Corso di Biologia Molecolare Prof. Nicola ZAMBRANO (matr. dispari)

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1 Corso di Biologia Molecolare Prof. Nicola ZAMBRANO (matr. dispari)
a.a Corso di Biologia Molecolare Prof. Nicola ZAMBRANO (matr. dispari) 1

2 a.a. 2016-2017 Corso di Biologia Molecolare
Struttura e funzioni di acidi nucleici e proteine attraverso l’analisi di meccanismi molecolari fondamentali in Procarioti ed Eucarioti 2

3 BIOLOGIA MOLECOLARE Struttura e funzioni di acidi nucleici e proteine
attraverso l’analisi di meccanismi molecolari fondamentali in Procarioti ed Eucarioti Propagazione, conservazione e variabilità dell’informazione genetica (replicazione, riparo e ricombinazione) Trasferimento in RNA dell’informazione genetica (trascrizione) e maturazione dei trascritti Decodifica del linguaggio genetico in proteine (traduzione) Regolazione trascrizionale e post-trascrizionale dell’espressione genica 3

4 Biologia Molecolare 2016-2017 Matr. Pari e Dispari
Iscrizione al Corso: Frequenza fortemente consigliata n. 2 prove in itinere: inizio novembre/fine dicembre Settimana “di riepilogo” prima della prova in itinere Valore alle prove in itinere solo per chi lo desidera e frequenta attivamente Date esami: 17/1/ /2/2016 (Scritto + Ev. orale) Prova scritta: DSM DRA

5 LABORATORIO DI BIOLOGIA MOLECOLARE
Tecniche di manipolazione, clonaggio, sequenziamento ed amplificazione del DNA Tecniche per l’analisi dell’espressione genica Espressione di proteine esogene in sistemi procariotici ed eucariotici 5

6 TESTI CONSIGLIATI APPUNTI DELLE LEZIONI
Autori vari (coord. Russo-Zambrano) - Biologia Molecolare - EDISES I Edizione (2016) TESTI UTILI PER LA CONSULTAZIONE Weaver – Biologia Molecolare – McGraw-Hill Watson - Biologia Molecolare del Gene - Zanichelli Lewin - Il Gene X - Zanichelli Reece - Analisi di Geni e Genomi - EDISES 6

7 PREREQUISITI Struttura e funzioni della cellula
Chimica delle biomolecole Princìpi di Genetica Struttura delle proteine Catalisi enzimatica 7

8 L’era “pre-genomica” 8

9 L’era “genomica” 9

10 L’era “post-genomica”
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11 Il dogma centrale della Biologia, nell’era post-genomica
GENOMA ~ 3 x 104 geni TRASCRITTOMA (splicing alternativi) ≥ 10 x PROTEOMA (modifiche post-traduzionali) 105 ÷ 106 prodotti 11

12 Meccanismi molecolari di malattie…
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13 …ed identificazione/ottimizzazione di bersagli terapeutici
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31 ORIENTAMENTO DELLA BASE RISPETTO AL LEGAME N-GLICOSIDICO
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33 C3’ - endo 33

34 C2’ - endo 34

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43 TOPOLOGIA DEL DNA 43

44 MOLECOLE NATURALI DI DNA PRESENTANO
SUPERAVVOLGIMENTI 44

45 TOPOISOMERI DI DNA SONO RISOLVIBILI MEDIANTE ELETTROFORESI
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46 Perché il DNA è naturalmente superavvolto?
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47 TOPOLOGIA DEL DNA E: 1. COMPATTAMENTO DELLA CROMATINA
Procarioti Eucarioti 47

48 BASATI SULL’ ESPOSIZIONE DI UNO STAMPO
2. INNESCO DI MECCANISMI BASATI SULL’ ESPOSIZIONE DI UNO STAMPO 48

49 3. RISOLUZIONE DI SUPERAVVOLGIMENTI
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50 Denaturazione e Superavvolgimenti
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51 IL DNA DEI MESOFILI è SUPERAVVOLTO NEGATIVAMENTE
E IL DNA DEI TERMOFILI ? 51

52 Conformazione del DNA superavvolto
DNA B rilassato: 34.6° tra una coppia e la successiva 10.4 nucleotidi per giro DNA superavvolto positivamente (+) 40° tra una coppia e la successiva 9 nucleotidi per giro DNA superavvolto negativamente (-) 33° tra una coppia e la successiva 11 nucleotidi per giro 52

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58 TOPOISOMERASI: MECCANISMO
Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005 58 58

59 Inibitori di Topoisomerasi I: Topotecan (der. Camptotecina)
Staker et al. (2002) PNAS 99,15387 Inibitori di Topoisomerasi II: Etoposide, doxorubicina, daunorubicina, mitoxantrone 59 59

60 Camptotecina e Derivati
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