MIGRAZIONE Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere.

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1 MIGRAZIONE Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere studiato attraverso due modelli: migrazione regolare da una popolazione molto grande (fr. alleliche stabili) verso una più piccola MODELLO DELL’ISOLA Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere studiato attraverso due modelli: migrazione regolare da una popolazione molto grande (fr. alleliche stabili) verso una più piccola Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere studiato attraverso due modelli: Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni).

2 150/200 = 0.75 50/200 = 0.25 3/12 = 0.25 9/12 = 0.75 m = 0.33

3 150/200 = 0.75 50/200 = 0.25 3/12 = 0.25 9/12 = 0.75 m = 0.33

4 m = 0.33 ( )/200 = 148/200  0.75 (3-1+3)/12 = 5/12  0.42 (50-1+3)/200 = 52/200  0.25 (9-3+1)/12 = 7/12  0.58

5 … dopo molte generazioni
~ 150/200 = 0.75 9/12 = 0.75 ~ 50/200 = 0.25 3/12 = 0.25

6 MODELLO DELL’ARCIPELAGO
MIGRAZIONE Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere studiato attraverso due modelli: migrazione regolare da una popolazione molto grande (fr. alleliche stabili) verso una più piccola MODELLO DELL’ISOLA Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere studiato attraverso due modelli: migrazione regolare da una popolazione molto grande (fr. alleliche stabili) verso una più piccola Flusso di individui da una popolazione a un’altra (fusione di due popolazioni). L’effetto della migrazione sulle frequenze geniche può essere studiato attraverso due modelli: un gruppo di popolazioni, parzialmente isolate tra loro, che si scambiano tra loro individui un gruppo di popolazioni, parzialmente isolate tra loro, che si scambiano tra loro individui MODELLO DELL’ARCIPELAGO

7 3/12 = 0.25 9/12 = 0.75 5/12  0.42 7/12  0.58

8 … dopo molte generazioni
6/12 = 0.5 6/12 = 0.5 6/12 = 0.5 6/12 = 0.5

9 MIGRAZIONE: modello dell’isola
Limitazioni del modello: I flussi migratori da e per l’isola devono essere uguali. La migrazione deve essere costante nel corso delle generazioni. Non vi è migrazione differenziale per genotipo. Isola  fr. (A1) = p e fr. (A2) = q Continente  fr. (A1) = p e fr. (A2) = q Limitazioni del modello: I flussi migratori da e per l’isola devono essere uguali. La migrazione deve essere costante nel corso delle generazioni. Non vi è migrazione differenziale per genotipo. Limitazioni del modello: I flussi migratori da e per l’isola devono essere uguali. La migrazione deve essere costante nel corso delle generazioni. Non vi è migrazione differenziale per genotipo. Isola  fr. (A1) = p e fr. (A2) = q Limitazioni del modello: I flussi migratori da e per l’isola devono essere uguali. La migrazione deve essere costante nel corso delle generazioni. Limitazioni del modello: I flussi migratori da e per l’isola devono essere uguali. Limitazioni del modello: (1  m) = individui che restano sull’isola q = frequenza dell’allele A2 negli individui che restano sull’isola m = individui immigrati dalla popolazione generale q = frequenza dell’allele A2 negli individui immigrati (1  m) = individui che restano sull’isola q = frequenza dell’allele A2 negli individui che restano sull’isola (1  m) = individui che restano sull’isola (1  m) = individui che restano sull’isola q = frequenza dell’allele A2 negli individui che restano sull’isola m = individui immigrati dalla popolazione generale

10 MIGRAZIONE: modello dell’isola
La frequenza dell’allele A2 nell’isola dopo una generazione sarà: q’ = (1  m) q  mq La differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’  q = (1  m) q  mq  q = = (1  m) q  q (1  m) = (1  m) (q  q) La frequenza dell’allele A2 nell’isola dopo una generazione sarà: q’ = (1  m) q  mq La differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’  q = (1  m) q  mq  q = = (1  m) q  q (1  m) La frequenza dell’allele A2 nell’isola dopo una generazione sarà: q’ = (1  m) q  mq La differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’  q = (1  m) q  mq  q = La frequenza dell’allele A2 nell’isola dopo una generazione sarà: q’ = (1  m) q  mq La differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’  q La frequenza dell’allele A2 nell’isola dopo una generazione sarà: q’ = (1  m) q  mq

11 MIGRAZIONE: modello dell’isola
Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = = (1  m)[(1  m)q  mq]  mq  q = = (1  m)2 q  (1  m)mq  mq  q = = (1  m)2 q  mq  m2q  mq  q = = (1  m)2 q  q (m2  2m  1) = = (1  m)2 q  q (1  m)2 = Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = = (1  m)[(1  m)q  mq]  mq  q = = (1  m)2 q  (1  m)mq  mq  q = = (1  m)2 q  mq  m2q  mq  q = = (1  m)2 q  q (m2  2m  1) = = (1  m)2 q  q (1  m)2 = = (1  m)2 (q  q) Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = = (1  m)[(1  m)q  mq]  mq  q = = (1  m)2 q  (1  m)mq  mq  q = = (1  m)2 q  mq  m2q  mq  q = = (1  m)2 q  q (m2  2m  1) = Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = = (1  m)[(1  m)q  mq]  mq  q = = (1  m)2 q  (1  m)mq  mq  q = = (1  m)2 q  mq  m2q  mq  q = Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = = (1  m)[(1  m)q  mq]  mq  q = Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq e la differenza delle frequenze tra l’isola e il continente è q’’  q = (1  m) q’  mq  q = = (1  m)[(1  m)q  mq]  mq  q = = (1  m)2 q  (1  m)mq  mq  q = Dopo un’altra generazione la frequenza dell’allele A2 nell’isola sarà: q’’ = (1  m) q’  mq

12 MIGRAZIONE: modello dell’isola
Analogamente, dopo n generazioni la deviazione tra la frequenza dell’isola e quella del continente sarà: qn  q = (1  m)n (q  q) La deviazione tra la frequenza dell’isola e quella del continente diminuisce a ogni generazione di un fattore (1  m), quindi è chiaro che l’avvicinamento all’equilibrio (stesse frequenze tra isola e continente, cioè quelle del continente) è tanto più rapido quanto maggiore è il tasso di migrazione m. Analogamente, dopo n generazioni la deviazione tra la frequenza dell’isola e quella del continente sarà: qn  q = (1  m)n (q  q)

13 MIGRAZIONE: modello dell’isola

14 q = 0.63 (frequenza di R0 negli africani occidentali attuali)
Esempio: l’aplotipo R0 del sistema Rh ha una frequenza del 63% negli africani e del 3% negli europei. Esempio: l’aplotipo R0 del sistema Rh ha una frequenza del 63% negli africani e del 3% negli europei. Qual è il tasso di migrazione genica dagli europei agli africani nell’attuale popolazione afroamericana degli USA? q = (frequenza di R0 negli africani occidentali attuali) q = (frequenza di R0 negli europei attuali) n = (africani occidentali sono stati deportati in USA circa anni fa come schiavi) q10 = 0,45 (frequenza di R0 negli afroamericani attuali) q = (frequenza di R0 negli africani occidentali attuali) q = (frequenza di R0 negli europei attuali) n = (africani occidentali sono stati deportati in USA circa anni fa come schiavi) q = (frequenza di R0 negli africani occidentali attuali) q = (frequenza di R0 negli europei attuali) q = (frequenza di R0 negli africani occidentali attuali)

15 qn  q = (1  m)n (q  q) 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42
diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42 ——— = (1  m)10 0.60 0.7 = (1  m)10 10 ln (1  m) =   ln (1  m) =  qn  q = (1  m)n (q  q) diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42 ——— = (1  m)10 0.60 0.7 = (1  m)10 10 ln (1  m) =   ln (1  m) =  1  m = qn  q = (1  m)n (q  q) diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42 ——— = (1  m)10 0.60 0.7 = (1  m)10 10 ln (1  m) =   ln (1  m) =  1  m =  m = 0.035 qn  q = (1  m)n (q  q) diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42 ——— = (1  m)10 0.60 0.7 = (1  m)10 10 ln (1  m) =  qn  q = (1  m)n (q  q) diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42 ——— = (1  m)10 0.60 0.7 = (1  m)10 qn  q = (1  m)n (q  q) diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) qn  q = (1  m)n (q  q) diventa 0.45  0.03 = (1  m)10 (0.63  0.03) 0.42 ——— = (1  m)10 0.60 qn  q = (1  m)n (q  q)

16 Il tasso di migrazione genica dagli europei agli africani nell’attuale popolazione afroamericana degli USA è m = 0.035 cioè a ogni generazione il 3,5% di geni europei entra a far parte del pool di geni della popolazione degli USA.

17 MIGRAZIONE: modello dell’arcipelago
Un gruppo di popolazioni, ben delimitate nello spazio, che si scambiano migranti a ogni generazione. Per esempio m 1 4 3 2

18 MIGRAZIONE: modello dell’arcipelago
Limitazioni del modello: I tassi di emigrazione e immigrazione devono essere costanti tra una coppia di isole Le isole dell’arcipelago hanno tutte la stessa consistenza.

19 MIGRAZIONE: modello dell’arcipelago
Matrice di scambio migratorio tra k popolazioni 1 ... i k 2 3 Gli elementi sulla diagonale rappresentano la frazione di individui che non migra, cioè gli individui stanziali

20 Arcipelago a due isole Poniamo Dopo una generazione:

21 Arcipelago a due isole E dopo due generazioni

22 Arcipelago a due isole Tornando alla prima generazione notiamo che (moltiplicando tutti i termini per m12 e m21) avremo: Sommando tutti i membri di sinistra e di destra

23 Arcipelago a due isole E ancora:
Dato che le frequenze di migrazione nei due sensi sono state assunte costanti per generazione, allora: e quindi anche

24 Arcipelago a due isole Se dividiamo il membro di destra per
otteniamo le frequenze geniche medie, cioè la frequenza dell’allele A2 all’equilibrio

25 Arcipelago a tre isole 1 3 2 Limitazioni del modello:
I tassi di emigrazione e immigrazione devono essere costanti e uguali tra le isole Le isole dell’arcipelago hanno tutte la stessa consistenza.

26 Arcipelago a tre isole Riprendiamo la frequenza dell’allele A2 all’equilibrio. In caso di migrazione uguale tra le due isole sarà Quindi per tre isole sarà

27 Arcipelago a tre isole Dove q all’equilibrio sarà
e quindi sommando membro a membro

28 Arcipelago a n isole Estrapolando per n isole