I due cromosomi sessuali X e Y differiscono molto sia per dimensione (155 Mb vs 65 Mb) che per contenuto in geni (> 1000 geni vs ca.100 geni)

Presentazione sul tema: "I due cromosomi sessuali X e Y differiscono molto sia per dimensione (155 Mb vs 65 Mb) che per contenuto in geni (> 1000 geni vs ca.100 geni)"— Transcript della presentazione:

1 I due cromosomi sessuali X e Y differiscono molto sia per dimensione (155 Mb vs 65 Mb) che per contenuto in geni (> 1000 geni vs ca.100 geni)

2 PAR1 (o primaria) estremità del braccio corto, è grande ca. 2.6 Mb
Esistono due zone di omologia X-Y poste alle due estremità dei cromosomi  vengono indicate con la sigla PAR (Pseudo Autosomal Region) PAR1 (o primaria) estremità del braccio corto, è grande ca. 2.6 Mb PAR2 (o secondaria) estremità del braccio lungo, è grande ca. 320 Kb Queste due regioni, durante la meiosi maschile, si appaiano e la PAR1 va incontro a ricombinazione obbligata PAR1 PAR2

3 Perché si è ipotizzata l’esistenza di un meccanismo di compensazione del dosaggio genico (o più precisamente della differenza di dosaggio genico)?

4 aneuploidie dei cromosomi sessuali  a differenza di quelle che coinvolgono gli autosomi, sono compatibili con la vita, e, in alcuni casi, non comportano fenotipi anormali 47, XXX femmine normali, talvolta sterili 47, XXY (sindrome di Klinefelter) maschi sterili, talvolta con lieve ritardo mentale 45, X0 (sindrome di Turner), statura inferiore alla media, sterilità, altre anomalie di sviluppo generalmente non gravi 48, XXXX o XXXY sintomatologia più grave delle precedenti, ma comunque condizione compatibile con la vita

5 La quantità di prodotto genico di geni del cromosoma X è uguale in maschi e femmine, nonostante il fatto che i maschi abbiamo una sola copia del gene e le femmine due Esempio attività enzimatica della G6PD (Glucosio-6-Fosfato Deidrogenasi) Queste due osservazioni trovano una spiegazione immediata se ipotizziamo che nelle cellule somatiche venga mantenuto attivo un solo cromosoma X a prescindere da quanti siano i cromosomi X presenti

6 Nei mammiferi, a differenza che in altri organismi (es
Nei mammiferi, a differenza che in altri organismi (es. Drosophila), la compensazione del dosaggio genico è raggiunta attraverso l’inattivazione di un cromosoma X nelle cellule somatiche che ne contengono due (o più) Tutte le cellule somatiche mantengono attivo un solo cromosoma X, questo spiega come mai l’aneuploidia (cromosomi in eccesso o in difetto) per il cromosoma X sia compatibile con la vita (e talvolta comporti un fenotipo pressoché normale)

7 Agli inizi degli anni ’60 Mary Lyon ed Ernest Beutler sono arrivati in modo indipendente a dimostrare l’esistenza dell’inattivazione del cromosoma X Beutler studio del gene Gd nella specie umana Lyon studio di un gene che controlla il colore del pelo nel topo

8 L’inattivazione è: casuale (in media il 50% delle cellule inattiva l’X ereditato dal padre e il 50% quello ereditato dalla madre) mantenuta clonalmente (le cellule figlie mantengono lo stesso pattern di inattivazione della cellula madre) avviene in una fase precoce dello sviluppo embrionale

9 Strachan, Goodship, Chinnery – Genetica & Genomica, Zanichelli, 2016

10 Il rapporto Xmat-inatt:Xpat-inatt varia da tessuto a tessuto
Molti geni del cromosoma X sono espressi a livelli più elevati di quelli presenti sugli autosomi

11 Caratteristiche del cromosoma X trascrizionalmente inattivo:
mantiene attive alcune regioni (le due PAR ed altri geni interspersi in regioni inattive) assume un aspetto eterocromatico in interfase (corpo di Barr) acquista le caratteristiche del DNA inattivo (metilazione dei residui di Citosina, ipoacetilazione degli istoni, replicazione del DNA nella tarda fase S)

12 Nelle cellule somatiche di mammifero in interfase , sono visibili 0, 1, 2 o 3 corpi di Barr, il loro numero è correlato al numero di cromosomi X presenti nella cellula Corpo di Barr  struttura eterocromatica visibile in interfase addossato alla parete interna della membrana nucleare scoperto alla fine degli anni ’40 quando è stata scoperta l’inattivazione del cromosoma X, si è ipotizzato che potesse essere l’espressione morfologica dell’X inattivo

13 Nucleo di una cellula in interfase con 1 corpo di Barr
Nucleo di una cellula in interfase con 3 corpi di Barr Strachan, Goodship, Chinnery – Genetica & Genomica, Zanichelli, 2016

14 Come avviene l’inattivazione?
Processo multi-step: ‘conteggio’ dei cromosomi X presenti nella cellula (anche rispetto agli autosomi); ‘scelta’ del(dei) cromosoma(i) X da inattivare, uno per ogni assetto diploide; inizio dell’inattivazione; sua diffusione alla quasi totalità del cromosoma; mantenimento dello stato inattivo Tutte queste funzioni sono mediate da sequenze di DNA che si trovano nella regione Xq13 e da loci autosomici l’inattivazione non è sequenza-specifica (sequenze autosomiche traslocate sull’X vengono inattivate)

15 XIST  X Inactive Specific Transcript
La regione Xq13 contiene quindi l’X-Inactivation Center (XIC), è possibile suddividerla in sotto-regioni ciascuna delle quali coinvolta in un singolo step del processo inizio anni ’90  identificazione del primo gene coinvolto nell’inattivazione XIST  X Inactive Specific Transcript è l’unico gene espresso solo dal cromosoma X inattivo codifica un RNA senza ORF di ca. 17 Kb che sembra rivestire il cromosoma X inattivo

16 Attualmente sono stati identificati diversi altri geni necessari per l’inattivazione del cromosoma X (che codificano sia per lncRNA che per proteine), ma le basi molecolari di questo meccanismo non sono ancora completamente note

17 TAD = Topological Associating Domain

18 L’inattivazione è sempre casuale?
NO si osserva deviazione dalla casualità quando: uno dei cromosomi X porta una copia del gene XIST o del gene TSIX non funzionante o uno dei due crom X presenta duplicazioni o delezioni o uno dei due crom X è coinvolto in una traslocazione X-autosoma In 2) e 3) l’inattivazione è in origine casuale, ma le cellule che inattivano l’X ‘sbagliato’ saranno selettivamente svantaggiate rispetto alle altre cellule

19 Nelle traslocazioni bilanciate il cromosoma X ‘sbagliato’ è quello coinvolto nella traslocazione
Nelle traslocazioni sbilanciate (= crom. X con tratto autosomico sovrannumerario) l’X ‘sbagliato’ è quello non coinvolto nella traslocazione

20 cellula vitale Strachan e Read, Genetica molecolare umana, Zanichelli 2012

21 Pattern di inattivazione nelle cellule della linea germinale: entrambi i cromosomi X degli oogoni sono attivi, l’unico cromosoma X degli spermatogoni è inattivo Strachan e Read, Genetica molecolare umana, Zanichelli 2012

22 L’inattivazione del cromosoma X è responsabile della grande variabilità clinica delle malattie dovute a mutazioni di geni che mappano su questo cromosoma  la gravità del fenotipo clinico dipenderà dalla proporzione di cellule che hanno mantenuto attivo il cromosoma X con l’allele mutante

23 Espressione monoallelica di geni biallelici
Imprinting genetico Espressione differenziale di materiale genetico a seconda che esso sia stato trasmesso dal padre o dalla madre. I geni soggetti a imprinting sono presenti in duplice copia, ma di essi viene espressa una sola copia Espressione monoallelica di geni biallelici Molti esempi di espressione monoallelica, ma in genere la ‘scelta’ dell’allele attivo è random (geni delle Ig e del TCR, geni OR, geni cromosoma X

24 Concetto contrario alle leggi di Mendel secondo le quali l’origine materna o paterna di un’informazione non ne influenza l’espressione (equivalenza degli incroci reciproci) Geni ‘imprintati’ nel padre sono silenziati durante la spermatogenesi  la copia fornita dal padre non viene espressa, rimane attiva solo quella fornita dalla madre Geni ‘imprintati’ nella madre sono silenziati durante la oogenesi  la copia fornita dalla madre non viene espressa, rimane attiva solo quella fornita dal padre

25 pedigree di una malattia dovuta ad un gene soggetto a imprinting silenziato durante la oogenesi (è attiva solo la copia fornita dal padre) il rapporto maschi:femmine tra gli affetti è 1:1, una femmina malata non trasmette MAI la malattia, che può ricomparire però nei suoi nipoti (figli dei suoi figli maschi)

26 PROVE DELL’ESISTENZA DELL’IMPRINTING
esperimenti di trapianti di pronuclei nel topo: creazione di zigoti androgenetici e ginogenetici zigoti ginogenetici 2n cromosomi TUTTI di derivazione femminile embrioni abortivi – strutture extraembrionarie pressoché assenti, embrione quasi normale zigoti androgenetici 2n cromosomi TUTTI di derivazione maschile embrioni abortivi – iperplasia del trofoblasto, embrione pressoché assente CONTROLLI zigoti normali ottenuti con trasferimento di pronuclei 2n cromosomi, n forniti da un maschio e n da una femmina embrioni normali – la manipolazione di per sé non impedisce il normale sviluppo

27 PROVE DELL’ESISTENZA DELL’IMPRINTING NELL’UOMO
Esistono due patologie umane paragonabili agli zigoti ginogenetici e androgenetici: teratomi, 2n cromosomi forniti SOLO dalla madre mole idatiforme, 2n cromosomi forniti SOLO dal padre I triploidi (3n cromosomi = 69) sono tutti abortivi, ma il fenotipo dei 2nP1nM è diverso da quello dei 2nM1nP, nei primi si osserva un’iperplasia delle strutture extraembrionarie e assenza dell’embrione vero e proprio, viceversa, nei secondi si hanno strutture extraembrionarie quasi assenti e embrione pressoché normale Alcune disomie cromosomiche uniparentali (UPD) (entrambi i cromosomi di una coppia forniti dallo stesso genitore) hanno effetti fenotipici diversi dettati dal sesso del genitore che ha fornito la coppia di cromosomi

28 Il fenotipo degli embrioni andro- e gino-genetico nell’uomo
Strachan, Goodship, Chinnery – Genetica & Genomica, Zanichelli, 2016

29 COSTRUZIONE di MAPPE di IMPRINTING MEDIANTE L’USO di LINEE di TOPI PORTATORI di TRASLOCAZIONI ROBERTSONIANE e di TRASLOCAZIONI RECIPROCHE PARZIALI

30 TRASLOCAZIONE ROBERTSONIANA
Fusione centrica tra due cromosomi acrocentrici che danno così origine ad un cromosoma metacentrico (quando i due cromosomi che si fondono hanno uguali dimensioni) o submetacentrico (i due cromosomi che si fondono hanno dimensioni diverse) 1 1 2 1 2 2

31 TRASLOCAZIONE RECIPROCA PARZIALE
Cromosomi NON omologhi vanno incontro a rottura e riunione e si scambiano un segmento cromosomico

32 2 bilanciati e 4 sbilanciati
1 Portatore di traslocazione robertsoniana bilanciata – Produce 6 tipi di gameti: 2 bilanciati e 4 sbilanciati 1 2 2 A B C D E F gameti bilanciati gameti sbilanciati

33 + uovo di tipo C + spermatozoo di tipo D gameti bilanciati
A B C D E F gameti bilanciati gameti sbilanciati uovo di tipo C spermatozoo di tipo D + zigote bilanciato MA con disomia materna del cromosoma 2 (quello violetto) P M M

34 A (2M 0P) B (2P 0M) conclusione A B
uovo nullisomico spermatozoo disomico uovo disomico spermatozoo nullisomico zigote con disomia uniparentale MATERNA A zigote con disomia uniparentale PATERNA B A (2M 0P) B (2P 0M) conclusione wild-type il cromosoma NON contiene geni ‘imprintati’ fenotipo anormale il cr. contiene geni ‘imprintati’ nel padre E geni ‘imprintati’ nella madre il cr. contiene geni a espressione MATERNA il cr. contiene geni a espressione PATERNA

35 + portatore di traslocazione reciproca parziale bilanciata
produce 4 tipi di gameti: 2 bilanciati e 2 sbilanciati gameti bilanciati gameti sbilanciati zigote bilanciato ma con disomie uniparentali parziali (Materna per il tratto terminale violetto e Paterna per il tratto terminale azzurro) + uovo spermatozoo

36 Si stima che nell’uomo i geni soggetti a imprinting siano dell’ordine di , le seguenti regioni cromosomiche ne contengono vari: 6, 7q, 11p, 14q, 15q11-q13, 20

37 molto spesso i geni soggetti a imprinting sono riuniti in cluster contenenti geni ‘imprintati’ nella madre e geni ‘imprintati’ nel padre i due cluster omologhi mostrano metilazione differenziale (ma non sempre la metilazione è a carico dell’allele non espresso) nei cluster sono in genere presenti sia geni strutturali (il loro prodotto finale è una catena polipeptidica) sia geni che producono RNA non codificanti

38 metilazione del gene che produce un RNA antisenso
metilazione diretta del promotore CH3 competizione per l’enhancer CH3 RNA antisenso metilazione del gene che produce un RNA antisenso CH3

39 L’imprinting deve essere risettato ad ogni generazione
Strachan e Read, Genetica molecolare umana, Zanichelli 2012

40 Il figlio ha lo stesso genotipo dei genitori, ma con pattern di imprinting invertito
Strachan, Goodship, Chinnery – Genetica & Genomica, Zanichelli, 2016

41 Strachan, Goodship, Chinnery – Genetica & Genomica, Zanichelli, 2016

42 Sindrome di Beckwith-Wiedemann (BWS) (1)
Malattia dovuta a un gene soggetto a imprinting nella madre (è attiva solo la copia fornita dal padre) causata da acquisizione di funzione. Il gene mappa in 11p15 P M Nei soggetti normali è espressa solo la copia paterna La duplicazione sul cromosoma paterno ha come conseguenza un raddoppiamento del prodotto genico ed insorgenza della malattia P M La duplicazione sul cromosoma materno è senza conseguenze perché la copia sovrannumeraria non viene espressa P M

43 Sindrome di Beckwith-Wiedemann (BWS) (2)
Una mutazione nel centro di imprinting impedisce il silenziamento del gene in cis La mutazione è sul cromosoma paterno  non si hanno conseguenze fenotipiche perché la copia che non può essere spenta è comunque destinata ad essere espressa P M La mutazione è sul cromosoma materno  l’individuo è malato perché ha due copie attive del gene P M

44 Sindrome di Prader-Willi (PWS) - malattia dovuta ad assenza della funzione del ‘gene’ PWS (si tratta di vari geni che per semplicità vengono qui considerati come un unico gene), ‘gene’ soggetto ad imprinting nella madre (è espressa solo la copia fornita dal padre) che mappa in 15q11-13 Sindrome di Angelman (AS) - malattia dovuta ad assenza della funzione del gene AS, gene soggetto ad imprinting nel padre (è espressa solo la copia fornita dalla madre) che mappa in 15q11-13, cioè nella STESSA regione del ‘gene’ PWS

45 Entrambe le malattie possono essere dovute a:
delezione dell’intera regione cromosomica 15q11-13; disomia uniparentale (UPD) (materna nella PWS, paterna nella AS); errore di imprinting; solo per la sindrome di Angelman: mutazione nella copia materna del gene AS

46 Pattern di espressione nel soggetto normale: sono espressi il ‘gene’ PWS del cromosoma paterno ed il gene AS del cromosoma materno P M PWS AS La delezione è sul cromosoma Paterno  assenza della funzione del ‘gene’ PWS, si ha Sindrome di Prader-Willi P M La delezione è sul cromosoma Materno  assenza della funzione del gene AS, si ha Sindrome di Angelman P M

47 Disomia Uniparentale (UPD) Paterna  assenza funzionale del gene AS  Sindrome di Angelman
PWS AS UPD Materna  assenza funzionale del ‘gene’ PWS  Sindrome di Prader-Willi M PWS AS mutazione nel centro di imprinting sul cromosoma P che non può essere risettato e viene trasmesso con un’impronta di tipo Materno  assenza funzionale del gene PWS  Sindrome di Prader-Willi P M PWS AS mutazione nel centro di imprinting sul cromosoma M che non può essere risettato e viene trasmesso con un’impronta di tipo Paterno  assenza funzionale del gene AS  Sindrome di Angelman P M PWS AS

48 UPD = UniParental Disomy = disomia uniparentale  entrambi gli omologhi di una coppia vengono ereditati dallo stesso genitore Non si ha un’alterazione quantitativa rispetto al normale, ma per quel particolare cromosoma l’informazione genetica proviene da un solo genitore Le UPD sono in genere dovute a recupero di una trisomia (embrione trisomico che in una fase estremamente precoce dello sviluppo perde un membro della tripletta di omologhi) o di una monosomia (embrione monosomico in cui si ha una duplicazione dell’unico cromosoma presente)

49 Qual è il significato evolutivo dell’imprinting?
Teoria dell’antagonismo tra i genitori (o del conflitto) Teoria dell’antagonismo tra i sessi Teoria del co-adattamento madre-figlio

50 Teoria del conflitto The kinship theory focuses on genes whose expression level governs the extent of some physiological or behavioral interaction between individuals. As an example, fetal expression of a growth factor not only influences the fetus’ development but may also indirectly affect the growth, and potentially the fitness, of siblings through its demand for shared maternal resources. Variation in the fetal expression level of this growth factor gene can have different, and opposing, inclusive fitness effects for the two alleles if these have unequal relatedness to individuals with whom the fetus interacts (for example, because the fetuses are maternal half-sibs, which share matrigenic but not patrigenic alleles) Patten et al. 2014, Heredity