Il superavvolgimento negativo

Presentazione sul tema: "Il superavvolgimento negativo"— Transcript della presentazione:

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2 Il superavvolgimento negativo
DNA superavvolto negativamente Il superavvolgimento negativo può convertirsi nella separazione locale dei due filamenti

3 separazione dei filamenti (denaturazione di regioni ricche in A+T)
struttura Z (in corrispondenza di regioni di alternanza Pu/Py) strutture cruciformi (in corrispondenza di palindromi)

4 Superavvolgimento del DNA
Positivo = DNA superspiralizzato Negativo = DNA sottospiralizzato

5 Enzimi che alterano la topologia del DNA
Topoisomerasi: tipo I tipo II

6 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

7 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

8 Topoisomerasi

9 Enzimi che agiscono sugli acidi nucleici
Polimerasi: DNA polimerasi RNA polimerasi Nucleasi: esonucleasi endonucleasi

10 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

11 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

12 Proprietà del DNA Appaiamento (associazione)
Denaturazione Rinaturazione

13 Spettro di assorbimento del DNA
220 240 260 280 300 320 0.5 1.0 1.5 lunghezza d’onda (nm) Assorbanza effetto ipercromico

14 Fusione (melting) della doppia elica
70 80 90 100 T ( °C) Assorbanza relativa 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Fusione (melting) della doppia elica e misura del Tm (Temperature of melting = Temperatura di fusione) Tm = 83°C

15 Dipendenza della denaturazione del DNA dal contenuto in G+C
Tm (°C) G+C (moli %)

16 Fattori che influenzano la denaturazione
Temperatura Forza ionica pH

17 B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S. p. A
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007

18 Riassociazione del DNA

19 Riassociazione del DNA

20 Appaiamento su filtro (ibridazione)

21 Sequenze palindromiche

22 Strutture a "forcina"

23 Struttura cruciforme

24 Strutture dell'RNA

25 Struttura "pseudonodo"

26 Mutazioni Una modificazione chimica di una base
Incorporazione di una base sbagliata

27 B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S. p. A
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007

28 Il "Dogma centrale" Replicazione DNA Trascrizione inversa RNA
Traduzione Replicazione DNA RNA Proteina inversa