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PubblicatoAlessio Filippi Modificato 9 anni fa
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Sistema EmMa Farm su GRID ENEA Introduzione all'utilizzo del sistema EmMa/Farm su GRID Enea Gino Briganti – ENEA Andrea Cappelletti – ENEA Pietro Marri - ENEA Progetto MINNI Riunione plenaria 4-5 marzo 2010
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Introduzione Obiettivi Illustrare sinteticamente il filesystem e gli scripts EmMa/Farm su GRID Dare uno schema per la preparazione di un nuovo caso Fornire info su spazi e tempi cpu
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Filesystem Qualsiasi nome
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Filesystem La disposizione delle directory è rigida NOTA BENE: La data nel netcdf deve corrispondere alla dir “anno” farm/inp IT0 2005 2005010 2005002 diffemi_IT0_2005002.bin
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Gli scripts Gli scripts sono nidificati, chiamano a loro volta altri scripts che però, per motivi particolari, possono essere lanciati anche individualmente hanno più opzioni sono predisposti per sottomettere dei jobs alle code della GRID ma possono essere utilizzati anche per esegure i calcoli in interattivo Hanno un piccolo help in linea
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EmMa paths setting (indica la root) pulizia..../script_emma/emma.grid.bash clean [zone] [year] preprocessing..../script_emma/emma.grid.bash preproc [zone] [year] modulazione temporale.../script_emma/emma.grid.bash decad [zone] [year] [decads] copia dei files su AFS (eventuale).../script_emma/emma.copy.bash [zone] [year] [decads]
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Farm paths setting e creazione dell'albero in farm/out tree.bash [zone] [year] [root dir] creazione dei file di inizializzazione farm.NxN.loop_ini_files.bash [zone] [year] [decads] (N=4,20) lancio sotto LSF su base mensile farm.bsub.bash [zone] [year] [months] copia su AFS (eventuale) copy.bash [year] [julian start] [julian end] [from dir] [to dir ]
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Nesting Calcolo delle B.C. dal un caso 20x20 farm.4x4.BC.bsub.bash [zones] [years] [months] Concatenazione dei file BC creati in modo che contengano record dalle ore 00 alle 24 farm.4x4.BC.concatenate.bash [zones] [year] Creazione delle I.C. dal caso 20x20 farm.4x4.IC.bash [zones] [year]
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Nuovo caso Creare un nuovo ramo /afs/enea.it/project/ minnifarm Copiare l'intero albero meteoTEST2005 farm/inpTEST2005 meteoIT02005 farm/inpIT02005 /PFS/por/cappelle/ test
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Documentation In /PFS/por/cappelle mihaela soft farm meteo emi bound inp out IT0 CI0 1 mese In..../soft/soft_ARIANET/script_[emma,farm] ci sono dei readme files ove sono spiegate più in dettaglio l'uso degli scripts In /afs/enea.it/project/minnifarm/readme ci sono i log files degli updates eseguiti
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Scenari di Riferimento XXX=IT0,NI0,SI0,SA0,SC0,CI0 YYYY=1999,2005 EMISSIO NI /PFS/por/cappelle/minnifarm/farm/inp/XXX/YYYY CONCEN TRAZIONI DEPOSI ZIONI /PFS/por/briganti/minnifarm/farm/out/XXX/2005 /afs/enea.it/project/minnifarm/farm/out/XXX/1999
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ATM SS=25,50 PPP=PM10,NOx,SO2,NH3,VOC RRR=LAZ,LOM YYYY=2005 (emis) ZZZZ=2005 (meteo) EMISSION I /PFS/por/cappelle/minnifarm/ATM/inp/SS/PPP/RRR/ YYYY CONCEN TRAZIONI DEPOSI ZIONI /PFS/por/briganti/minnifarm/ATM/farm/out/YYYY/ZZ ZZ/SS/PPP/RRR
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SPAZIO & TEMPO CPU Simulazioni di 1 mese Spazio GB CPU time h IT0 Italy 20x202516 CI0 Centro Italia 4x4 60100
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