Esercitazione TEST DIAGNOSTICO
PROBLEMA n° 1 (punti 6) In un laboratorio biochimico-clinico si sono eseguite, con un certo metodo analitico 9 determinazioni di uno standard a concentrazione nota di creatinina (=90 moli/l), e si sono ottenute le seguenti misure: 87 83 87 86 87 90 84 95 84 moli/l Calcola il valore mediano delle 9 misure. R: 87 Stima l'inaccuratezza del metodo analitico (in moli/l).R: -3 Stima l'imprecisione del metodo analitico (in moli/l). R: 3.67 Stima l'imprecisione relativa del metodo analitico. R: 4.08 %1
PROBLEMA n° 2 (p. 4) Un test diagnostico per la malattia M ha specificità e sensibilità pari al 95%. Il test viene applicato ad una popolazione di 4000 soggetti nella quale la prevalenza della malattia M è del 6%. Quanti soggetti ci si attende che risultino positivi al test in tale popolazione? R:____4
PROBLEMA n° 2 (p. 4) T- T+ M- (Sp)(1-Prev)(N) (1-Sp)(1-Prev)(N) (1-Sn)(Prev) (N) (Sn)(Prev) (N) (Prev)(N) Negativi Positivi N Totale 3572 188 3760 12 228 240 3584 416 4000
PROBLEMA n° 3 (p. 7) Un test per la diagnosi della malattia M ha sensibilità pari al 96% e specificità pari al 99%. In una data popolazione di 8000 persone sottoposte al test, si sono osservati 7065 esiti negativi. Calcola: Quanti soggetti con la malattia M … ci sono in quella popolazione R: 900 /4 Il valore predittivo di un esito positivo al test per tale popolazione. R: (0.96)(900)/(935) /1 Il valore predittivo di un esito negativo al test per tale popolazione. R: (0.99)(7100)/(7065) /1 L’accuratezza del test diagnostico per tale popolazione. R: (0.99)(.8875)+(0.96)(0.1125) /1
PROBLEMA n° 3 (p. 7) T- T+ Totale M- (Sp)(1-Prev) (1-Sp)(1-Prev) (1-Sn)(Prev) (Sn)(Prev) Prev P(T-) P(T+) 1.00 (0.96)(8000-Malati) (0.04)(8000-Malati) (8000-Malati) (0.01)(Malati) (0.96)(Malati) (Malati) 7065 935 8000 (0.96)(8000)+(0.01-0.96)(Malati)=7065; (7920)–(0.95)(Malati)=7065; Malati=900; Prev=900/8000=0.1125
PROBLEMA n° 4 (p. 7) I seguenti dati sono estratti da una studio che esamina l'uso della ventricolografiaradionucleica nell'individuazione della patologia coronarica malattia Test Presente Assente totale Positivo 302 80 382 Negativo 179 372 551 481 452 933
PROBLEMA n° 4 Quale è la sensibilità della ventrilografia _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ Sens = (302)/(481) = 0.627859 Spec = (372)/(452) = 0.823009 Per una popolazione nella quale la prevalenza di patologie coronariche è Prev=0.10 stimare la probabilità che un individuo presenti la malattia, in presenza di un risultato positivo della ventricolografia radionucleica. P(Malattia |T+)=(Sens)(Prev)/[(Sens)(Prev)+(1-Spec)(1-Prev)] vpp = 0.28272 Quale è il valore predittivo negativo della ventrilografia P(non Malattia|T-)=(Spec)(1-Prev)/[(Spec)(1-Prev)+(1-Sens)(Prev)] vpn = .95216213
PROBLEMA n° 5 (p. 4) Nel Framingham Study, sono stati misurati i livelli di colesterolo sierico per un gran numero di soggetti maschi in buona salute. La popolazione è stata poi seguita per sedici anni. Alla fine di questo periodo, i soggetti sono stati divisi in due gruppi: 1) coloro che avevano sviluppato malattie coronariche (malati). 2) coloro che non avevano sviluppato malattie coronariche (normalii). La distribuzione dei livelli di colesterolo sierico nei due gruppi (all’inizio dello studio) è stata ricostruita ed è stata trovata approssim… gaussiana con media=244 mg/dl e dev.stand.=51 mg/dl nei soggetti che hanno poi sviluppato la malattia e con media=219 mg/dl e dev.stand.=41 mg/dl nei soggetti che non hanno poi sviluppato malattia (MacMahon SW, McDonald GJ: A population at risk: prevalence of high cholesterol levels in hypertensive patients in Framingham Study,(1986) Am.J.Med.Sup.:80:40-47) Un test diagnostico giudica a rischio di sviluppare la malattia coronarica coloro che hanno un livello di colesterolo sierico maggiore o uguale al livello = 260 mg/dl.
VP FP PREVISIONE DI FUTURA CARDIOPATIA
DOMANDE quale è la probabilità ha di predire la malattia coronarica per un soggetto che in seguito non la svilupperà mai ? _ _ _ _ _ _ _ _ _ quale è la probabilità di non predire la malattia coronarica per un soggetto che in seguito la svilupperà ? _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ Che cosa accadrebbe alle probabilità dei falsi positivi e falsi negativi se la soglia del test diagnostico per predire la malattia coronarica fosse ridotta a 250 mg/dl ? _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ In questa popolazione il livello di colesterolo sierico sembra utile per predire la malattia coronarica? _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
Risposte Z P(Z>Z0) 0.314 FN = 0.623 VP = 0.377 1.000 VN = 0.841 FP = 0.159 0.118 FN = 0.547 VP = 0.453 0.756 VN = 0.775 FP = 0.255
PROBLEMA n° 6 (p. 4) Nel 1993 il servizio sanitario degli studenti di una università molto frequentata della costa ovest degli Stati Uniti condusse una ricerca. Durante i 4 mesi di corso, le donne che si rivolgevano al servizio sanitario per una visita ginecologica di routine venivano invitate a partecipare a uno studio per valutare l’utilità di due test VIRA e PCR nel rivelare l’amplificazione del DNA in presenza di HPV (human papilloma virus). Entrambi questi test erano facili da condurre in laboratorio, non costosi ed altamente riproducibili; nulla si sapeva del loro impiego sugli esseri umani. Lo striscio cervicale di ogni partecipante fu valutato per il contenuto di HPV sia con il metodo Southern blot che con la PCR e il VIRA. Il vero stato dell’infezione è basato sul metodo Southern blot hybridization (l’attuale Gold Standard per definire lo stato dell’HPV). Fu messo in evidenza che 200 delle 467 donne erano state colpite da HPV; i dati sono riportati nelle tabelle seguenti.
test con determinazione PCR in 467 donne test con determinazione VIRA in 467 donne PCR vero stato dell’infezione VIRA Vero stato dell’infezione test D- D+ Totale totale T+ 190 23 213 45 6 51 T- 10 244 254 155 261 416 TOTALE 200 267 467
Dai dati delle due tabelle cercate di individuare quale test dovrebbe essere usato in una situazione analoga ? Prevalenza stimata: PCR VIRA Infezioni/100 donne (213/467)x100 = 45,60 (51/467)x100 10,93 Sensibilità (190/200)x100 95,00 (45/200)x100 22,50 Specificità (244/267)x100 91,39 (261/267)x100 97,75 Falsi negativi (10/200)x100 5,00 (155/200)x100 77,50 Falsi positivi (23/267)x100 8,61 (6/267)x100 2,25 VPP (190/213)x100 89,2 (45/51)x100 88,24 VPN (244/254)x100 96,06 (261/416)x100 62,74