Acidi nucleici: un copolimero fosfato-ribosio Chimica Organica II Acidi nucleici: un copolimero fosfato-ribosio La differenza tra RNA e DNA sta nell’assenza dell’ossidrile 2’ del ribosio nel secondo, che rende la macromolecola molto più stabile all’idrolisi

Acidi nucleici Chimica Organica II La minor stabilità dell’RNA è dovuta al fatto che l’ossidrile in 2’ può agire come nucleofilo intramolecolare. A pH 7 e 25 °C il tempo di semivita del’RNA è di 100 anni, quello del DNA è 100 milioni di anni

Acidi nucleici: nuclobasi Chimica Organica II Acidi nucleici: nuclobasi purina pirimidina adenina guanina citosina uracile timina RNA DNA

Acidi nucleici: nucleosidi Chimica Organica II Acidi nucleici: nucleosidi

Un desossiribonuclotide Chimica Organica II Acidi nucleici: nucleotidi Adenosina 5’-monofososfato Un ribonuclotide 2’-desossicitidina 3’-monofososfato Un desossiribonuclotide

Acidi nucleici: base pairing Chimica Organica II Acidi nucleici: base pairing

Acidi nucleici: coppie di basi Chimica Organica II Acidi nucleici: coppie di basi Coppie di basi di Watson e Crick

Acidi nucleici: doppia elica Chimica Organica II Acidi nucleici: doppia elica Major groove Minor groove

Acidi nucleici: doppia elica Chimica Organica II Acidi nucleici: doppia elica G-quadruplex Sono note altre strutture oltre alla doppia elica B

Acidi nucleici: interazione con le proteine Chimica Organica II Acidi nucleici: interazione con le proteine Soppressore di trascrizione legato all’elica B nei major grooves Enzima di restrizione EcoRV legato al DNA

Acidi nucleici: duplicazione del DNA Chimica Organica II Acidi nucleici: duplicazione del DNA Le DNA polimerasi possono estendere un DNA solo in direzione 5’ –3’

Acidi nucleici: trascrizione del DNA Chimica Organica II Acidi nucleici: trascrizione del DNA Una RNA polimerasi copia la sequenza bersaglio in un RNA messaggero

Acidi nucleici: sintesi delle proteine Chimica Organica II Acidi nucleici: sintesi delle proteine Il ribosoma contiene m-RNA come elemento attivo

Nucleotidi ed energia: ATP Chimica Organica II Nucleotidi ed energia: ATP ATP + H20 = ADP + idrogeno fosfato - 7.3 Kcal/mol

Nucleotidi ed energia: ATP Chimica Organica II Nucleotidi ed energia: ATP La reazione non avviene: il gruppo uscente è troppo povero ATP è molto reattiva, reagisce con l’acetato fosforilandolo. Quest’ultimo derivato è sufficientemente reattivo da reagire con il tiolo.