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Struttura "modulare" degli attivatori
legame al DNA transattivazione dimerizzazione legame al ligando
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Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Struttura degli attivatori
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Scambio di domini di attivatori
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Dominio Dito di Zinco
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Omeodominio (HTH, Elica-giro-Elica)
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Dominio Elica-Ansa-Elica (bHLH)
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Famiglie di fattori di trascrizione
Dito di zinco (zinc finger) Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) Elica-ansa-elica (helix loop helix, bHLH) Cerniera di leucina (leucine zipper, bZIP)
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Dimerizzazione degli attivatori
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Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri
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Struttura dell’ “Enhanceosoma”
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Attivazione della trascrizione mediante reclutamento
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Attivazione della trascrizione
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Modificazioni della cromatina mediate dagli attivatori
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Acetilazione e deacetilazione della cromatina
Corepressore
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Gli attivatori sono "bersaglio" di vie di trasduzione
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Terminazione della trascrizione
nei procarioti
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Terminatore intrinseco
Due regioni palindromiche che formano una forcina di 7-20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente)
G T C A U 5 ' 3 - H . C G A U - O H ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC GTTTT CAAAA AAAAAA TTTTTT A T G C U UUUUUU 5' 3' -OH ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 5' 3' G C UUUUUUUU -OH ... CCCA A U
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Terminatore rho dipendente
Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Terminazione rho-dipendente
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Antiterminazione
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Attenuazione
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Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate
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Operone triptofano
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Il ribosoma influenza la formazione delle strutture
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Peptidi leader di operoni "attenuati"
codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi
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Terminazione negli eucarioti
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pol I e pol III pol II
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La poliadenilazione degli mRNA eucariotici
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CPSF riconosce seq. AAUAAA
CstF lega GU, stimola CFI, CFII endonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein
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