Strutture superiori del DNA

Presentazione sul tema: "Strutture superiori del DNA"— Transcript della presentazione:

1 Strutture superiori del DNA

2 Superavvolgimento del DNA

3 Il superavvolgimento negativo
DNA superavvolto negativamente Il superavvolgimento negativo può convertirsi nella separazione locale dei due filamenti

4 separazione dei filamenti (denaturazione di regioni ricche in A+T)
struttura Z (in corrispondenza di regioni di alternanza Pu/Py) strutture cruciformi (in corrispondenza di palindromi)

5 Superavvolgimento del DNA
Positivo = DNA superspiralizzato Negativo = DNA sottospiralizzato

6 Enzimi che alterano la topologia del DNA
Topoisomerasi: tipo I tipo II

7 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

8 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

9 Topoisomerasi

10 Enzimi che agiscono sugli acidi nucleici
Polimerasi: DNA polimerasi RNA polimerasi Nucleasi: esonucleasi endonucleasi

11 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

12 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

13 Proprietà del DNA Appaiamento (associazione)
Denaturazione Rinaturazione

14 Spettro di assorbimento del DNA
220 240 260 280 300 320 0.5 1.0 1.5 lunghezza d’onda (nm) Assorbanza effetto ipercromico

15 Fusione (melting) della doppia elica
70 80 90 100 T ( °C) Assorbanza relativa 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Fusione (melting) della doppia elica e misura del Tm (Temperature of melting = Temperatura di fusione) Tm = 83°C

16 Dipendenza della denaturazione del DNA dal contenuto in G+C
Tm (°C) G+C (moli %)

17 Fattori che influenzano la denaturazione
Temperatura Forza ionica pH

18 B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S. p. A
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007

19 Riassociazione del DNA

20 Riassociazione del DNA

21 Appaiamento su filtro (ibridazione)

22 Sequenze palindromiche

23 Strutture a "forcina"

24 Struttura cruciforme

25 Strutture dell'RNA

26 Struttura "pseudonodo"

27 Mutazioni Una modificazione chimica di una base
Incorporazione di una base sbagliata

28 B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S. p. A
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007

29 Il "Dogma centrale" Replicazione DNA Trascrizione inversa RNA
Traduzione Replicazione DNA RNA Proteina inversa