Esperimento che dimostra che U1 snRNA riconosce il sito di splicing al 5 mediante appaiamento di basi 1)Mutazioni al 5 ss inibiscono lo splicing 2)Mutazioni complementari su U1 snRNA ripristinano lo splicing
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Esistono introni che fanno splicing in assenza di proteine e snRNA AUTOSPLICING o SPLICING AUTOCATALITICO (introni di gruppo I e II)
Gli introni nucleari sono originati da quelli autocatalitici - conservazione della chimica della reazione e delle strutture Il nucleo catalitico dello spliceosome è formato dallinterazione di tre diversi RNA: U2-U6 e il pre-mRNA. Questa struttura è perfettamente conservata in cis negli introni autocatalitici di gruppo II U2 U6 Spliceosomal Group II Exon 1 Exon 2 Exon 1
Da cis a trans- splicing Lo splicing degli introni autocatalitici dipende da una struttura molto complessa (ogni mutazione al loro interno sarebbe di danno al gene ospite) Per questo motivo nel corso dellevoluzione le sequenze richieste in cis sono state messe in trans - splicing degli introni nucleari gli snRNA sono sequenze che negli introni autocatalitici stavano allinterno dellintrone stesso
Gene number Transcript number ~25k ~15k ~20k ~6,5k ~31k ~30k ~25k Come giustificare il considerevole aumento di complessità degli eucarioti superiori con un aumento così limitato nel numero di geni?
Lo splicing alternativo aumenta la codogenicità del genoma