Prof. Mauro Fasano mauro.fasano@uninsubria.it Come l’Evoluzione di una Macromolecola garantisce la Regolazione della Funzione: l’Esempio dell’Emoglobina Prof. Mauro Fasano mauro.fasano@uninsubria.it
Perché l’emoglobina? Proteina nota a tutti Tra le prime strutture determinate Conservazione strutturale in tutti gli organismi Principale esempio di correlazione struttura-funzione Principale esempio di regolazione allosterica
Struttura e funzione Struttura terziaria: il corretto “folding” garantisce la corretta funzione Mioglobina: legare ossigeno nel muscolo aumentandone la disponibilità Emoglobina: trasportare ossigeno, legandolo e rilasciandolo a seconda delle necessità
Mioglobina Da un disegno di Irving Geis, 1983
Mioglobina
Mioglobina
Mioglobina Distale Prossimale
Equilibrio di legame dell’ossigeno alla Mioglobina
Equilibrio di legame dell’ossigeno alla Mioglobina
Legame dell’ossigeno all’eme Il legame dell’ossigeno al FeII dell’eme determina variazioni conformazionali della struttura terziaria che avvengono senza restrizioni La situazione sarebbe diversa in una struttura quaternaria!!
La struttura quaternaria impedisce le variazioni conformazionali associate al legame dell’ossigeno In eccesso di ossigeno, la struttura quaternaria viene forzata a raggiungere un nuovo “stato conformazionale” ad elevata affinità per l’ossigeno
Due stati conformazionali Forma T: deossigenata, bassa affinità per l’ossigeno Forma R: ossigenata, alta affinità per l’ossigeno
Variazione dei contatti intercatena conseguenti all’ossigenazione
Equilibrio di legame dell’ossigeno all’Emoglobina
Grafico di Hill Log Y 1-Y Log K
Grafico di Hill
Modelli termodinamici di cooperatività Monod, Wyman, Changeux Koshland
L’effetto Bohr
L’effetto Bohr
L’effetto allosterico
Il bisfosfoglicerato modifica la “soglia” necessaria a far avvenire la variazione conformazionale
Quante Emoglobine umane?!? Embrionale Fetale Pseudogene Adulta e g1 g2 yh d b 5’ 3’ 100 200 duplicazione genica Mya
Perché?
Cooperatività ed allosteria: non solo emoglobina
Cosa succede se: Una delle istidine prossimali è mutata in tirosina? La coordinazione dell’ossigeno al posto dell’azoto cambia il valore del potenziale redox del ferro, stabilizzando lo stato +3 e rendendo la proteina incapace di legare l’ossigeno
Cosa succede se: Il glutammato in posizione 6 delle catene β è mutato in valina?
Anemia falciforme
Anemia falciforme
Per saperne di più Basics: qualunque testo di biochimica I classici: M. Brunori, E. Antonini, “Hemoglobin and Myoglobin in Their Reactions with Ligands” (1971) R.E. Dickerson, I.E. Geis, “Hemoglobin: Structure, Function, Evolution, and Pathology” (1983) Allosteria: J.F. Swain, L.M. Gierasch, “The changing landscape of protein allostery”. Curr. Op. Struct. Biol. 16, 102-108 (2006). The Web