presentazione sul tema: "Martedì 24 nov 11-13 Bioinformatica Giovedì 26 nov 11-13 Bio Mol."— Transcript della presentazione:

1 Martedì 24 nov 11-13 Bioinformatica Giovedì 26 nov 11-13 Bio Mol

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3 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

4 Elementi del promotore della metallotioneina

5 Altri elementi del promotore di pol II

6 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

7 Funzionamento degli Enhancer

8 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

9 Elementi Enhancer

10 Ruolo degli Isolatori

11 FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI
Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans - Fattori generali (o basali) - Attivatori

12 Attivatori costitutivi
Modulo Attivatore DNA occupato Consenso Distribuzione CAAT box CTF/NF1 22 bp GGCCAATCT ubiquitaria GC box SP1 20 bp GGGCGG Ottamero Oct-1 ATTGCAT Oct-2 23 bp linfoidi kB NFkB 10 bp GGGACTTTCC ATF GTGACGT

13 Attivatori inducibili ed elementi di risposta
Agente regolatore Elemento di risposta Consenso Attivatore Dimensioni (dalton) Shock termico HSE CNNGCCNNTCCNNG HSTF 93.000 Glucocorticoidi GRE TGGTACAAATGTTCT GR 94.000 Cadmio MRE CGNCCCGGNCNC MTF1 80.000 TPA TRE TGACTCA AP1 39.000 Siero SRE CCATATTAGG SRF 52.000

14 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

15 Struttura "modulare" degli attivatori
legame al DNA transattivazione dimerizzazione legame al ligando

16 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

17 Struttura degli attivatori

18 Scambio di domini di attivatori

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20 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

21 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

22 Dominio Dito di Zinco

23 Omeodominio (HTH, Elica-giro-Elica)

24 Dominio Elica-Ansa-Elica (bHLH)

25 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

26 Famiglie di fattori di trascrizione
Dito di zinco (zinc finger) Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) Elica-ansa-elica (helix loop helix, bHLH) Cerniera di leucina (leucine zipper, bZIP)

27 Dimerizzazione degli attivatori

28 Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri

29 Struttura dell’ “Enhanceosoma”

30 Attivazione della trascrizione mediante reclutamento

31 Attivazione della trascrizione

32 Modificazioni della cromatina mediate dagli attivatori

33 Acetilazione e deacetilazione della cromatina
Corepressore

34 Gli attivatori sono "bersaglio" di vie di trasduzione

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