Data Mining and Web Computing Nicoletta DESSI’ Dipartimento di Matematica e Informatica Gruppo di ricerca: WADE: We are Ambitious in Data Exploring.

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2 Data Mining and Web Computing Nicoletta DESSI’ Dipartimento di Matematica e Informatica Gruppo di ricerca: WADE: We are Ambitious in Data Exploring

3 ??????? Quali ASPETTI determinano decisione? FEATURES Elaborazione Computerizzata di: IMMAGINI CAMPIONI SANGUE PERIFERICO ESPRESSIONI GENICHE DA MICROARRAY In BIOINFORMATICA

4 Competenze e tecnologie sviluppate: come funzionano 7000-12000 features (GENI) Dati genici Paziente 1  Paziente 2  ……………..  Elaborazione Dati METODI GENI DETERMINANTI per LA PATOLOGIA (max 10-20) Il gene A è simile al gene B? Dove posso trovare maggiori informazioni sui processi genici ? Esistono cataloghi in INTERNET? Come posso collaborare e condividere le informazioni? Il gene A è simile al gene B? Dove posso trovare maggiori informazioni sui processi genici ? Esistono cataloghi in INTERNET? Come posso collaborare e condividere le informazioni? BIOCLOUD COWB Applicazioni sviluppate su Cloud Pubblicamente accessibili

5 BIOCLOUD COWB

6 Competenze e tecnologie sviluppate: sviluppi futuri attesi: Le metodologie sono: -utilizzabili per l’esplorazione di dati genici (es. Genoma Sardo) -estendibili all’esplorazione di insiemi di dati ad alta dimensionalità derivanti da altri domini applicativi: -Analisi di mercato -Esplorazione di dati Web

7 Competenze e tecnologie sviluppate: sviluppi futuri attesi Gli strumenti: Software di supporto come Biocloud e COWB sono oggi commercializzati nel settore della Bioinformatica. Ambienti analoghi possono essere costruiti per altri domini applicativi o per integrare dati ad alta dimensionalità (es. Open Data).

8 Chi siamo Un piccolo gruppo di ricerca :2 professori + 2 ricercatori + numerosi dottorandi e tesisti in Informatica. I risultati presentati sono stati ottenuti grazie al progetto DENIS, triennale (2013- 15) finanziato dalla RAS. I risultati di DENIS presentati in 55 pubblicazioni internazionali. Biocloud presentato come “special event” di un convegno internazionale di Bioinformatica.

9 Cosa possiamo offrire e a chi Offrire la nostra esperienza e consulenza ad : - Un ente o un laboratorio di ricerca nel settore della bioinformatica. -un'azienda interessata a sperimentare le nostre metodologie.  Enti e/o aziende interessati al ns background per proporre progetti che finanzino un ampliamento delle ricerche in un settore di interesse comune.

10 Contatti Nicoletta Dessì dessi@unica.itdessi@unica.it Dipartimento di matematica e Informatica Via Ospedale 72 – Cagliari- Laura Cannas Emanuele Pascariello Gabriele Milia Giuliano Ferrentino Barbara Pes Cecilia Di Ruberto Giuseppe Fodde Andrea Loddo Lorenzo Putzu Gianfranco Garau