FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori.

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1 FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori Attivatori inducibili

2 Agente regolatore Modulo ConsensusFattore Grandezza (dalton) Shock termico Glucocorticoidi Cadmio TPA Siero HSE GRE MRE TRE SRE CNNGCCNNTCCNNG TGGTACAAATGTTCT CGNCCCGGNCNC TGACTCA CCATATTAGG HSTF Recettore ? AP1 SRF 93,000 94,000 ? 39,000 52,000 Gli attivatori inducibili legano: elementi di risposta che identificano gruppi di promotori, o enhancer soggetti a controllo coordinato

3 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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8 I FATTORI DI TRASCRIZIONE (ATTIVATORI) HANNO UN STRUTTURA MODULARE COMPOSTA DA DIFFERENTI DOMINI legame al DNA transattivazione dimerizzazione legame al ligando

9 Domini di transattivazione Domini acidici: es. GAL4 Domini ricchi di glutammine: es. Sp1 Domini ricchi di proline: es. CTF

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15 Famiglie di fattori di trascrizione Dita di zinco (zinc finger) Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) Elica-ansa-elica (helix loop helix, bHLH) Cerniera di leucina (leucine zipper, bZIP)

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24 Terminazione della trascrizione nei procarioti

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26 Un terminatore intrinseco è costituito da due regioni palindromiche che formano una forcina di 7-20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U.

27 C G C A G C A G C A G C A U G C A U GC A U U U A U A U A U G A U G A U G -OH U G A U G C A U G C A U G C A U G C A U G C U C... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC GTTTT CAAAA AAAAAA TTTTTT A T G A C T G C G U C CC UUUUUU 5' 3' -OH 5' 3'... T T A A U G C G C C A C A C A U C G A U C G GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 5' 3' 5' 3' G C G UUUUUUUU -OH... G C G C C CCCA C A C A U C G A U C G Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente)

28 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G

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31 Antiterminazione

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37 Attenuazione

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40 Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

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50 Peptidi "leader" degli operoni "attenuati" codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi

51 Terminazione negli eucarioti

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54 La poliadenilazione degli mRNA eucariotici

55 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 CPSF riconosce seq. AAUAAA CstF lega GU, stimola CFI, CFIIendonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein