Transcription termination RNA polymerase I terminates transcription at an 18 base terminator sequence. RNA polymerase III terminates transcription in poly(U)

Presentazione sul tema: "Transcription termination RNA polymerase I terminates transcription at an 18 base terminator sequence. RNA polymerase III terminates transcription in poly(U)"— Transcript della presentazione:

1 Transcription termination RNA polymerase I terminates transcription at an 18 base terminator sequence. RNA polymerase III terminates transcription in poly(U) 4 sequence embedded in a G·C-rich sequence. In pol II transcripts the sequence AAUAAA is a signal for cleavage to generate a 3 end of mRNA that is polyadenylated.

2

3

4 Biologia molecolare - Robert F. Weaver Copyright © 2005 – The McGraw-Hill Companies srl

5 RNA polymerasi II termination The reaction requires a protein complex that contains a specificity factor, an endonuclease, and poly(A) polymerase. The specificity factor and endonuclease cleave RNA downstream of AAUAAA. The specificity factor and poly(A) polymerase add ~200 A residues processively to the 3 end.

6

7

8

9

10

11

12

13 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

14 “Fabbrica dell’RNA” (RNA factory) Interdipendenza tra trascrizione e modificazioni post-trascrizionali Pol II senza CTD inibisce splicing, terminazione e poliadenilazione CPSF e CstF legano il CTD CPSF si trova associato a TFIID

15 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

16 Complessità genoma-proteoma Percentuale di geni con splicing alternativo varia tra 35 e 59 Il gene Dscam di Drosofila (recettore per la guida degli assoni) contiene 95 possibili esoni che fanno splicing alternativo per un totale di 38000 isoforme proteiche possibili Il 15% delle mutazioni che causano malattie genetiche provocano difetti di splicing

17

18 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

19 dsx sxl tra

20 Alternative splicing Specific exons may be excluded or included in the RNA product by using or failing to use a pair of splicing junctions. Exons may be extended by changing one of the splice junctions to use an alternative junction. Alternative splicing may depend on SR proteins or specific factors

21

22 Ruolo della poliadenilazione alternativa stabilità dell'mRNA localizzazione dell'mRNA espressione di proteine diverse regolazione della traduzione

23

24 Figure 2. Regulation of Immunoglobulin Expression Low affinity binding of CstF to the upstream  s site is indicated by a hatched pattern.