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CINETICA CHIMICA
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Cinetica: studio della velocità di una reazione
Scopo della Cinetica: comprendere il meccanismo della reazione, ovvero la sequenza delle tappe elementari che compongono una trasformazione chimica La velocità di una reazione ed il modo in cui essa varia in risposta a condizioni diverse sono strettamente correlati al meccanismo della reazione. Per questo, studiando la cinetica di una reazione si possono avere informazioni sul suo meccanismo.
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Molecolarità di una reazione
Unimolecolare Bimolecolare Trimolecolare
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Ordine di una reazione Primo ordine Secondo ordine Terzo ordine
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a= ordine rispetto ad A a+b = ordine della reazione
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Molecolarità e ordine non devono necessariamente
coincidere Trimolecolare Secondo ordine
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Equazione di velocità di primo ordine
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Pendenza = k k = 2 s-1 k = t-1
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t1/2 t1/2 = costante
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Equazione di velocità di secondo ordine
k = M-1t-1
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CINETICA ENZIMATICA
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1902 – Adrian Brown dimostrò che quando la
concentrazione del saccarosio è molto più alta di quella dell’enzima, la velocità della reazione diventa indipendente da quella del substrato: la velocità è di ORDINE ZERO rispetto al saccarosio Non può essere integrata a meno di assunzioni semplificatrici
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ASSUNZIONE DI EQUILIBRIO
1913 – Leonor Michaelis e Maude Menten, lavorando su una precedente ipotesi di Victor Henri, assunsero che k-1>>k2, cioè che la prima tappa della reazione potesse raggiungere l’equilibrio.
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Equazione di Michaelis - Menten
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ASSUNZIONE DI STATO STAZIONARIO
(G.E Briggs e James B.S. Haldane) FASI DI UNA REAZIONE CATALIZZATA DA UN ENZIMA: 1) Fase pre-stazionaria 2) Fase stazionaria (quando la reazione ha raggiunto un equilibrio dinamico)
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GRAFICO DEI DOPPI RECIPROCI
L’equazione di Michaelis – Menten può essere trasformata in una equazione lineare rispetto a 1/v0
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La costante catalitica di un enzima (kcat) è il numero di cicli catalitici completati
nell’unità di tempo. Viene anche chiamata “numero di turnover” di un enzima ed è di fatto una frequenza. Il rapporto kcat/Km (costante di specificità) è una misura dell’efficienza catalitica di un enzima:
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EQUAZIONE DI HALDANE
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INIBIZIONE ENZIMATICA
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INIBIZIONE COMPETITIVA
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INIBIZIONE INCOMPETITIVA
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INIBIZIONE MISTA
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Vmax/’ KM/’
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EFFETTO DEL pH
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IDROLISI DELL’RNA CATALIZZATA DALL’RNasi
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REAZIONI A DUE SUBSTRATI
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Le reazioni a due substrati sono quasi sempre reazioni di trasferimento
A + B P + Q P-X + B P + B-X Il trasferimento può avvenire: tramite un singolo spostamento : REAZIONI SEQUENZIALI O A SINGOLO SPOSTAMENTO tramite un doppio spostamento: REAZIONI PING - PONG O A DOPPIO SPOSTAMENTO
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REAZIONI A SINGOLO SPOSTAMENTO (o sequenziali)
In questo tipo di reazioni entrambi i substrati devono legarsi all’enzima affinché possa avvenire la reazione 1) Meccanismo casuale 2) Meccanismo ordinato
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REAZIONI A DOPPIO SPOSTAMENTO (o ping-pong)
In questo tipo di reazioni un prodotto viene rilasciato prima che entrambi i substrati si siano legati
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Bi Bi sequenziale ordinato
Bi Bi sequenziale casuale Bi Bi a ping pong
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Bi Bi a ping pong
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Bi Bi sequenziale
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1) Meccanismo casuale 2) Meccanismo ordinato
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I meccanismi sequenziale e a ping pong possono essere differenziati
mediante studi di scambi isotopici (oltre che mediante studi cinetici) Esperimento in cui oltre all’enzima è presente solo uno dei due substrati (A) insieme al primo prodotto rilasciato, marcato radioattivamente (P*) Se il meccanismo è a ping-pong: (è assente !) (la reazione si blocca qui)
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E + P-X E-X + P (A) (F) P* + E-X E + P*-X (F) (A*) E E A P* P* A*
(è assente !) E + P-X E-X + P (A) (F) P* + E-X E + P*-X (F) (A*) E A P* E P* A* Si forma A* !!
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Se il meccanismo è sequenziale:
(è assente !) (è assente !) (è assente !) NON SI PUO’ FORMARE A* !!
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Esempio 1) Saccarosio fosforilasi
glucosio-fruttosio + fosfato glucosio-1-fosfato + fruttosio Esperimento di scambio isotopico: glucosio-fruttosio + fruttosio* glucosio-fruttosio* + fruttosio Il meccanismo è a ping pong 1) Maltosio fosforilasi glucosio-glucosio + fosfato glucosio-1-fosfato + glucosio Esperimento di scambio isotopico: glucosio-glucosio + glucosio* glucosio-glucosio + glucosio Il meccanismo è sequenziale
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