Disordini genomici Lezione 14 By NA.

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1 Disordini genomici Lezione 14 By NA

2 DUPLICAZIONI SEGMENTALI LCR
PMP22 distal CMT1A-REP proximal 24Kb LCR17pA 383Kb LCR17pE ~31Kb SMS-REP LCR17pF ~33Kb middle LCR17pB 191Kb ~200Kb LCR17pC 91Kb LCR17pD LCR17pG CEN 7,4 Mb totale LCR 1,7 Mb (23%) By NA

3 DUPLICAZIONI SEGMENTALI LCR
crom.7 7q11.23 Inversione benigna nel 28% dei genitori ELN C A B cen tel cromosoma deleto C A B cen tel A B C cen tel cromosoma invertito By NA

4 DUPLICAZIONI SEGMENTALI LCR
Cen F8B 1 22 23 26 F8C F8A CpG tel By NA

5 P.Stankiewicz and J.R.Lupski
Genome architecture, rearrangements and genomic disorders TRENDS in Genetics Vol. 18: 74-82, 2002 Disordini genomici Banter syndrome type III 1p36 Gaucher disease 1q21 Fam. juv. nephronophthisis 2q13 Fascioscapulohumeral muscular dystrophy 4q35 Spinal muscular atrophy 5q13.2 Cong adrenal hyperplasia (21 hydroxylase def.) 6p21.3 Glucocorticoid-remediable aldosteronism (GRA) 8q21 Beta-thalassemia 11p15.5 alfa-thalassemia 16p13.3 Polycystic kidney disease p13.3 Charcot-Marie-Tooth (CMT1A) 17p12 Her. neur. with liability to pressure palsies (HNPP) 17p12 Neurofibromatosis type 1 (NFl) 17q11.2 Pituitary dwarfism 17q23.3 CYP2D6 pharmacogenetic trait 22q13.1 Ichthyosis Xp22.32 Red-green color blindness Xq28 Incontinentia pigmenti Xq28 Hemophilia A Xq28 Emery-Dreifuss musc. dystr. Xq28 Hunter syndrome Xq28 By NA

6 Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica
Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

7 Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica
Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

8 SD (in omozigosi) CNV Assenza di dati per questioni tecniche By NA

9 DNA da testare Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

10 DNA da testare Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

11 Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica
Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

12 Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica
Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

13 By NA

14 Duplicazioni segmentali comparazione uomo-scimpanze'
- comuni: 66% (79.8Mb) - scimpanze'-specifiche (11.4Mb) - umano-specifiche: 33% (26.5Mb) By NA 14

15 Differenza media fra 2 individui: circa 20.000.000 bp
Nature 444: (2006). Nature 453:56-64 (2008). Differenza media fra 2 individui: circa bp By NA

16 EVENTO DELL'ANNO 2007 By NA

17 Il significato? Evoluzione: Cambiamento prospettico che ribalta la visione statica. Introduce in tempo come variabile RIVOLUZIONE By NA

18 plasticity = variability evolution perfezione = nessuna prospettiva
evolutiva By NA

19 fixed CNV (SD) CNV By NA

20 fixed CNV (SD) CNV after meiosis before checkpoint By NA

21 PNAS 104: (2007). … Finally, the high level of instability at the alpha-globin locus contrasts with the rarity in most populations of chromosomes carrying duplications or deletions, pointing to strong selective constraints that maintain alpha-globin gene copy number in human populations. By NA

22 PNAS in press Li-Fraumeni syndrome is an autosomal dominantly inherited disorder characterized by a strikingly increased risk of early-onset breast cancer, sarcomas, brain tumors and other neoplasms in individuals harboring germline TP53 mutations. To reconstruct the chromosomal organization of our ancetors By NA

23 To reconstruct the chromosomal organization of our ancetors
By NA

24 Science 320: , 2008 By NA

25 Am J Hum Genet 81: 1057-1069, 2007 Nature Genet 40:1076-1083, 2008.
By NA

26 PNAS 105: , 2007 By NA

27 Variabilita’ ricchezza per la specie
Variabilita’ problemi per i singoli By NA

28 Mr.Spock: Star Trek : L’ira di Khan
E’ la logica :le esigenze dei molti contano di piu’ di quelle dei pochi o di uno Mr.Spock: Star Trek : L’ira di Khan By NA