Strutture alternative del DNA

Presentazione sul tema: "Strutture alternative del DNA"— Transcript della presentazione:

1 Strutture alternative del DNA

2 Gli acidi nucleici possono formare vari tipi di doppia elica

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4 Gli acidi nucleici possono formare vari tipi di doppia elica
Coppie di basi per giro Rotazione tra due basi Diametro B 10 (10,4) 36 (34,6) 20 (19) A 11 32,7 23 Z 12 -30 18

5 Strutture superiori del DNA

6 Superavvolgimento del DNA

7 Il superavvolgimento negativo
DNA superavvolto negativamente Il superavvolgimento negativo può convertirsi nella separazione locale dei due filamenti

8 separazione dei filamenti (denaturazione di regioni ricche in A+T)
struttura Z (in corrispondenza di regioni di alternanza Pu/Py) strutture cruciformi (in corrispondenza di palindromi)

9 Superavvolgimento del DNA
Positivo = DNA superspiralizzato Negativo = DNA sottospiralizzato

10 Enzimi che alterano la topologia del DNA
Topoisomerasi: tipo I tipo II

11 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

12 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

13 Topoisomerasi

14 Enzimi che agiscono sugli acidi nucleici
Polimerasi: DNA polimerasi RNA polimerasi Ligasi Nucleasi: esonucleasi endonucleasi

15 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

16 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

17 Proprietà del DNA Appaiamento (associazione)
Denaturazione Rinaturazione

18 Fattori che influenzano la denaturazione
Temperatura Forza ionica pH

19 Spettro di assorbimento del DNA
220 240 260 280 300 320 0.5 1.0 1.5 lunghezza d’onda (nm) Assorbanza effetto ipercromico

20 Fusione (melting) della doppia elica
70 80 90 100 T ( °C) Assorbanza relativa 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Fusione (melting) della doppia elica e misura del Tm (Temperature of melting = Temperatura di fusione) Tm = 83°C

21 Dipendenza della denaturazione del DNA dal contenuto in G+C
Tm (°C) G+C (moli %)

22 B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S. p. A
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007

23 Riassociazione del DNA

24 Riassociazione del DNA

25 Appaiamento su filtro (ibridazione)

26 Sequenze palindromiche

27 Strutture a "forcina"

28 Struttura cruciforme

29 Strutture dell'RNA

30 Struttura "pseudonodo"

31 Alterazione dell’informazione: le mutazioni
Una modificazione chimica di una base Incorporazione di una base sbagliata

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33 Il "Dogma centrale"

34 Il "Dogma centrale" Replicazione DNA Trascrizione inversa RNA
Traduzione Replicazione DNA RNA Proteina inversa