Indagine sul Calcolo HPC INAF – Direzione Scientifica Unita VI ICT Giuliano Taffoni – Ugo Becciani.

Presentazione sul tema: "Indagine sul Calcolo HPC INAF – Direzione Scientifica Unita VI ICT Giuliano Taffoni – Ugo Becciani."— Transcript della presentazione:

1 Indagine sul Calcolo HPC INAF – Direzione Scientifica Unita VI ICT Giuliano Taffoni – Ugo Becciani

2 Unita’ VI ICT Unita’ della Direzione Scientifica (08/2013) Responsabile R. Smareglia Attivita’…tra le altre: – Sviluppo ICT connesso all’attivita’ scientifica dell’ente – Servizio all’utenza tecnico/scientifica – Relazioni esterne

3 Sviluppo ICT Infrastrutture di calcolo – High performance computing – High throughput computing – Cloud/grid infrastructures Archivi scientifici Software di riduzione e analisi dati

4 Cosa fare? Individuare le necessita’ dell’ente

5 Come farlo? Questionari su aspetti diversi legati alle attivita’ della commissione calcolo e del gruppo GCSI

6 Indagine interna all’INAF Autunno 2013 – Software scientifico (Bianca Garilli) – Necessita’ di calcolo – Scelte e necessita’ sistemistiche delle strutture – Archivi e cataloghi – Possibili sviluppi futuri

7 Indagine sul calcolo

8 Cosa cercavamo di capire? Risorse calcolo e storage Come sono finaziate le risorse Risorse per progetti specifici Coinvolgimento dei ricercatori/tecnologi Quali tipi di codice sono sviluppati Quali sono le prospettive per il futuro

9 Quali sono stati i risultati? Analisi Generale Utilizzano cluster locali del mio istituto Utilizzano cluster locali di altri istituti Utilizzano sistemi distribuiti Utilizzano sistemi di grandi dimensioni (IBM BGQ – Cluster con oltre 1000 CPU) 38% 33% 30% 20% I programmi di calcolo hanno bisogno di grandi dimensioni di data storage ? Richiesti 2,660 TB

10 Chi sono i finaziatori? Le ricerche che prevedono calcolo sono condotte in ambito di progetti finanziati da Nessuno INAF ASI Altri istituti di Ricerca (Università, CNR, ecc) MIUR Unione Europea Collaborazioni internazionali Punto di forza: capacità generalizzata di ottenere finanziamenti ( 80%) Punto di debolezza: solo il 15% sono risorse UE e 70% risorse INAF e da Collaborazioni 20% 40% 20% 5% 18% 15% 30%

11 E ancora… Esistono dei sistemi di calcolo dedicati a Progetti specifici ? SI (60%) Quale futuro? Mainframe (> 1000 CPU/core) Acceleratori Grafici (GPUs) Cloud Computing Cloud Data Calcolo distribuito (grid) 30% 20% 5% 20% 15%

12 Questioni aperte Riteniamo di avere sufficienti risorse di calcolo HPC per gli obiettivi scientifici/tecnologici ? Partecipiamo a call di programmi grant per l’assegnazione di risorse di calcolo? Quali politiche adottare per HPC e HTC?

13 Pero’…. Siamo bravi: 159 Milioni di ore calcolo equivalenti per CPU/core BGQ Cineca assegnate nel 2013 per programmi di ricerca – 53 Milioni OATO, 50 Milioni OAPA, 20 Milioni OATS – OATO+OACT hanno una assegnazione straordinaria a carico INAF/ASI per 70 Milioni di ore

14 Nuove indagine Approfondire l’indagine conoscitiva Focalizzare su aspetti specifici – HPC – HTC – Cloud

15 Indagine su HPC Quali obiettivi? Individuare necessita’ per il triennio. – Tipologia di risorse (produzione, test, sviluppo) – Necessita’ di storage – Difficolta’ incontrate nell’uso delle risorse utilizzate – Tipo di supporto tecnico se richiesto – Quali prospettive per il triennio?

16 Strutture interessate 9 Strutture INAF hanno espresso interesse per i programmi HPC – OA Bologna – OA Roma – OA Trieste – IRA Bologna – OA Capodimonte Napoli – OA Torino – OA Catania – OA Arcetri Firenze – OA Palermo

17 Programmi di ricerca -Complessivamente >= 16 Programmi di ricerca già attivi e che continueranno nel prossimo triennio -Si segnalano OAPA e OACT hanno presentato 3 programmi differenti in ciascuna struttura -OATS hanno presentato un report integrato con almeno 3 programmi differenti -OACT in un programma (GAIA) collabora con OA Torino ed esiste specifica convenzione (MoU) con il Cineca per il programma Gaia

18 Quali codici? Simulazioni idrodinamiche – Ammaissi globulari, galassie, strutture su larga scala First stars, stelle e oggetti protostellari Dinamica dell’atmosfera solare Magneto-idrodinamica dei plasmi Optical turbulence modelling for Extremely Large Telescopes

19 Dove CINECA (BGQ, PLX, cluster) Eurora-CINECA ECMWF (CRAY XT5) Univ. Tennessee (CRAY TX5) DESI (Hungary) Marenostrum (BSC) Cluster locali

20 OA Bologna Programma di ricerca Simulazioni idrodinamiche della formazione ed arricchimento chimico di proto-ammassi globulari e di galassie nane ultra-deboli PI: F. Calura -Numero di Persone : 2 -Pubblicazioni nell’ultimo triennio 21 e Conferenze 5 -Sistema utilizzato: Cluster Paradigma MPI -Risorse utilizzate: 100,000 ore su Eurora-CINECA -Richieste: 1000 CPU/core con 1 Milione di ore Spazio disco > 1 TB

21 OA Roma Programma di ricerca FIRST: the first stars and galaxies/ERC-.‐Starting Grant project (GA306476) PI: R. Schneider -Numero di Persone : 14 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 15 e Conferenze 2 -Sistema utilizzato: Cluster Paradigma MPI+OMP+GPU -Risorse utilizzate: Intel+IBM cluster -Richieste: 1024 CPU/core con 80 Milioni di ore Spazio disco 100 TB

22 OA Trieste Programmi di ricerca Simulazioni numeriche idrodinamiche di galassie, clusters e volumi cosmologici PIs: S. Borgani, P. Monaco, G. Murante -Numero di Persone : 18 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 39 e Conferenze 35 -Sistema utilizzato: Cluster Paradigma MPI+OMP -Risorse utilizzate: 13 Milioni di ore in BGQ e Cluster Cineca, 4 Milioni di ore Risorse in Ungheria (SP6) -Richieste: 16 Milioni di ore Spazio disco 100 TB. Evitare BGQ -Difficoltà: lunghe code su BGQ (parzialmente inutilizzabile)

23 IRA Bologna Programma di ricerca Non-thermal components in galaxy clusters, theoretical and observational studies PI: G. Brunetti -Numero di Persone : 6 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 9 e Conferenze 30 -Sistema utilizzato: Cluster Paradigma MPI+OMP -Risorse utilizzate: 3 Milioni di ore inBGQ Cineca -Richieste: 50 Milioni di ore Spazio disco 150 TB -Difficoltà: lunghe code su BGQ

24 OA Capodimonte Napoli Programma di ricerca CO5BOLD Simulations: dinamica dell’atmosfera solare PI: T. Starus -Numero di Persone : 1 -Pubblicazione nell’ultimo triennio Non Segnalate e Conferenze Non Segnalate -Sistema utilizzato: Non Segnalate Paradigma OMP -Risorse utilizzate: Non Segnalate -Richieste: 100,000 ore su Shared Memory Spazio disco 10 TB -Difficoltà:

25 OA Torino Programma di ricerca Simulazioni Magneto‐Idrodinamiche di plasmi astrofisici: sviluppo di algoritmi ed applicazioni PI: G. Bodo -Numero di Persone : 5 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 18 e Conferenze 7 -Sistema utilizzato: Cluster Paradigma MPI -Risorse utilizzate: 33 Milioni di ore in BGQ Cineca -Richieste: CRAY XT5 Univ. Tennessee 50 Milioni di ore Spazio disco 100 TB -Difficoltà: lunghe code su BGQ

26 OA Catania e Torino Programma di ricerca Solver Gaia AVU-GSR CU3 PI: U. Becciani -Numero di Persone : 3 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 3 e Conferenze 5 -Sistema utilizzato: BGQ Cineca+ Cluster Locali Paradigma MPI+OMP -Risorse utilizzate: 3 Milioni di ore in BGQ Cineca -Richieste: 70 Milioni di ore BGQ Cineca MOU-INAF Cineca: costo complessivo di 25 Keuro/anno. Durata 8 anni 15 TB -Difficoltà: lunghe code su BGQ in fase di test. Ma ottenuti Run a code riservate in fase di produzione e certezza delle risorse

27 OA Catania Programma di ricerca Simulazioni MHD PI: A. Bonanno -Numero di Persone : 1 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 6 e Conferenze 4 -Sistema utilizzato: Paradigma MPI + OMP -Risorse utilizzate: Non dichiarate -Richieste: 64 nodi con 32 GB + 8 GPU e Spazio disco di 1 TB -Difficoltà:

28 OA Catania Programma di ricerca Simulazioni MHD PI: V. Antonuccio -Numero di Persone : 2 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 7 e Conferenze 2 -Sistema utilizzato: Paradigma MPI + OMP -Risorse utilizzate: PLX Cineca 100,000 ore -Richieste: 7.5 Milioni di ore CPU/core 10 TB -Difficoltà:

29 OA Arcetri (FI) Programma di ricerca Special Project ECMWF: Optical turbulence modelling for Extremely Large Telescopes (SPITFOT) PI: E. Masciadri -Numero di Persone : 3 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 9 e Conferenze 15 -Sistema utilizzato: Paradigma MPI -Risorse utilizzate: 60 More (SBU) su Cray X30 o Power 7 presso ECMWF -Richieste: 60 More (SBU) su Cray X30 o Power 7 presso ECMWF Spazio disco 1 TB -Difficoltà: porting da IBM a CRAY

30 OA Palermo Programma di ricerca Dinamica delle strutture magnetiche della corona solare PI: F. Reale -Numero di Persone : 5 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 4 e Conferenze 5 -Sistema utilizzato: Paradigma MPI -Risorse utilizzate: Cluster + BGQ Cineca 36 Milioni di ore Richieste: 100 Milioni di ore BGQ Cineca Spazio disco 100 TB -Difficoltà:

31 OA Palermo Programma di ricerca Oggetti stellari giovani e getti protostellari. PI: S. Orlando -Numero di Persone : 9 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 4 e Conferenze 14 -Sistema utilizzato: Paradigma MPI -Risorse utilizzate: Cluster + BGQ Cineca 4.5 Milioni di ore Richieste: 50 Milioni di ore BGQ Cineca Spazio disco 40 TB -Difficoltà:

32 OA Palermo Programma di ricerca Esplosioni di novae, resti di supernova, e meccanismi di accelerazione dei raggi cosmici. PI: S. Orlando -Numero di Persone : 5 -Pubblicazione nell’ultimo triennio 6 e Conferenze 7 -Sistema utilizzato: Paradigma MPI -Risorse utilizzate: Cluster + BGQ Cineca 30 Milioni di ore Richieste: 100 Milioni di ore BGQ Cineca Spazio disco 80 TB -Difficoltà:

33 Quale coinvolgimento? Circa 70 unità di personale (staff e non staff) 143 pubblicazioni nel triennio Partecipaizone a congressi 129

34 Conclusioni Ore di calcolo usate nel triennio  255 Milioni di ore (CPU/core) Risorse di calcolo stimate (deisderata) per il prossimo triennio  550 Milioni di ore (CPU/core)  710 TB Spazio disco Risorse utilizzate 68% Cluster e IBM BGQ al Cineca (11 programmi su 16) Paradigma dei codici più usati: MPI  55% MPI+OMP  45%

35 Problemi incontrati Difficolta’ principale emersa: Uso del sistema IBM BlueGeneQ al Cineca  Code intasate e lunghe attese  Ingegnerizzazione del sistema: piccoli nodi che implicano una reingegnerizzazione del codice Supporto richiesto: – 65% richiede supporto per il porting su GPUs per uno stimato impegno di 3 FTE Ciò implica che anche la nostra comunità si prepara all’HPC della nuova generazione e necessita uno specifico supporto.

36 Problematiche aperte Accesso a risorse piccole (T2) – Test – Sviluppo – Sistemi di pronta risposta (qsub ORA) (cluster INAF…risorse interne) Progetti Euclid. SKA. Risorse future

37 Grazie per l’attenzione