La“Pribnow box” nei promotori di E.coli

Presentazione sul tema: "La“Pribnow box” nei promotori di E.coli"— Transcript della presentazione:

1 La“Pribnow box” nei promotori di E.coli
fd ..TGCTTCTGACTATAATAGACAGGGTAAAGACCTGATTTTTGA T7 A3 AAGTAAACACGGTACGATGTACCACATGAAACGACAGTGAGTCA T7 A2 AGTAACATGCAGTAAGATACAAATCGCTAGGTAACACTAGCAG. Lac-UV- 5 GCTTCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA. l P ACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG... R l P L ACCACTGGCGGTGATACTGAGCACATCAGCAGGACGCACTGAC. Tyr tRNA ..CGTCATTTGATATGATGCGCCCCGCTTCCCGATAAGGGAGCA Lac w.t. GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA. Consenso -10 T80A95T45A60A50T96 5-9 bp A/G T82T84G78A65C54A45 Consenso -35

2 Il promotore di E.coli è costituito da tre componenti:
le sequenze consenso -35 e -10, e il sito d’inizio TATAAT TTGACA 5-9 basi 16-19 basi -10 -35 Sequenza -35 Pribnow box Sito di inizio della trascrizione +1

3 Esperimento di “foot printing”
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

4 Promotori procariotici

5 Regolazione della trascrizione

6 Fattori Sigma di E.coli

7 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

8 Vari fattori Sigma regolano le fasi d’infezione del fago SPO1

9 Fattori trans-agenti Elementi cis-agenti

10 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

11 Struttura dell’operone

12 Controllo negativo Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

13 Controllo positivo

14 Controllo negativo e positivo

15 Metabolismo del lattosio
Glucosio Galattosio Legame b-galattosidico b-galattosidasi

16 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

17 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

18 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

19 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

20 Sequenza del promotore lac

21 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

22 Operone lattosio

23

24 Operone triptofano

25 Figura 10.17 L’operone triptofano.

26 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

27 Controllo negativo

28 Controllo positivo

29 Operone arabinosio di E.coli (controllo positivo)

30 Operone arabinosio

31 Proteina CAP (CRP)

32 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

33 CAP interagisce con la polimerasi

34 Regolazione positiva NtrC è un regolatore positivo che non agisce tramite "reclutamento" ma tramite modificazione allosterica della polimerasi

35 Tipi di regolazione Corepressore Corepressore

36 Regolazione dell'operone lattosio