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amminoacidi e proteine
ione dipolare zwitterione
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proteine………polipeptidi
Struttura collagene, cheratina in pelle, ossa, capelli etc Catalisi enzimi Movimento miosina e actina nelle fibre muscolari Trasporto emoglobina Ormoni insulina, ormone della crescita Regolazione di funzioni biologiche sintesi di proteine Materiali tela del ragno, seta
4
pKa della catena laterale, pK a_2
3.86 4.07 13 10.07 pKa_2 12.48 6.00 10.53
6
Strutturia primaria di polipeptidi e proteine:
sequenza degli amminoacidi nella catena polipeptidica oligopeptide
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titolazione di un amminoacido
8
Titolazione acido base: HCl (?) + NaOH (titolo noto)
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Elettroforesi Tecnica di separazione degli amminoacidi a pH = 6.02
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legame peptidico Linus Pauling, 1930
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tripeptide
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Strutturia primaria di polipeptidi e proteine:
sequenza degli amminoacidi nella catena polipeptidica oligopeptide
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Tecniche di degradazione delle proteine
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Tecniche di degradazione delle proteine
degradazione di Edman
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cromatografia a scambio ionico
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a-elica 3.6 amminoacidi per giro
struttura secondaria: arrangiamento degli amminoacidi vicini uno rispetto all’altro (conformazioni) legame idrogeno -C=O………....H-N- a-elica 3.6 amminoacidi per giro legame H ogni quattro AA
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struttura secondaria: conformazione b a foglietto
catene In direzioni opposte – antiparallele legami H intercatena legame peptidico trans – come in a-elica gruppi R sopra e sotto il piano
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struttura terziaria: sistemazione tridimensionale di tutti gli atomi della catena legami disolfuro, legami idrogeno, interazioni idrofobiche e ponti salini
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Natura dei legami e interazioni intracatena che promuovono la struttura terziaria:
legami disolfuro, legami idrogeno, interazioni idrofobiche e ponti salini
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modello a nastro della mioglobina
Mioglobina: otto sezioni ad a-elica, la più lunga 24 aa, la più corta 7 aa gruppo eme modello a nastro della mioglobina
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struttura quaternaria:
formazione di aggregati tra catene polipeptidiche alcune proteine sono formate da più catene polipeptidiche unite da legami non covalenti modello a nastro della emoglobina: catene a in porpora: 2 di 141 aa catene b in giallo: 2 di 146 aa
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