PROPRIETA’ PRINCIPALI Q UANTITATIVE S TRUCTURE A CTIVITY R ELATIONSHIPS usati come descrittori in studi di.

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1 PROPRIETA’ PRINCIPALI Q UANTITATIVE S TRUCTURE A CTIVITY R ELATIONSHIPS usati come descrittori in studi di

2 Esempio: RELAZIONE fra STRUTTURA MOLECOLARE e RISPOSTA BIOLOGICA vie metaboliche ripartizioni fra biofasi riconoscimento molecolare interazioni recettore-principio attivo

3 variabili CONTINUE temperatura, pressione, tempo, concentrazione … variabili NON CONTINUE sostituenti, solvente, reagenti, catalizzatori… Progettazione di un esperimento scelta e raccolta delle VARIABILI le Variabili si possono distinguere in:

4 PROPRIETA’ PRINCIPALI descrittori (variabili)........................................ k i.................... oggetti (osservazioni) PCA A x ik = x ik + ∑ p ak t ai + e ik a=1 PRINCIPAL PROPERTIES scores di una PCA

5 Vantaggi delle PPs di una PCA 1.Sono ortogonali (per definizione), quindi indipendenti fra loro e utili per la progettazione di un esperimento 2.Sono oggettive e non scelte soggettivamente da un operatore 3.Sono meno influenzate dagli errori di misura e dalle variazioni di sistema, rispetto ai singoli descrittori sperimentali 4.Sono affidabili anche quando vengono ottenute da una matrice con missing data 5.Il numero di PPs è inferiore (o al massimo uguale) al numero dei descrittori

6 PROPRIETA’ PRINCIPALI: sono state ricavate per SOSTITUENTI (parametri sterici ed elettronici) Clementi et al., QSAR, 8, 32 (1989) SOLVENTI (mp, bp, E T, ecc.) Carlson et al., Acta Chem. Scand. (B), 39, 79 (1985) CHETONI (mp, bp, n D, densità, IR, ecc.) Carlson et al., Acta Chem. Scand. (B), 42, 145 (1988) ACIDI DI LEWIS (momenti di dipolo, costante dielettrica, potenziale di ionizzazione, energia di legame, suscettibilità magnetica, ecc.) Carlson et al., Acta Chem. Scand. (B), 40, 522 (1986) AMMINOACIDI (MW, pK, NMR, volume di Van der Waals, dati cromatografici, coefficiente di ripartizione, ecc.) Wold et al., Acta Chem. Scand. (B), 40, 135 (1986)

7 esempio: divisione degli Amminoacidi naturali in base al segno delle prime due e tre PPs - Met + Phe, Trp, Tyr - - Leu, Ile, Ala + Cys. Pro, Val - + - Gly, Thr + Asp, Glu, Ser + - Arg, Lys, His + Asn, Gln + -

8 esempio: uso delle PPs dei sostituenti per uno studio PLS X N A C B PP 1 PP 2 PP 3 A B C PLS Y X