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I Corso di formazione INFN su aspetti pratici dell'integrazione di applicazioni in GRID
Report 15/11/2007 Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II Martina Franca novembre 2007
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Installazioni iniziali
Installazione Matlab sulla UI locale Prova funzionamento del file voneural_MLP.m in locale da Matlab in modalità non grafica Esito Funzionante Installazione Matlab su WN Prova funzionamento del file voneural_MLP.m su WN da Matlab in modalità non grafica Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II
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Creazione .sh Visto che l’applicazione si deve necessarimente far partire da matlab si è deciso di creare prima un file bash riportato di seguito: #!/bin/sh # prova file bash /opt/exp_soft/apps/matlab/bin/matlab -nojvm <<EOF addpath('/opt/exp_soft/apps/matlab/voneural/'); voneural_MLP('1','7','1','18','50','1','3',' ','empty','data1_train.dat','empty','empty','output_01'); EOF exit Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II
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Creazione “JDL” Il file JDL non fa altro che richiamare il file di bash Type = "job"; JobType = "Normal"; Executable = "file_bash_voneural.sh"; #Arguments = "-f"; InputSandbox = {"file_bash_voneural.sh"}; StdOutput = "voneural_mlp_01.out"; StdError = "voneural_mlp_01.err"; OutputSandbox = {"output_01.tra","output_01.log","output_01_netTrain.mlp","voneural_mlp_01.out","voneural_mlp_01.err"}; ShallowRetryCount = 1; Requirements = other.GlueCEUniqueID == "ce1.gs.ba.infn.it:2119/jobmanager-lcgpbs-infinite"; È importante notare che si è dovuto necessariamente fare la richiesta specifica del nodo da usare perché solo lì è stato installato matlab Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II
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Risultato FUNZIONANTE Sottomettendo il job alla macchina giusta
(ce1.gs.ba.infn.it:2119/jobmanager-lcgpbs-infinite) si è avuto esito FUNZIONANTE Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II
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Sviluppi I prossimi possibili passi per l’applicazione VO-Neural_MLP sono: Verificare il funzionamento utilizzando tutti i metodi disponibili (TRAIN, TEST, FULL, RUN) Visto che la versione 2.0 del tool sarà in C++ potrebbe essere interessante provare a sottomettere un job con un fake (C++) che abbia input e output compatibili. Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II
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Saluti Siamo tutti molto stanchi e siamo solo a giovedì
FATEVI DUE RISATE con il telecomando sogno di ogni uomo Muta Off Dammi Birra – Sesso - Cibo Massaggio – Basta frignare – Dormi Dire SI – Togliti i Vestiti – Dire NO Compra – Pulisci – Vattene Sindrome premestruale OFF – Basta lamentele + Tette - Giovanni d’Angelo Università degli studi di Napoli Federico II
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