Controlli di qualità degli mRNA (surveillance systems)

AUG UAG mGppp AAAAAAAAAAAAAAAA PTC NMD (Nonsense Mediated Decay)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Non-sense Mediated Decay (NMD): complesso EJC

Non-sense Mediated Decay (NMD)

3 2 Meccanismo dell’NMD UAG (PTC)AUGSTOP mGppp AAAAAAAAAAAAAAAA 33 2 mGpp p AAAAAAAAAAAAAAAA 3 UAG AAAAAAAAAAAAAAAA mGppp UAG RF

Non-Stop Mediated Decay (NSMD)

Ruolo del tmRNA

Regolazione della traduzione

Transcriptional control gene mRNA protein Translational control Slow Lasting Transcription-dependent Rapid Short-lived Transcription-independent

Regolazione della traduzione generale specifica

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Regolazione generale della traduzione nei procarioti

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Regolazione della traduzione generale specifica

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Regolazione della traduzione mediata da un sRNA regolatore

Regolazione autogena mediante riboswitch

Riboswitch (metabolita)

Riboswitch (temperatura)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Regolazione della traduzione autogena nei procarioti

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Regolazione della traduzione delle r-proteine nei procarioti

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Regolazione della traduzione negli eucarioti generale specifica

Initiation FactorsActivity prokaryoteseukaryotes IF3eIF-1 Fidelity of AUG codon recognition IF1eIF-1A Facilitate Met-tRNAiMet binding to small subunit eIF-2 Ternary complex formation eIF-2B (GEF) GTP/GDP exchange during eIF-2 recycling eIF-3 (12 subunits) Ribosome antiassociation, binding to 40S eIF-4F (4E, 4A, 4G) mRNA binding to 40S, RNA helicase activity eIF-4A ATPase-dependent RNA helicase eIF-4E 5' cap recognition eIF-4G Scaffold for of eIF-4E and -4A eIF-4B Stimulates helicase, binds with eIF-4F eIF-4H Similar to eIF4B eIF-5 Release of eIF-2 and eIF-3, GTPase IF2eIF5B Subunit joining eIF-6 Ribosome subunit antiassociation

eIF2 eIF2  3 subunità:   Subunità  aiuta attività di GTPasi e modula il legame tRNAi-eIF2   Subunità  è un regolatore della traduzione. E’ fosforilata (ser 51) da diverse chinasi in risposta a stress

la fosforilazione di eIF2  inibisce lo scambio GDP-GTP inizio traduz.

eIF4F

eIF4F eIF4F  Composto da 3 subunità eIF4A: elicasi, aiutato da eIF4B eIF4E: cap binding protein, regolata da fosforilazione e interazione con eIF4E-BP eIF4G: adattatore, interagisce con diversi fattori

Regolazione generale della traduzione Vari stress cellularieIF2 Stimolazione mitogenica eIF4E (eIF4F)