Suddivisione della popolazione

Presentazione sul tema: "Suddivisione della popolazione"— Transcript della presentazione:

1 Suddivisione della popolazione
STATISTICA F DI WRIGHT Suddivisione della popolazione  eccesso di omozigosità I  organismi individuali Popolazione complessa è composta da S  sottopopolazioni T  popolazione totale

2 STATISTICA F DI WRIGHT Si definiscono: HI = eterozigosità media osservata tra le popolazioni Hs = eterozigosità attesa della sottopopolazione secondo la legge di Hardy-Weinberg HT = eterozigosità attesa di una popolazione complessiva con accoppiamento casuale

3 STATISTICA F DI WRIGHT HI = eterozigosità media osservata tra le popolazioni Dato Hi come eterozigosità della popolazione i, in caso di k popolazioni

4 STATISTICA F DI WRIGHT Hs = eterozigosità attesa della sottopopolazione secondo la legge di Hardy-Weinberg Dato pi,s come frequenza dell’allele i-esimo della sottopopolazione s, e Hs come eterozigosità attesa della sottopopolazione secondo la legge di Hardy-Weinberg, allora e è la media delle Hs di tutte le sottopopolazioni

5 STATISTICA F DI WRIGHT HT = eterozigosità attesa di una popolazione complessiva con accoppiamento casuale Dato come frequenza media dell’allele i-esimo nella popolazione complessiva, allora

6 FIS  coefficiente di consanguineità
STATISTICA F DI WRIGHT Con questi indici possiamo misurare: 1) il coefficiente di consanguineità dovuto agli accoppiamenti non casuali all’interno della popolazione, mediante l’aumento dell’omozigosità FIS  coefficiente di consanguineità

7 FST  indice di fissazione
STATISTICA F DI WRIGHT 2) l’indice di fissazione, che rappresenta la perdita di eterozigosità di una popolazione suddivisa dovuta alla deriva genetica FST  indice di fissazione notare perchè Se la popolazione totale è in equilibrio di Hardy-Weinberg

8 STATISTICA F DI WRIGHT 2pq HT HSB Eterozigosità (H) HSA pA pB Frequenza allelica (p)

9 STATISTICA F DI WRIGHT Per misurare il coefficiente di consanguineità complessivo si può usare il parametro FIT che comprende sia la perdita di eterozigosità dovuta agli accoppiamenti non casuali all’interno della sottopopolazione (FIS) sia la frammentazione della popolazione complessiva (FST):

10 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
GOT = Glutamic-Oxaloacetic Transaminase Sono state individuate nel Texas 43 sottopolazioni di Phlox cuspidata. Queste sottopopolazioni sono state studiate per quanto riguarda il gene Got-2 che possiede 3 alleli: Got-2*A, Got-2*B e Got-2*C. I risultati sono stati: 39 sottopopolazioni monomorfiche per Got-2*B “ con frequenze Got-2*A = 0,37 e Got-2*B = 0,63 “ con frequenze Got-2*B = 0,87 e Got-2*C = 0,13 “ con frequenze Got-2*B = 0,82 e Got-2*C = 0,18 “ con frequenze Got-2*B = 0,91 e Got-2*C = 0,09

11 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , 1 0,37 0, , ,13 , ,18 , ,09 0,00 0,17 0,09 0,06

12 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio

13 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , 1 0,37 0, , ,13 , ,18 , ,09 0,00 0,17 0,09 0,06 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16

14 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio

15 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , 1 0,37 0, , ,13 , ,18 , ,09 0,00 0,17 0,09 0,06 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16 43

16 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio

17 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
Coefficiente di consanguineità Indice di fissazione Coefficiente di consanguineità complessivo

18 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
Notare che frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , 1 0,37 0, , ,13 , ,18 , ,09 0,00 0,17 0,09 0,06 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16 43

19 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio
HI = eterozigosità media osservata tra le popolazioni Che è uguale all’eterozigosità attesa media di tutte le sottopopolazioni

20 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio è naturalmente uguale a zero
Coefficiente di consanguineità è naturalmente uguale a zero Indice di fissazione Coefficiente di consanguineità complessivo NOTA: l’indice di fissazione e il coefficiente di consanguineità complessivo sono uguali