Didattica Integrativa Canale A Torino, 7 ottobre 2008 LE BANCHE DATI ONLINE Gaetano Grillo Biblioteca “Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie <gaetano.grillo@unito.it> Didattica Integrativa Canale A Torino, 7 ottobre 2008

Il Programma di oggi Breve introduzione Medline (OVID) Cinahl (OVID) Embase (OVID)

Le esigenze informative di partenza Tenermi aggiornato su un argomento? Tesi di laurea o altro lavoro scientifico? Relazione per un esame? Descrizione o gestione di casi clinici? Relazione sulla propria attività o su quella del reparto? altro… ?

I tipi di documento: libri monografici (trattati, manuali, raccolte di saggi) periodici linee guida atti di congressi immagini (fisse e in movimento) documenti multimediali altro...?

I formati possono essere: Cartacei elettronici con accesso locale (CD-ROM, Floppy disk, …) elettronici con accesso remoto (CD-ROM in rete, siti Internet, fulltext online)

Strumenti di ricerca Database bibliografici Cataloghi Subject gateways Motori di ricerca Mailing list e rispettivi archivi Forum di discussione Siti di associazioni professionali

Le fonti per la ricerca bibliografica online in ambito biomedico: <http://www.lib.unito.it/web/tutorial/fonti.html>

I database: definizione La gestione dell’informazione è lo scopo principale di un database Esso è un insieme di descrizioni standard, strutturate e organizzate, accessibile all'utenza attraverso interfacce che ne permettano l'interrogazione e il recupero di dati

Una tabella di database Sono visibili i campi (colonne) in verticale e i record (righe) in orizzontale

Relazione tra tabelle Esempio di database relazionale, in cui le tabelle sono collegate tra loro

Ricercare in un database bibliografico Vanno distinti: la struttura del database il software di IR (= information retrieval, recupero dell’informazione)

Cosa sono i database bibliografici? Per ogni articolo viene prodotta una citazione bibliografica che comprende una serie di elementi (metadati). Questi riferimenti bibliografici sono relativi alla letteratura biomedica (prevalentemente periodici) Struttura del record o citazione bibliografica (che deriva dallo spoglio di articoli di riviste prese in considerazione dal database) campi In un database bibliografico i dati sono divisi in campi e record.

MEDLINE: La NLM

MEDLINE è la più importante banca dati bibliografica mondiale di argomento biomedico e contiene citazioni e abstract di più di 5000 riviste biomediche (in 37 lingue) pubblicate negli Stati Uniti e in altri 80 paesi Prodotto dalla National Library of Medicine in lingua inglese e contiene argomenti di medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria … Contiene oltre 16.000.000 di riferimenti bibliografici di articoli pubblicati su riviste dal 1950 a oggi Aggiornamento quotidiano E‘ gratuita tramite l‘interfaccia di Pubmed dal 1997

Caratteristiche di MEDLINE 1 Lingua d’interrogazione è l’inglese, anche per reperire riferimenti ad articoli pubblicati in lingue diverse (il titolo dell’articolo, in questi casi, è tradotto in inglese) Presenza di abstract: tutti i riassunti presenti sono in inglese, indipendentemente dalla lingua in cui è scritto l’articolo Frequenza di aggiornamento? Quotidiana; ogni giorno vengono aggiunti 2000 – 4000 nuovi record. Nel 2007, ne sono stati aggiunti 670.000.

Caratteristiche di MEDLINE 2 Tipo di documenti indicizzati: articoli di rivista (gli atti di congresso compaiono solo se pubblicati su riviste). Copertura geografica: circa il 50% degli articoli appartiene a riviste pubblicate negli Stati Uniti, il restante 50% a riviste pubblicate in 80 altri Paesi Copertura linguistica: il 78% degli articoli indicizzati in MEDLINE è scritto in lingua inglese, ma questa percentuale sale all’89% per gli articoli inseriti tra 2000 e 2003

Caratteristiche di MEDLINE 3 Quali tipi di studio si trovano? Tendenzialmente tutti quelli pubblicati sulle riviste: lettere che esprimono opinioni report di casi singoli o di più casi studi qualitativi sperimentazioni non controllate studi di eziologia, studi prospettici sperimentazioni precliniche e cliniche controllate: studi caso-controllo, sperimentazioni randomizzate controllate, ecc. Revisioni narrative e sistematiche Linee guida

Esistono diverse piattaforme per interrogare il database MEDLINE: Gratuite : Entrez PUBMED A pagamento: OVID In OVID e in PUBMED sono interrogabili anche altre banche dati. OVID è accessibile da tutti i PC aziendali e universitari Da casa: tramite il proxy (Nome utente e password sono gli stessi usati per l'accesso al servizo di posta elettronica dell'Ateneo)

accesso alle banche dati dal sito della biblioteca „Rosmini“ accesso alle banche dati dal sito della facoltà di Medicina e chirurgia accesso alle banche dati da casa tramite proxy università

Varie sezioni di Medline

Ricerca di base Entro nel tesauro Come ritrovare un articolo, un autore… Avvio la ricerca Ricerco tra i vari campi del record Finestra di ricerca di base Vado in ricerca avanzata

Struttura di una citazione: alcuni elementi autore (fino a 25 cognomi); titolo dell'articolo fonte bibliografica (titolo della rivista, volume, fascicolo, pagine, anno, mese) descrittori di soggetto (MeSH) Riassunto del documento

Struttura di una citazione: alcuni elementi tipo di pubblicazione (ad es. lettera, editoriale, rassegna). lingua originale in cui l'articolo è stato pubblicato

I descrittori di soggetto: I MeSH, ("Medical Subject Headings") MESH è l'acronimo di Medical Subject Headings, ovvero intestazioni di soggetto per la medicina e servono ad identificare i termini più appropriati per la ricerca. Ne esistono circa 24,767 (ott. 2007) e sono scelti da specialisti di ogni area della biomedicina.

L’albero MeSH Si tratta di un tesauro … (Thesaurus = vocabolario controllato). I suoi descrittori fanno parte di una struttura gerarchica che permette di ricercare a vari livelli di specificità. Breve descrizione del termine MeSH broader terms narrower terms Termine del MeSH (descrittore di soggetto) i termini sono disposti in una gerarchia “ad albero”, in cui i “broader terms” (termini più generali) contengono i “narrower terms”, termini più ristretti)

I MeSH, ("Medical Subject Headings") Breve descrizione del MeSH che permette di valutare la scelta Gli articoli sono indicizzati utilizzando questo tesauro e quindi: i termini sono in forma normalizzata (tutti i sinonimi sono ricondotti ad un unico termine accettato. Es: ulcer, pressure – bed sore – decubitus ulcer – sore pressure – sore, pressure … “Pressure ulcer”)

i termini sono collegati con una rete di rinvii. In particolare: “vedi”: rinvio da voce non accettata a voce accettata: es.: “ diseases, skin”  vedi Skin Diseases oppure “Vedi anche”: per i termini, entrambi accettati, che hanno una relazione importante. es.: Skin Diseases vedi anche Dermatologic Agents / Skin Manifestations

Conoscere la struttura dei MeSH può essere molto utile per elaborare una ricerca efficace Le 16 categorie principali del MeSH : 1. Anatomy [A] 2. Organisms [B] 3. Diseases [C] 4. Chemicals and Drugs [D] 5. Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment [E] 6. Psychiatry and Psychology [F] 7. Biological Sciences [G] 8. Natural Sciences [H] 9. Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena [I] 10. Technology, Industry, Agriculture [J] 11. Humanities [K] 12. Information Science [L] 13. Named Group [M] 14. Health Care [N] 15. Publication Characteristics [V] 16. Geographicals [Z] MeSH relativo Categoria principale

I MeSH : accorgimenti I MeSH non sono disponibili su: premedline “record as supplied by publisher” I MeSH non vengono creati per argomenti che ricorrono raramente I MeSH non esistono ancora per i termini “nuovi” N.B. In tutti questi casi usare la ricerca libera con operatori logici. RIASSUMENDO: Ogni articolo indicizzato riceve un certo numero di descrittori MeSH che definiscono il suo intero contenuto semantico. Alcune voci di soggetto hanno una particolare rilevanza (indicate, nei record bibliografici, con l'asterisco (*)). Queste voci si ricercano specificando come qualificatore [MAJR] (Focus).

PRIMA DI INIZIARE LA RICERCA FORMULARE IL QUESITO USANDO IL PICO Patient group(s) (paziente) Il quesito riguarda chi o che cosa (problema)? Intervention (intervento) Che cosa è stato fatto o succede ai pazienti? Comparison(s) (comparazione) Che cosa potrebbe essere fatto in alternativa? Outcome(s) (esito) Come influisce l’intervento sulla popolazione/pazienti?

Inserisco una o più parole libere per la ricerca ricerca di base ricerca di base Inserisco una o più parole libere per la ricerca Storia e risultati della ricerca

Posso utilizzare i risultati per trovare una citazione vicina al mio argomento di ricerca e poi andare in ricerca avanzata per cercare i termini (descrittori di soggetto) che trovo nel campo dei Mesh

Oppure ….. inserisco sempre la stessa parola libera e il DB mi suggerirà un termine del tesauro dei Mesh Ricerca avanzata

il DB suggerisce a quali termini MeSH si lega, e seleziono il termine che mi interessa Parola libera inserita

L’albero MeSH

I SUBHEADINGS Le "sotto-intestazioni" rappresentano un aspetto particolare del singolo descrittore MeSH a cui si applicano. Sono utili per rendere efficace una strategia di ricerca. Se cerchiamo, ad esempio, una sostanza farmacologica, potremmo essere interessati a circoscrivere i risultati della ricerca all'aspetto tossicologico, oppure agli effetti collaterali, al suo uso diagnostico o terapeutico, al suo assorbimento e metabolizzazione da parte dell'organismo, agli avvelenamenti, alla posologia, e via dicendo. Non tutti i subheadings sono applicabili a tutti i MESH

Possiamo restringere i risultati della nostra ricerca utilizzando il bottone dei limiti

i “Limits”: come limitare una ricerca Scelta limiti metodologici Scelta limiti veloce, es: solo Full Text Normalmente conviene sempre partire da una ricerca più ampia e poi restringerla con l’aiuto dei limiti, ad es. : per gruppi d’età (attenzione alle definizioni!) per data di pubblicazione dell’articolo per data d’inserimento del record nel database (Entrez date, per le novità)

I limiti metodologici Possono indicare il tipo di pubblicazione, ad es.: Clinical Trial Editorial Randomized Controlled Trial Servono a individuare il livello di evidenza presentato in uno studio

Ottenuto il risultato della ricerca posso salvare le citazioni attraverso il “Results Manager”

Posso salvare i records selezionati o tutti Posso scegliere quali campi del record salvare Includere la storia della ricerca e salvare tutte le citazioni bibliografiche in formato testo

L’uso degli operatori boleani: AND, OR, NOT Per una buona strategia di ricerca utilizzando i MeSH è necessario l’uso metodico degli operatori logici boleani. La combinazione di AND, OR e NOT per associare più termini nella stessa ricerca, permette di risolvere il problema dei risultati con troppi record (è sbagliata l’idea che tanti articoli recuperati equivalgano ad una buona ricerca) Per comprendere l'"algebra" booleana (AND, OR e NOT) si tengano presenti le seguenti relazioni grafiche: L'AND "restringe" l'insieme ai risultati comuni ad un secondo insieme a AND b

il NOT elimina dal primo quanto appartiene anche al secondo l'OR lo "allarga" sommandovi il secondo insieme a OR b il NOT elimina dal primo quanto appartiene anche al secondo a NOT b In pratica: l’AND equivale ad un'intersezione; l'OR ad una sommatoria; il NOT ad una sottrazione.

CINAHL : che cosa contiene?

CINAHL Il Cumulative Index to Nursing & Allied Health è un database comprendente riferimenti bibliografici da pubblicazioni appartenenti alle discipline infermieristiche e alle scienze alleate Discipline collaterali: Assistenza medica Optometria Pediatria Pronto soccorso Servizio sociale nella cura della salute Tecnica radiologica Terapia occupazionale Tecnica chirurgica Le varie specialità dell’infermieristica: Chirurgia Chirurgia plastica Fisioterapia e riabilitazione Gastroenterologia Ginecologia Nutrizione e dietetica Oncologia Ricorda: Ogni DB presente in OVID ha la stessa interfaccia di interrogazione

CINAHL: : un po’ di storia E’ tra i più vecchi e completi repertori bibliografici delle scienze infermieristiche Prodotto dall’American Nurses Association e dalla National League for nursing Nato nel 1961 (indicizzando 35 periodici) con il nome di CINL vede la sua veste definitiva nel 1977, integrato con la letteratura di discipline collaterali

CINAHL: contenuti Copertura temporale: dal 1982 in poi Copertura geografica: Africa, Asia, Australia, Canada, Europa, Sud America, Regno Unito e Irlanda, Stati Uniti Indicizza 2,593 riviste, di cui 1,798 includono il riassunto dell’autore; cita inoltre: tesi, linee guida (a volte in testo completo), atti di congressi, materiali audiovisivi, software e libri Sono presenti 1,328,745 record (dato dic. 2006) Il database è indicizzato con un tesauro. Il 70% del CINAHL subject headings (12,414 ) corrisponde ai MeSH del MEDLINE; gli altri termini sono specifici per l’infermieristica e le scienze alleate

Inserisco sempre la parola libera e il DB mi suggerirà un termine del tesauro di CINAHL

Dal 1/1/2009 CINAHL, la banca dati per le scienze infermieristiche attualmente consultabile attraverso OVID, migrerà su una nuova piattaforma gestita da EBSCO In previsione di tale cambiamento è stato attivato, fino al 31/12/2008, un trial sulla versione "base" e su quella "Plus" della banca dati. L’accesso è disponibile collegandosi, da tutti gli IP di Ateneo, all'indirizzo: http://search.ebscohost.com

Embase: che cosa contiene? Banca Dati bibliografica che copre i settori della medicina, con particolare riguardo alla farmacologia e alla tossicologia Piú di 11.000.000 records a partire dal 1974 (nella versione OVID dal 1988) Indicizza 5000 riviste, di prevalenza europea aggiornamenti giornalieri Europa Thesauro: EMTREE (52,500 termini) A pagamento

Paragone tra EMTREE e MeSH

LA COCHRANE LIBRARY E GLI STRUMENTI PER IL RECUPERO DELL’INFORMAZIONE Gaetano Grillo Biblioteca “Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie <gaetano.grillo@unito.it> Didattica Integrativa Canale A Torino, 14 ottobre 2008

Il Programma di oggi The Cochrane Library (OVID) Le linee guida E-BOOKS I Cataloghi I Periodici elettronici Le risorse in Internet

The Cochrane Library La Cochrane Library é una pubblicazione elettronica finalizzata a rendere disponibile la migliore evidenza per le domande terapeutiche. E’ il principale prodotto della Cochrane Collaboration e raccoglie tutte le sue revisioni sistematiche (RS) prodotte ed i protocolli delle revisioni in corso. “Si tratta di un'efficiente e valida fonte di informazione per professionisti impegnati in scelte di governo clinico, utili nell'orientare le attività mediche ed infermieristiche, nell'educazione continua e nell'organizzazione dei servizi”

Cochrane Database of Systematic Reviews (Cochrane Reviews) Le revisioni Cochrane sono esclusivamente revisioni di studi clinici randomizzati, identificati su tutte le più importanti riviste mediche pubblicate nelle diverse lingue. L’inclusione o l’esclusione degli studi è basata su espliciti criteri di qualità in modo da ridurre gli errori sistematici. Total Records 5171 Spesso i dati vengono combinati statisticamente (con le meta-analisi) per raggiungere risultati più affidabili ( a volte i singoli studi includono casistiche troppo piccole). Nuove revisioni sono rese disponibili ad ogni edizione della Cochrane Library con l'obiettivo finale di coprire tutte le aree della assistenza sanitaria.

The Cochrane Centre Register of Controlled Trials (CENTRAL) Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness (DARE) Il DARE contiene 5758 abstract strutturati di revisioni sistematiche pubblicate sulle maggiori riviste mediche e analizzate qualitativamente da esperti del NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York, Inghilterra. Total Records 7048 The Cochrane Centre Register of Controlled Trials (CENTRAL) E’ una bibliografia di 479.462 trial clinici identificati dai membri della Cochrane Collaboration tramite la ricerca manuale delle riviste biomediche internazionali. Lo scopo finale è creare una banca dati esaustiva degli studi clinici controllati. CENTRAL si basa sull'esame sistematico di atti dei congressi e su molte altre fonti non incluse in MEDLINE o in altre banche bibliografiche. Total Records 527,885

Health Technology Assessment Database (HTA) Questa banca dati, prodotta dal NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York, raccoglie informazioni in merito a studi internazionali di health technology assessment. Contiene record riferibili a studi già completati o in corso. I riassunti provengono dall’International Network of Agencies for Health Technology Assessment (INAHTA) ed hanno un carattere più descrittivo che analitico. Non riportano valutazioni critiche del contenuto. Total Records 7177 NHS Economic Evaluation Database (NHS EDD) L’ NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York produce questa banca dati di 19.722 riassunti sulla valutazione economica degli interventi sanitari.. Total Records 22,978

Un po‘ di storia 1972 Archie Cochrane (Epidemiologo) sosteneva l‘importanza di creare un registro centrale internazionale di studi clinici in particolare quelli Randomizzati, i soli che erano il più possibile esenti da “bias”. Egli scriveva:“E' davvero una critica giusta quella che viene fatta alla nostra professione, di non aver organizzato un sommario critico, specialità per specialità, aggiornato periodicamente, di tutti gli Studi Randomizzati Controllati rilevanti”. Alcuni anni dopo la sua morte questa riflessione portò alla creazione della Cochrane Collaboration

Esempi di gruppi di revisione La Cochrane Collaboration é una rete internazionale di scienziati e medici. Il fine di questa istituzione é di produrre revisioni sistematiche per poter valutare terapie, tenerle aggiornate e diffonderle La Cochrane Collaboration è un organizzazione senza scopo di lucro Le revisioni vengono prodotte da diversi gruppi di revisione Esempi di gruppi di revisione Anaesthesia Group Back Group Bone, Joint and Muscle Trauma Group Breast Cancer Group Childhood Cancer Group Colorectal Cancer Group Consumers and Communication Group Cystic Fibrosis and Genetic Disorders Group Dementia and Cognitive Improvement Group Depression, Anxiety and Neurosis Group Developmental, Psychosocial and Learning Problems Group Drugs and Alcohol Group

Medline (in OVID) CINAHL EMBASE CHOCHRANE LIBRARY 16.000.000 dal 1950 1.328.000 dal 1982 11.000.000 dal 1988 594.559 5.000 riviste 2.600 riviste Fonti diverse angloamericana internazionale europea MeSH CINAHL headings EMTREE keywords Parola libera Articoli di riviste Articoli di riviste, libri, tesi, audiovisivi Revisioni sistematiche, studi clinici Biomedicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria Infermieristica e scienze affini Biomedicina, farmaci e farmacologia Terapie

Linee Guida per la pratica clinica: NGC - National Guideline Clearinghhouse E’ un database di linee guida americane Tutte hanno un abstract strutturato Di alcune esiste anche il full text Una certa quantità *non* si trova in PubMed (non sono pubblicate su riviste) Navigabili per: Disease/Condition Treatment/Intervention Organization Usare la “detailed search” Altre risorse: NELH's Guidelinesfinder (FT gratuito) Programma Nazionale Linee Guida

OVID: manuali online In OVID ho la possibilità di accedere a 41 libri in versione elettronica, di cui 22 hanno pertinenza infermieristiche

OVID: manuali online In OVID ho la possibilità di accedere a 41 libri in versione elettronica, di cui 22 hanno pertinenza infermieristiche

I cataloghi delle biblioteche Come recuperare la documentazione scientifica selezionata? Nei cataloghi cartacei e in linea delle biblioteche biomediche trovo principalmente i riferimenti bibliografici a libri, periodici cartacei ed elettronici. Attraverso il sito della Biblioteca del Rosmini accesso a: Catalogo periodici della Biblioteca del Rosmini Catalogo periodici Biblioteche biomediche Università di Torino (OCAP in dismissione) TROVA@unito (per le riviste disponibili in formato elettronico dell‘Ateneo di Torino) Catalogo periodici e dei libri delle Biblioteche d’Ateneo di Torino

I cataloghi delle biblioteche Ulteriori strumenti di recupero dell’informazione: CATALOGO ITALIANO DEI PERIODICI (ACNP) LibrinLinea (SBN - Catalogo collettivo delle biblioteche della Regione Piemonte) SBN-ONLINE Catalogo collettivo delle biblioteche nazionale

I Periodici elettronici Strumento utile per reperire i loro siti è la lista alfabetica del PEB (Periodici Elettronici Biomedici) creata da bibliotecari biomedici Il periodico elettronico, in alternativa al formato cartaceo, fornisce il testo completo di un documento (solitamente per leggere a video un articolo è preferibile usare il formato HTML e per la stampa il formato PDF)

I Periodici elettronici Possibilità d’accesso al full-text (testo integrale): Gratuita es.: BMJ (Vedi lista dei periodici elettronici biomedici ad accesso gratuito Free Medical Journal ) A pagamento con licenza o abbonamento: Nella nostra realtà istituzionale, le riviste elettroniche biomediche (e non) dell’Ateneo di Torino (le licenze con gli editori)* sono disponibili in TROVA@unito e solo per le riviste biomediche (fino a giugno 2008) in OCAP *Per accedere ai FT dei periodici elettronici occorre andare in biblioteca, oppure consultarli dai computer dell’Università e delle Molinette (solo accesso al testo integrale di OVID FULL TEXT) oppure da casa tramite l’ uso del servizio “Off Campus Library”

RISORSE INTERNET SELEZIONATE Le risorse di PREFERITO coprono anche i siti infermieristici selezionati dalla biblioteca del Rosmini. RISORSE INTERNET SELEZIONATE