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Basi biomolecolari delle attività motorie
Corso di Laurea in Scienze Motorie AA Basi biomolecolari delle attività motorie Docenti: Antonio ACETO, Mario FELACO.
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Recapito ed informazioni
Dipartimento di Scienze Biomediche Sezione di Biochimica 2° piano blocco delle segreterie Telefono:
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CHIMICA, PROPEDEUTICA BIOCHIMICA
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L’atomo Grandezza: 1/100.000.000 cm
Massa: 1gr H ≈ atomi
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Le particelle fondamentali
Particella Simbolo Carica Massa approssimativa (Peso in uma)* Posizione nell’atomo Protone p o p+ +1 1 Nel nucleo Elettrone e o e- -1 1/1837 Fuori del nucleo Neutrone n o n0 * uma: unità di massa atomica
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Composizione dell’atomo di idrogeno
H 1 e- 0 n0
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Composizione dell’atomo di elio
He 2 e-
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Composizione dell’atomo di carbonio
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Composizione dell’atomo di azoto
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Composizione dell’atomo di ossigeno
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Rappresentazione simbolica dell’atomo
Simbolo Numero di massa Numero atomico C 6 12 C 6 14 isotopi
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STRUTTURA DELL’ATOMO La traiettoria dell’elettrone e’ determinata dalla meccanica quantistica
1) le orbite degli elettroni sono chiamate orbitali 2) gli orbitali sono funzioni di probabilita’: rappresentano dove si trova l’e- con maggior probabilta’ 3) l’e- non si trova in qualunque punto dello spazio ma solo su orbitali discreti anche se infiniti 4) su ogni orbitale vi possono essere al massimo due e- con spin opposto
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ORBITALI SFERICI DI TIPO S L’1s e’ l’orbitale più vicino al nucleo.
Sempre più lontano dal nucleo si hanno il 2s, 3s……ns n= numero quantico principale
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ORBITALI tipo p vi sono tre orbitali tipo p, px, py, pz per ogni numero quantico principale n, a partire da n=2.
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Altri esempi di orbitali atomici
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IDROGENO H un solo e- sull’orbitale 1S configurazione elettronica: 1s1
HELIO He due e- sull’orbitale 1S configurazione elettronica: 1s2
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Gli orbitali s sono riempiti prima degli orbitali p
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TAVOLA PERIODICA CORTA
LA RIGA CHE INIZIA CON H CORRISPONDE AL PRIMO PERIODO (GUSCIO N=1), QUELLA CHE INIZIA CON Li AL SECONDO (GUSCIO N=2), CON Na AL TERZO (GUSCIO N=3), K AL QUARTO (GUSCIO N=4), ETC. I GRUPPI (COLONNE VERTICALI VERDI) 1 E 2 POSSEGGONO ORBITALI ESTERNI DI TIPO S. I GRUPPI DAL 3 ALL’8 (COLONNE VERTICALI CELESTI) POSSEGGONO ORBITALI ESTERNI DI TIPO P. ALLE SERIE DI LANTANIDI E ATTINIDI, CON RIEMPIMENTO DEGLI F. I GRUPPI 1 E 2 (COLONNE VERTICALI VERDI) POSSEGGONO ORBITALI ESTERNI DI TIPO S. GLI ELEMENTI DELLA TERZA COLONNA (TRA 2 E 3 COLORE GRIGIO) POSSEGGONO ORBITALI DI TIPO D E DANNO INIZIO ALLA SERIE DEGLI ELEMENTI DI TRANSIZIONE OPPURE
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GLI ATOMI INTERAGISCONO FRA DI LORO: LEGAMI MOLECOLARI
Legame ionico NaCl Na Cl Na Cl +
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Legame ionico MgCl2 Cl Cl Mg Mg 2 + Cl Cl
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Legame covalente Cl2 Cl Cl Cl Cl +
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Legame covalente O2 O O O +
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Legame covalente N2 N + N
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Legame covalente CO2 O O C + + O C
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Legame covalente NH3 N H H H + + + N H
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Legame covalente H2O H O H + + H O
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FORZA DEI LEGAMI INTERAZIONI FORTI: 10-100 kcal/mole
1) LEGAME IONICO 2) LEGAME COVALENTE 3) LEGAME DATIVO ( in presenza di un doppietto elettronico) INTERAZIONI DEBOLI: 1-10 kcal/mole 1) van der Waals 2) Legame idrogeno
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Simbolo: N 6.0221367x1023 particelle/mol Numero di Avogadro
1 protone o 1 neutrone ≈ 1/(6x1023)grammi 1 grammo di protoni ≈ 6x1023 protoni Simbolo: N x1023 particelle/mol
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Numero di atomi in un numero di grammi pari al PA
Grammoatomo Elemento Simbolo p n e Numero atomico Peso atomico Numero di atomi in un numero di grammi pari al PA Idrogeno H 1 6.02 x 1023 Carbonio C 6 12 Azoto N 7 14 Ossigeno O 8 16
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Numero di particelle in un numero di grammi pari al PM
Grammomolecola* Molecola Simbolo Peso molecolare Numero di particelle in un numero di grammi pari al PM Idrogeno H2 2 6.02 x 1023 Ossigeno O2 32 Acqua H2O 18 Metano CH4 16 Ammoniaca NH3 17 Anidride carbonica CO2 44 Glucosio C6 H12O6 180 * Grammomole o mole
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H2 + = H2O ½O2 La mole 2gr 16gr 18gr 1 mole ½ mole 1 mole
6.02 x x x 1023 1 mole ½ mole mole
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Concentrazione (una qualità delle soluzioni)
Quantità di soluto C = Quantità di soluzione o solvente
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Percentuali (p/V) Grammi di soluto %p/V = 100 ml soluzione
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Molarità n mol. di soluto M = l litri di soluzione
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Molalità m n mol. di soluto = 1000 grammi di solvente
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Soluti soluti Elettroliti Non-elettroliti Forti Deboli
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non si dissociano in ioni
Non-elettroliti Sostanze solubili che non si dissociano in ioni GLUCOSIO UREA
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Sostanze solubili che si dissociano in ioni
Elettroliti Sostanze solubili che si dissociano in ioni XY X- + Y+ xy x- + y+
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XY X- + Y+ AH A- + H+ Basiforti BOH OH- + B+ AB A- + B+ sali
Elettroliti forti XY X- + Y+ Acidiforti AH A- + H+ Basiforti BOH OH- + B+ AB A- + B+ sali Acidi = sostanze che dissociano ioni idrogeno H+ Basi = sostanze che dissociano ioni ossidrile OH- Sali = sostanze ottenute dalla reazione (neutralizzazione) di un acido ed una base, con formazione di acqua: AH + BOH ----- AB + H2O
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xy x- + y+ aH a- + H+ acidideboli bOH OH- + b+ basideboli
Elettroliti deboli xy x- + y+ aH a- + H+ acidideboli bOH OH- + b+ basideboli
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v1= v2 R’ + R’’ P’ + P’’ v1= k1[R’] [R’’] ; v2= k2[P’] [P’’]
Reazioni reversibile k1 R’ + R’’ P’ + P’’ k2 v1= k1[R’] [R’’] ; v2= k2[P’] [P’’] v1= v2 k1[R’] [R’’] = k2[P’] [P’’]
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Keq = k1 [P’] [P’’] k2 [R’] [R’’] Equilibrio
k1[R’] [R’’] = k2[P’] [P’’] k [P’] [P’’] k [R’] [R’’] = Keq
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Equilibrio di dissociazione
xy x + y [x] [y] [xy] = Kdiss
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Dissociazione acido debole
aH a- + H+ [a-] [H+] [aH] = Ka Dissociazione base debole bOH b+ + OH- [b+] [OH-] [bOH] = Kb Ka: misura la forza di un acido debole
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Dissociazione dell’acqua
H2O H+ + OH- [H+] [OH-] [H2O] = Kdiss
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Prodotto ionico dell’acqua
[H+] [OH-] [H2O] = Kdiss=1,8x10-16 Kdiss[H2O]=[H+] [OH-] 1,8x10-16x55 =[H+] [OH-] Kw=[H+] [OH-]= 10-14 Kw= 10-7 x 10-7= 10-14
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pKw = pH+pOH 14 = 7 + 7 -log10(10-14) = -log10(10-7)- log10(10-7)
Passando ai logaritmi Kw =[H+] [OH-] -log10 Kw = -log10 [H+] - log10 [OH-] -log10(10-14) = -log10(10-7)- log10(10-7) Se poniamo -log10 = p pKw = pH+pOH 14 =
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Acidità delle soluzioni
pH = -log10 [H+] acide neutre basiche [H+]=10-7 [H+]=10-14 [H+]=100 pH=7 pH=14 pH=0 Il pH misura l’acidità di una soluzione NB: il pH non esprime la forza di acidi e basi, che dipende invece da Ka o Kb
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Domande Cosa può far modificare il pH di una soluzione ?
Come si calcola il pH di una soluzione ?
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Cosa può far modificare il pH ?
diminuire il pH aumentare il pH H+ OH- Kw=[H+] [OH-] H+ OH- Quindi il pH si modifica… … o per aggiunta di ioni H+ (acidi) o OH- (basi) … o per sottrazione di ioni H+ (sali basici) o OH- (sali acidi)
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pH= -log[H+] =-log 0,01 =2 pH acido forte pH=2 [HCl]=0,01M; pH?
HCl H+ + Cl- Conc. t0 ; 0, Conc. tf ; ,01 0,01 pH= -log[H+] =-log 0,01 =2
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pOH= -log[OH-] =-log 0,01 =2 pH=14- pOH=12 pH base forte pH=12
[NaOH]=0,01M; pH? NaOH Na+ + OH- Conc. t0 ; 0, Conc. tf ; , ,01 pOH= -log[OH-] =-log 0,01 =2 pH=14- pOH=12
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pH acido debole aH a- + H+ [a-] [H+] [aH] = Ka
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Grado di dissociazione
mol. dissociate mol. totali aH a- + H+ t0: c teq: (1-a)c ac ac
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= Ka = Ka (ac)2 c Ka c= (ac)2 ac= Ka c =[H+] pH ac. debole [a-] [H+]
ac x ac (1-a)c = Ka (ac)2 c Ka c= (ac)2 ac= Ka c =[H+]
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Ka c pH= -log pH= -log pH= -log =3.37 pH acido debole
[CH3-COOH]=0,01M; pH? CH3-COOH H+ + CH3-COO- pH= -log Ka c pH= -log 1,8 x 10-5 x 0,01 pH= -log 1,8 x 10-7 =3.37
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in generale… Ka c -log pH= per un acido debole
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pH base debole -log Kb c pOH= +log Kb c pH=14
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CALCOLARE IL pH DEI SEGUENTI ACIDI FORTI:
HCl Acido cloridrico M pH=? HNO Acido nitrico M pH=? HCl Acido cloridrico M pH=? pH=1 pH=6
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CALCOLARE IL pH DEI SEGUENTI ACIDI DEBOLI:
CH3COOH Acido acetico C= 10-1 M Ka= 10-5 M -log Ka C = -log 10-5 x 10-1 = -log 10-6 = -log 10-3 = 3log10 10 = ? pH = 3 calcolare a HCN Acido cianidrico C= Ka= 6.08 x M -log Ka C = -log 10-11 x 10-1 = -log 10-12 = -log 10-6 = 6log10 10 = ? pH = 6 calcolare a H2CO Acido carbonico (diprotico) C= Ka= 4.5 x 10-7 10-7 M Prima dissociazione -log Ka C = -log 10-7 x 10-1 = -log 10-8 = -log 10-4 = 4log10 10 = ? pH = 4
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ACIDI ORGANICI ED INORGANICI
FORMULA DENOMINAZIONE 1. Idracidi HF Ac. Fluoridrico HCl Ac. Cloridrico HBr Ac. Bromidrico HI Ac. Iodidrico 2. Ossiacidi H2SO4 Ac. Solforico HNO3 Ac. Nitrico H2CO3 Ac. Carbonico H3PO4 Ac. (orto) fosforico 3. Tioacidi H2S Ac. Solfidrico 4. Acidi organici H-COOH Ac. Formico CH3-COOH Ac. Acetico CH3-CHOH-COOH Ac. lattico ACIDI ORGANICI ED INORGANICI
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Classificazione dei sali
AH aH BOH BA Ba bOH bA ba
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NaCl NaCl Cl- + Na+ + + HOH H+ + OH- HCl NaOH
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BA BA A- + B+ + + HOH H+ + OH- AH BOH
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quindi... …un sale proveniente dalla reazione di una base forte con un acido forte non modifica il pH
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CH3COONa CH3COONa CH3COO- + Na+ + + HOH H+ + OH- CH3COOH NaOH
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Ba Ba a- + B+ + + HOH H+ + OH- aH BOH
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quindi... …un sale proveniente dalla reazione di una base forte con un acido debole provoca una aumento del pH (idrolisi basica)
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NH4Cl Cl- + NH4+ NH4Cl + + HOH H+ + OH- HCl NH4 OH
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bA A- + b+ bA + + HOH H+ + OH- AH bOH
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quindi... …un sale proveniente dalla reazione di una base debole con un acido forte provoca un abbassamento del pH (idrolisi acida)
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HOH H+ + OH- CH3COONH4 + + CH3COOH Ka Kb CH3COO- + NH4+ CH3COONH4
NH4OH
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ba ba a- + b+ + + HOH H+ + OH- Ka Kb aH bOH
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quindi... …un sale proveniente dalla reazione di una base debole con un acido debole provoca una variazione di pH che dipende dai valori Ka e Kb...
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…ossia se: Ka >Kb idrolisi acida (pH più basso)
Ka =Kb idrolisi neutra (pH invariato) Ka <Kb idrolisi basica (pH più alto)
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idrolisi salina Ba a- + B+ HOH H+ + OH- aH BOH HOH + a- + H+ H+ + aH +
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Keq= Keq [HOH] = Ki = Costante d’idrolisi HOH + a- aH OH- [aH] [OH-]
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Ki Kw [aH] [OH-] [a-] Ki = [H+] 1 Ka [aH] [OH-] [a-] Ki = = Kw Ka
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mol. idrolizzate X= mol. totali t0: c 0 0 teq: (1-X)c Xc Xc HOH + a-
Grado d’idrolisi X= mol. idrolizzate mol. totali HOH + a- aH OH- t0: c teq: (1-X)c Xc Xc
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Se X è molto più piccolo di 1 si può trascurare
pH idrolisi [aH] [OH-] [a-] Ki = t0: c teq: (1-x)c xc xc HOH + a- aH + OH- (xc)2 (1-x)c Ki = c (xc)2 Ki = Se X è molto più piccolo di 1 si può trascurare [OH-]= Ki c pOH = -log Ki c
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Qual è il valore del pH di una soluzione contenente 2g di cianuro di potassio KCN (PM= 65) in 75ml. K a HCN= 1*10-10 KCN K+ + CN- CN- + H2O HCN + OH- Ke = [HCN] [OH-] / [CN-] [H2O] Ki = Ke [H2O]= [HCN] [OH-] / [CN-] Da cui OH- = Ki * Cs [CN-]= Cs= (grammi/PM) (1000/75)= (2/65) (1000/75)= 0.41moli/L OH- = Ki * Cs= (Kw/Ka) * Cs= (10-14 / 10-10) * 0.41= 7.4*10-3 g ioni/L pOH= 2.13 pH= = 11.87
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CALCOLARE IL pH DELLE SEGUENTI BASI FORTI:
NaOH (Na=23; O=16; H=1) Idrossido di sodio 4gr/L M=? pH=? KOH (K=39; O=16; H=1) Idrossido di potassio 5.6gr/L M=? pH=? NaOH (Na=23; O=16; H=1) Idrossido di sodio mg/L M=0.1 pH=13 M=0.1 pH=13 M=10-6 pH=8 pH= 14-pOH
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CALCOLARE IL pH: NH3 • H2O NH4+ + OH- pOH = 3 pH = 14-pOH
NH3 ammoniaca C= 10-1 M Kb 10-5 M -log Kb C = -log 10-5 x 10-1 = -log 10-6 = -log 10-3 = 3log10 10 = ? pOH = pH = 14-pOH pH=11 NH3 ammoniaca C= 1 mM Kb 10-5 M -log Kb C = -log 10-5 x 10-3 = -log 10-8 = -log 10-4 = 4log10 10 = ? pOH= pH = 14-pOH pH=10 NH3 ammoniaca C= 10 mM Kb 10-5 M -log Kb C = -log 10-5 x 10-5 = -log 10-10 = -log 10-5 = 5log10 10 = ? pOH= pH = 14-pOH pH =9
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Attività enzimatica e pH
2 4 6 8 10 pH Attività relativa Papaina Colinesterasi Pepsina Tripsina
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Alcuni reazioni possono modificare il pH
C6H12O CH3CHOHCOOH C6H12O6 + 6O CO2 + 6H2O CO2 + H2O H2CO3
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se diminuiscono gli H+…
se aumentano gli H+… …una trappola di H+potrebbe minimizzare l’effetto sul pH se diminuiscono gli H+… …un serbatoio di H+potrebbe minimizzare l’effetto sul pH
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Ba a- + B+ H+ + a- aH dove si trova a-? si dissocia dai sali
la trappola H+ + a- aH dove si trova a-? Ba a- + B+ si dissocia dai sali
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perché si dissocia quando serve
il serbatoio aH + a- H+ perché un acido debole? perché si dissocia quando serve
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il tampone aH serbatoio + a- H+ trappola acido sale + a- H+ trappola
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cs ca Ka = [aH] [H+] Ka = [a-] [H+] Ka = pH soluzione tampone
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cs ca = Ka [H+] cs ca -log[H+] -logKa = -log ca cs pH pKa = + log
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pH soluzione tampone = pKa pH ca cs +log
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serbatoioH trappola- + H+
tampone aH a-+H+ serbatoioH trappola- + H+ acidoH sale- + H+ acidoH base- + H+
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Calcolare il pH di un sistema tampone formato da un litro di soluzione 0.01 di acido acetico (Ka= 1.85x10-5 M) e 0.01 M di acetato di sodio. pH= pK + log Cs/Ca pH= log 0.01M/0.01 M = 4.74 Calcolare il PH di una soluzione tampone in cui sono presenti 40mM di H2PO4- (Ka = 6.2x10-8) e 20 mM HPO-- pH = pK – log (0.04/0.02) = 7.21 – 0.30 = 6.91 (tampone biologico) Calcolare il pH di un sistema tampone formato da un litro di soluzione 0.1 M di acido acetico (Ka=1.85x10-5 M) e 0.1 M di acetato di sodio. pH= pK + log Cs/Ca pH= log 0.1M/0.1 M = 4.74 Dopo aggiunta di 0.001M di HCl qual’ è il pH = ? pH= pK + log / = pH= pK + log 0.09/0.101= pH= pK + log 0.89= 4.74 – 0.05 = 4.69 quale sarebbe stato il pH di una soluzione acquosa contenente M HCl ?
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DIPENDENZA DALLA CONCENTRAZIONE.
Ripetere lo stesso esercizio con un tampone meno concentrato (acido acetico e aceto di sodio 0.01M) con l’aggiunta di 0.001M di HCl pH= pK + log / = pK + log 0.009/0.011= pK + log = 4.74 – = 4.653 PER IL MAX POTERE TAMPONANTE LA CONCENTRAZIONE DELL’ACIDO E DELLA BASE DEVONO ESSERE UGUALI. Esercizio : pH del tampone con Acido acetico 0.1 M e acetato di sodio 0.01 M pH= pK + log Cs/Ca pH= log 0.01M/0.1 M = log10-1 = 3.74 con aggiunta di M HCl pH=? pH= pK + log Cs/Ca pH= log 0.01M/0.1 M= log 0.009/0.101 = log 0.089= = 4.74 – 1.05 = 3.69
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