Involucro proteico del fago T2 circondato dal suo DNA

Presentazione sul tema: "Involucro proteico del fago T2 circondato dal suo DNA"— Transcript della presentazione:

1 Involucro proteico del fago T2 circondato dal suo DNA

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3 Lunghezza del DNA di E.coli
Paragonata alla cellula

4 Il DNA di una cellula di E.coli lisata

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6 Una singola cellula umana contiene
2m di DNA, un singolo cromosoma Circa 4,5cm. L’intero corpo umano ha DNA per Coprire 1000 volte la distanza Terra-sole

7 Oltre al DNA nucleare c’e’ il DNA mitocondriale
Che codifica per alcune proteine e RNA mitocondriali

8 Una torsione sull’asse della molecola
di DNA genera un superavvolgimento

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13 Lk = coppie basi/coppie basi per giro
2100nt rilassato

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15 Un parziale disavvolgimento del DNA
puo’ facilitare la formazione di strutture cruciformi in corrispondenza di sequenze palindrome

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17 Meccanismo di azione della topoisomerasi II (DNA girasi).

18 Superavvolgimento Plectonemico

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21 Superavvolgimento Plectonemico e a solenoide Disegnati con la stessa scala

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34 Cromosoma umano parzialmente
srotolato.

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38 Lunghezza del cromosoma
5 avvolgimenti della doppia elica 2nm Lunghezza del cromosoma sezione della cromatina 11nm 50.000:1 fibra di 30nm con i nucleosomi strettamente impacchettati 30nm 300nm parte di una sezione di cromosoma sezione condensata di un cromosoma metafasico 700nm 1400nm cromosoma metafasico

39 Organizzazione del cromosoma I
spiralizati doppia elica di DNA istoni parzialmente despiralizati H2A H2B H3 H4 H4 H2B H3 H2A DNA istone H1 despiralizati nucleosoma struttura della cromatina

40 Costituenti del cromosoma
TELOMERO COSTRIZIONE SECONDARIA CENTROMERO (COSTRIZIONE PRIMARIA) TELOMERO

41 Centromero Fibre del fuso dominio centrale DNA satellite dominio del
cinetocore dominio di appaiamento

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45 STABILITA’ DEI CROMOSOMI
Telomeri COMPOSTI DA ETEROCROMATINA HANNO UNA SEQUENZA COMUNE ( in uomo TTAGGG) ESSENZIALI NELLA STABILITA’ DEI CROMOSOMI

46 Telomeri FISH

47 La cromatina si distingue in:
Cromatina I La cromatina si distingue in: eucromatina facoltativa eterocromatina costitutiva

48 Metilazione del DNA Nei vertebrati la metilazione interessa solamente la Citosina sul dinucleotide CpG : l’enzima citosina metiltransferasi aggiunge un gruppo metile al C5 della citosina:il risultato è la 5-metilcitosina. Human Molecular Genetics 2

49 Metilazione del DNA ma abbondanti nelle regioni promotrici dei geni
Le sequenze CpG sono sotto-rappresentate nel genoma (probabilmente per la tendenza della 5-metilcitosina a venire deaminata e mutata in T) ma abbondanti nelle regioni promotrici dei geni

50 In cellule non embrionali, 80% dei CpG sono metilati, ad eccezione delle isole CpG dei promotori
Dnmt1 ha particolare affinità per le sequenze emi-metilate: tende quindi a metilare il nuovo filamento che si è formato su uno stampo metilato-> mantenimento del pattern di metilazione

51 Fasi di metilazione: Metilazione differenziale de novo (Dnmt3a e Dnmt3b); Demetilazione (natura sconosciuta delle demetilasi); Mantenimento della metilazione e trasmissione alle cellule figlie (Dnmt1).

52 Le principali funzioni della metilazione sono collegate alla repressione della trascrizione:
Difesa contro i trasposoni: la metilazione e’ fondamentale per mantenere silenti i genomi dei trasposoni e dei retrotrasposoni Regolazione genica: la metilazione contribuisce a stabilire e mantenere uno stato trascrizionalmente inattivo (eterocromatina)

53 Corepressori HDAC 1 HDAC 2 MeCP2 Repres. CH3 CH3 CH3 CH3 Deacetilazione delle lisine di H3 e H4

54 Metilazione e regolazione genica:
Dnmt metilano il DNA Il DNA metilato è legato da proteine che legano il metile (MeCP2, MBD1-4) Queste a loro volta sono in grado di reclutare diversi HDAC -> repressione della trascrizione

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56 Modificazioni epigenetiche:
Modificazioni ereditabili che non alterano la sequenza nucleotidica dei geni ma ne alterano l’attivita’: Acetilazione degli istoni della cromatina Metilazione del DNA