Simona Rossi SRossi@mdanderson.org Università di Ferrara.

Presentazione sul tema: "Simona Rossi SRossi@mdanderson.org Università di Ferrara."— Transcript della presentazione:

1 Simona Rossi Università di Ferrara

2 Quanto l’ITAS è stato importante per me…e non solo
Matematica ed informatica all’Università Forma mentis Economia come fonte di organizzazione Marchetti Nicola (Diploma Indirizzo Programmatori ’97, Laurea in Ingegneria Elettronica, Ricercatore) Pinotti Mirko (Diploma Indirizzo Biologico, Laurea in Biologia, Ricercatore presso l’Università di Ferrara)

3 Importanza della Bioinformatica
Dati genomici, funzionali, databases pubblici e privati ncRNA profiling, l’uso di dispositivi quali i microarrays di espressione, risorse pubbliche quali il Mappaggio genico, espressione, databases funzionali, E algoritmi di predizione hanno permesso l’identificazione Di specifiche signatures associate con diagnosi, prognosi e risposta al trattamento dei tumori umani. Dati clinici Dati relativi a diverse forme di cancro e malattie rare Gli studi Bioinformatici stanno emergendo come importanti strumenti per identificare associazioni fra diversi tipi e fonti di dati

4 Microarrays C1 C2 T1 T2 gene1 34 89 55 gene2 22 888 44 77 gene3 345 78
C1 C2 T1 T2 gene1 34 89 55 gene2 22 888 44 77 gene3 345 78 896 gene4 212 66 333 234 gene5 23 7 567 564 ….. ….

5 Misurare la qualità di DNA microarrays
Pseudo-images Normalized unscaled standard errors (NUSE). Percentage of PM > MM. Relative log expression (RLE). Mascellani et al, UniFE, Lab Prof. Stefano Volinia

6 TOM Rossi et al, UniFE, Lab Prof. Stefano Volinia

7 GebbaLab Progetto Regionale Emilia Romagna: UniFE, IOR, NSI

8 Lab Prof. George Calin

9 MicroRNAs I microRNAs sono piccole molecole di RNA a singolo filamento di nucleotidi che svolgono diverse funzioni Ciascun miRNA si lega al complesso proteico RISC e lo guida verso l'mRNA target. Negli animali, si è visto che il complesso costituito da RISC e miRNA si associa per complementarietà imperfetta alla 3'UTR dell'mRNA target, causando in questo modo il blocco della traduzione di quell'mRNA. Si è visto che un mRNA può essere riconosciuto e legato da diversi complessi miRNA-RISC, inoltre ciascun tipo di complesso miRNA-RISC può legarsi ad mRNA target diversi. Studi attuali stanno dimostrando che in alcuni tipi di cancro i livelli di alcuni miRNAs sono bassi o alti dando origine a miRNA oncosoppressori o tumorali.

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11 Tiziano Terzani …”cercate una vita che vi assomigli”
Da: La fine è il mio inizio

12 Domande??????????...sì dai!!!!!!