Esercitazione 1 www.uniprot.org.

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1 Esercitazione 1 www.uniprot.org

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18 Esempio Quante sono le proteine di uomo più lunghe di 10000 aminoacidi?

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25 Esempio Quante sono le proteine di uomo e topo depositate in swissprot dallinizio di questanno ?

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31 Esempio E quelle solo di topo?

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34 Esempio Di queste quante sono quelle la cui esistenza è realmente provata?

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37 Esempio Quante sono le proteine di membrana?

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39 Esempio Scaricare una lista di proteine

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44 Lista.txt

45 Campi ricercabili Data di Creazione Lunghezza della Sequenza EC number Specie (14.000 Human; 10.000 Yeast; 8.000 Coli; 5000 Rat; 3000 Drosophila) Classificazione (99.000 bacteria; 100.000 Eukaryota; 50.000 Vertebrata; 17.000 Primates) Commenti -> 109.000 Subcellular Location (Nulceus,cytoplasm, mitochondrion, membrane) 20.000 Tissue (Liver, Skeleton, Heart Skin, Blood) 71.000 Catalytic activity 28.000 Cofactor (zinc, iron, heme, calcium) 13.000 Post Transcriptional Modification 73.000 Subunit (monomer,heterodimer, homodimer, homotetramer) 2.500 Disease Features -> 30.000 Active sites, 21.000 Metal, 29.000 Transmembrane, 21.000 Signal 15.000 Mod_res, 60.000 DNA bind, 16.000 Disulfid, 16.000 Carbohyd Per rifinire-> Nome proteina, Nome gene, Identificativo

46 20 Questions E un Europeo? SI E un politico? SI E un contemporaneo? NO E morto di vecchiaia? NO E di un vertebrato? NO E un enzima? SI E una proteina di membrana? NO E più lunga di 100 aminoacidi? SI about a protein

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