Famiglie di fattori di trascrizione

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Lez 9 Control of Gene Expression –1 procarioti.

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Geni costitutivi e non costitutivi

Bioinformatica Corso di Laurea specialistica in Informatica RNA: trascrizione e maturazione 21/03/2011.

TRASCRIZIONE del DNA.

STUDIO ESPRESSIONE GENICA.

Il "Dogma centrale" Replicazione DNA Trascrizione Trascrizione

Copolimero Assegnazione dei codoni mediante uso di copolimeri ripetuti contenenti due o tre nucleotidi Codoni presenti Amminoacidi incorporati Codoni.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans Possono.

Trasporto e localizzazione

Localizzazione delle proteine Citosol Nucleo Organelli Reticolo endoplasmatico Ambiente extracellulare.

Genomi degli organelli

Localizzazione delle proteine Citosol Nucleo Organelli Reticolo endoplasmatico Ambiente extracellulare.

(surveillance systems)

Il modello a doppia elica di Crick e Watson suggerisce un meccanismo di replicazione.

L’ordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA

Antiterminazione.

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CORSO DI BIOLOGIA - Programma

TERMINAZIONE IN PROCARIOTI ED EUCARIOTI

Modificazioni dell’rRNA

Pseudogeni = geni non funzionali

Rappresentazione schematica di un gene eucariote

Genomi degli organelli DNA circolare Copie multiple del genoma in ogni organello Dimensioni variabili.

Organizzazione del genoma Quanti geni? Quali geni? Quanti geni indispensabili?

Apparato di traduzione e sue componenti

Martedì 24 nov Bioinformatica Giovedì 26 nov Bio Mol.

Strutture superiori del DNA

Unità di ripetizione di diversi telomeri

Strutture alternative del DNA

Martedì 24 nov Bioinformatica Giovedì 26 nov Bio Mol.

Antiterminazione.

Struttura "modulare" degli attivatori

Strutture superiori del DNA

Martedì 21 nov ore Giovedì 23 nov ore Bioinformatica

Non-Stop Mediated Decay (NSMD)

Il superavvolgimento negativo

ESERCITAZIONE BIOINFORMATICA

Transcript della presentazione:

Famiglie di fattori di trascrizione Dita di zinco Omeodominio (elica-giro-elica) HTH Elica-ansa-elica HLH Cerniera di leucina

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Terminazione della trascrizione nei procarioti

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Un terminatore intrinseco è costituito da due regioni palindromiche che formano una forcina di 7-20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente) G T C A U 5 ' 3 - H . C G A U - O H ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC GTTTT CAAAA AAAAAA TTTTTT A T G C U UUUUUU 5' 3' -OH ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 5' 3' G C UUUUUUUU -OH ... CCCA A U

Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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Antiterminazione

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Attenuazione

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Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

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Peptidi "leader" degli operoni "attenuati" codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi