LA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE DEGLI ACIDI NUCLEICI
Struttura chimica del DNA pdTpdGpdCpdA dal 5’ al 3’
Struttura chimica dell’RNA pApCpGpU dal 5’ al 3’ L’uracile manca del gruppo CH3 presente nella timina
La doppia elica B del DNA vista parallelamente all’asse di fibra
La doppia elica B del DNA vista lungo l’asse di fibra
Modello con i raggi di van der Waals dell’elica B del DNA
Struttura A dell’RNA
Organizzazione strutturale del DNA nel cromosoma
Struttura terziaria del t-RNA
anticodone Accettore dell’amminoacido
DETERMINAZIONE SPERIMENTALE DELLA PRESENZA DI STRUTTURA SECONDARIA
Spettroscopia di dicroismo circolare Il fenomeno del Dicroismo Circolare (CD) si osserva quando un campione otticamente attivo assorbe in maniera differente la luce circolarmente polarizzata destra rispetto a quella circolarmente polarizzata sinistra. La differenza di assorbimento è piccola (generalmente 0.0001) che corrisponde ad una ellitticità di pochi centesimi di grado. Spettri CD relativi a strutture secondarie diverse di peptidi, acidi nucleici e polisaccaridi sono diversi e quindi questa tecnica dà informazioni sulla struttura secondaria di macromolecole biologiche.
Spettri tipici di strutture secondarie o disordinate di polipeptidi
SPETTRI DI DICROISMO CIRCOLARE DI ALCUNE POTEINE
myoglobin
Transizione conformazionale di un polipeptide da -elica a gomitolo statistico seguita mediante dicroismo circolare Punto isosbestico
Dati simili sono ottenuti per gli acidi nucleici dove l’alto assorbimento dei gruppi aromatici in funzione della presenza di struttura secondaria (doppia elica) permette di utilizzare bene anche la spettroscopia nell’ultravioletto La temperatura di transizione (Tm) di polinucleotidi dipende essenzialmente da tre fattori: 1) Composizione in basi 2) Lunghezza della doppia elica 3) Forza ionica della soluzione