FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori costitutivi inducibili

Agente regolatore Modulo ConsensusFattore Grandezza (dalton) Shock termico Glucocorticoidi Cadmio TPA Siero HSE GRE MRE TRE SRE CNNGCCNNTCCNNG TGGTACAAATGTTCT CGNCCCGGNCNC TGACTCA CCATATTAGG HSTF Recettore ? AP1 SRF 93,000 94,000 ? 39,000 52,000 Gli attivatori inducibili legano: elementi di risposta che identificano gruppi di promotori, o enhancer soggetti a controllo coordinato

I FATTORI DI TRASCRIZIONE (ATTIVATORI) HANNO UN STRUTTURA MODULARE COMPOSTA DA DIFFERENTI DOMINI legame al DNA transattivazione dimerizzazione legame al ligando

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Struttura degli attivatori

Scambio di domini di attivatori

Dominio Dito di Zinco

Omeodominio (HTH, Elica-giro-Elica)

Dominio Elica-Ansa-Elica (bHLH)

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Famiglie di fattori di trascrizione Dito di zinco (zinc finger) Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) Elica-ansa-elica (helix loop helix, bHLH) Cerniera di leucina (leucine zipper, bZIP)

Dimerizzazione degli attivatori

Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri

Struttura dellEnhanceosoma dellinterferone

Attivazione della trascrizione mediante reclutamento

Attivazione della trascrizione

Modificazioni della cromatina mediate dagli attivatori

Acetilazione e deacetilazione della cromatina Corepressore

Terminazione della trascrizione nei procarioti

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Un terminatore intrinseco è costituito da due regioni palindromiche che formano una forcina di 7-20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U.

C G C A G C A G C A G C A U G C A U GC A U U U A U A U A U G A U G A U G -OH U G A U G C A U G C A U G C A U G C A U G C U C... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC GTTTT CAAAA AAAAAA TTTTTT A T G A C T G C G U C CC UUUUUU 5' 3' -OH 5' 3'... T T A A U G C G C C A C A C A U C G A U C G GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 5' 3' 5' 3' G C G UUUUUUUU -OH... G C G C C CCCA C A C A U C G A U C G Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G

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Terminazione Rho- dipendente

Antiterminazione

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Attenuazione

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Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

Operone triptofano

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Il ribosoma determina la formazione delle strutture

Peptidi "leader" degli operoni "attenuati" codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi

Terminazione negli eucarioti

pol I e pol IIIpol II

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La poliadenilazione degli mRNA eucariotici

CPSF riconosce seq. AAUAAA CstF lega GU, stimola CFI, CFIIendonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein