Martedì 24 nov 11-13 Bioinformatica Giovedì 26 nov 11-13 Bio Mol
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Elementi del promotore della metallotioneina
Altri elementi del promotore di pol II
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Funzionamento degli Enhancer
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Elementi Enhancer
Ruolo degli Isolatori
FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans - Fattori generali (o basali) - Attivatori
Attivatori costitutivi Modulo Attivatore DNA occupato Consenso Distribuzione CAAT box CTF/NF1 22 bp GGCCAATCT ubiquitaria GC box SP1 20 bp GGGCGG Ottamero Oct-1 ATTGCAT Oct-2 23 bp linfoidi kB NFkB 10 bp GGGACTTTCC ATF GTGACGT
Attivatori inducibili ed elementi di risposta Agente regolatore Elemento di risposta Consenso Attivatore Dimensioni (dalton) Shock termico HSE CNNGCCNNTCCNNG HSTF 93.000 Glucocorticoidi GRE TGGTACAAATGTTCT GR 94.000 Cadmio MRE CGNCCCGGNCNC MTF1 80.000 TPA TRE TGACTCA AP1 39.000 Siero SRE CCATATTAGG SRF 52.000
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Struttura "modulare" degli attivatori legame al DNA transattivazione dimerizzazione legame al ligando
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Struttura degli attivatori
Scambio di domini di attivatori
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Dominio Dito di Zinco
Omeodominio (HTH, Elica-giro-Elica)
Dominio Elica-Ansa-Elica (bHLH)
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Famiglie di fattori di trascrizione Dito di zinco (zinc finger) Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) Elica-ansa-elica (helix loop helix, bHLH) Cerniera di leucina (leucine zipper, bZIP)
Dimerizzazione degli attivatori
Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri
Struttura dell’ “Enhanceosoma”
Attivazione della trascrizione mediante reclutamento
Attivazione della trascrizione
Modificazioni della cromatina mediate dagli attivatori
Acetilazione e deacetilazione della cromatina Corepressore
Gli attivatori sono "bersaglio" di vie di trasduzione