LA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE

Presentazione sul tema: "LA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE"— Transcript della presentazione:

1 LA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE
DEGLI ACIDI NUCLEICI

2 Struttura chimica del DNA
pdTpdGpdCpdA dal 5’ al 3’

3 Struttura chimica dell’RNA pApCpGpU dal 5’ al 3’
L’uracile manca del gruppo CH3 presente nella timina

4 La doppia elica B del DNA vista parallelamente all’asse di fibra

5 La doppia elica B del DNA vista lungo l’asse di fibra

6 Modello con i raggi di van der Waals dell’elica B del DNA

7 Struttura A dell’RNA

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9 Organizzazione strutturale del DNA nel cromosoma

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11 Struttura terziaria del t-RNA

12 anticodone Accettore dell’amminoacido

13 DETERMINAZIONE SPERIMENTALE DELLA PRESENZA DI STRUTTURA SECONDARIA

14 Spettroscopia di dicroismo circolare
Il fenomeno del Dicroismo Circolare (CD) si osserva quando un campione otticamente attivo assorbe in maniera differente la luce circolarmente polarizzata destra rispetto a quella circolarmente polarizzata sinistra. La differenza di assorbimento è piccola (generalmente ) che corrisponde ad una ellitticità di pochi centesimi di grado. Spettri CD relativi a strutture secondarie diverse di peptidi, acidi nucleici e polisaccaridi sono diversi e quindi questa tecnica dà informazioni sulla struttura secondaria di macromolecole biologiche.

15 Spettri tipici di strutture secondarie o disordinate di polipeptidi

16 SPETTRI DI DICROISMO CIRCOLARE DI ALCUNE POTEINE

17 myoglobin

18 Transizione conformazionale di un polipeptide da -elica a gomitolo statistico seguita mediante dicroismo circolare Punto isosbestico

19 Dati simili sono ottenuti per gli acidi nucleici dove l’alto assorbimento dei gruppi aromatici in funzione della presenza di struttura secondaria (doppia elica) permette di utilizzare bene anche la spettroscopia nell’ultravioletto La temperatura di transizione (Tm) di polinucleotidi dipende essenzialmente da tre fattori: 1) Composizione in basi 2) Lunghezza della doppia elica 3) Forza ionica della soluzione